Gene Page:CREM

概括?
GeneID 1390
Symbol CREM
Synonyms CREM-2|ICER|hCREM-2
描述 cAMP responsive element modulator
参考 MIM:123812|HGNC：HGNC：2352|Ensembl:ENSG00000095794|HPRD:00444|Vega:OTTHUMG00000017953
Gene type protein-coding
Map location 10p11.21
Pascal p-value 0.098
Fetal beta -1.294
DMG 1（＃研究）
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
Gene set name Method of gene set 描述 Info
CV:PGCnp Genome-wide Association Study GWAS
DMG:Wockner_2014 Genome-wide DNA methylation analysis This dataset includes 4641 differentially methylated probes corresponding to 2929 unique genes between schizophrenia patients (n=24) and controls (n=24). 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 系统的烤焦ch in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 Click to show details

第一节遗传学和表观遗传学注释

@Differentially methylated gene

Probe Chromosome Position Nearest gene P (dis) beta（dis） FDR (dis) Study
cg09937316 10 35416239 CREM 1.801E-4 -0.196 0.034 DMG:Wockner_2014
CG23593958 10 35415966 CREM 5.046E-4 -0.267 0.047 DMG:Wockner_2014

@eQTL annotation

SNP ID Chromosome Position eGene Gene Entrez ID pvalue qvalue TSS distance eQTL type
RS16894557 chr6 28999825 CREM 1390 0.07 trans

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Not available

Gene expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

Top 10 positively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
PHF8 0.88 0.88
CHD6 0.88 0.89
NUP98 0.88 0.88
DIP2B 0.88 0.91
阿达 0.88 0.90
SSH1 0.88 0.90
KIAA0090 0.88 0.89
ARNT 0.87 0.88
TSC22D2 0.87 0.89
HIPK1 0.87 0.90
Top 10 negatively co-expressed genes
Gene Pearson's Correlation Spearman's Correlation
AF347015.21 -0.63 -0.72
MT-CO2 -0.63 -0.69
FXYD1 -0.62 -0.67
IFI27 -0.61 -0.68
AF347015.31 -0.61 -0.67
higd1b -0.60 -0.67
CXCL14 -0.59 -0.67
C1orf54 -0.59 -0.71
AF347015.8 -0.58 -0.65
IL32 -0.57 -0.66

V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
BIOCARTA DREAM PATHWAY 14 13 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFAT TFPATHWAY 47 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCR钙途径 29 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PICCALUGA ANGIOIMMUNOBLASTIC LYMPHOMA DN 136 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOLLMANN APOPTOSIS VIA CD40 UP 201 125 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GAZDA DIAMOND BLACKFAN ANEMIA MYELOID UP 30 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
加兹达钻石黑凡富贫血祖细胞 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PAX FOXO1融合的Davicioni目标 255 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARY CD5 TARGETS DN 431 263 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEURIG T CELL PROLYMPHOCYTIC LEUKEMIA DN 320 184 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BASAKI YBX1 TARGETS UP 290 177 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SMIRNOV CIRCULATING ENDOTHELIOCYTES IN CANCER UP 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS GREEN UP 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GARGALOVIC RESPONSE TO OXIDIZED PHOSPHOLIPIDS BLUE UP 136 80 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY UP 78 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION HSC UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP 157 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION SUSTAINDED IN ERYTHROCYTE UP 44 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN 240 171 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SENESE HDAC1 TARGETS UP 457 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1和HDAC2靶向 238 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM WT1 TARGETS DN 459 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graham CML划分与正常静止DN 95 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAHAM NORMAL QUIESCENT VS NORMAL DIVIDING UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
血清剥夺的Graessmann凋亡 552 347 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP 239 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP 1142 669 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MIDORIKAWA AMPLIFIED IN LIVER CANCER 55 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP 309 199 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIANG HEMATOPOIESIS STEM CELL NUMBER LARGE VS TINY DN 45 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPIELMAN LYMPHOBLAST EUROPEAN VS ASIAN DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NUYTTEN NIPP1 TARGETS UP 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI MYCN TARGETS WITH E BOX 795 478 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT DELAYED EARLY GENES 18 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMIT EGF RESPONSE 240 HELA 60 43 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG GLUCOSE DEPRIVATION DN 169 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NAKAJIMA EOSINOPHIL 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
hemin的addya红斑分化 73 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HEDVAT ELF4 TARGETS UP 12 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP 131 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Petrova Prox1靶向 28 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 16HR UP 225 139 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NATSUME RESPONSE TO INTERFERON BETA UP 71 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION UP 314 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
击倒卡路里限制肌肉DN 87 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARIADASON RESPONSE TO BUTYRATE CURCUMIN SULINDAC TSA 8 16 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee老化小脑DN 86 66 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染18小时 178 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 10HR UP 101 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL AND PROGENITOR 681 420 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 6HR UP 71 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 24HR UP 148 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gavin Foxp3目标集群P3 160 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG BOUND BY FOXP3 491 310 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHENG FOXP3 TARGETS UP 26 16 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WALLACE PROSTATE CANCER RACE UP 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mitsiades对aplidin的反应 439 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MATZUK SPERMATID DIFFERENTIATION 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk精子 114 77 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOQUEST STEM CELL DN 216 143 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN 546 362 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PODAR RESPONSE TO ADAPHOSTIN UP 147 98 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHEN HOXA5 TARGETS 9HR UP 223 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LINDSTEDT DENDRITIC CELL MATURATION A 67 52 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Liu Vav3前列腺致癌DN 17 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONO AML1 TARGETS DN 41 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ono foxp3目标 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤DN 267 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WINNEPENNINCKX MELANOMA METASTASIS UP 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UZONYI RESPONSE TO LEUKOTRIENE AND THROMBIN 37 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACOSTA PROLIFERATION INDEPENDENT MYC TARGETS DN 116 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
JOHNSTONE PARVB TARGETS 3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TORCHIA TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION UP 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
IKEDA MIR1 TARGETS UP 53 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PEDRIOLI MIR31 TARGETS DN 418 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY 1839 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因