基因页:CRH
概括?
基因 | 1392 |
象征 | CRH |
同义词 | CRF | CRH1 |
描述 | 皮质激素释放激素 |
参考 | MIM:122560|HGNC:HGNC:2355|ENSEMBL:ENSG00000147571|HPRD:07172|Vega:Otthumg00000164474 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q13 |
Pascal P值 | 0.153 |
胎儿β | -3.183 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 神经营养蛋白信号传导 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
表达 | 基因表达的荟萃分析 | p值:1.491 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG08215831 | 8 | 67090776 | CRH | 1.914E-4 | -0.412 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
CG19035496 | 8 | 67090792 | CRH | 2.024e-4 | -0.357 | 0.035 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS595174 | CHR18 | 23542566 | CRH | 1392 | 0.08 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CRH_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005184 | 神经肽激素活性 | 塔斯 | 轴突,突触,大脑,神经递质(GO期限:6) | 7867564 |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007268 | 突触传输 | 塔斯 | 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) | 7477348 |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 7867564 | |
去:0007611 | 学习或记忆 | 塔斯 | 7477348 | |
去:0007567 | 分娩 | 塔斯 | 7585095 | |
去:0007565 | 女性怀孕 | 塔斯 | 7585095 | |
去:0006704 | 糖皮质激素生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006954 | 炎症反应 | IEA | - | |
GO:0030325 | 肾上腺发育 | IEA | - | |
GO:0030324 | 肺发展 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005576 | 细胞外区域 | IEA | - | |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 7477348 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG长期抑郁症 | 70 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome B类2 Secralin家族受体 | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha的信号事件 | 121 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LI在肺癌中扩增 | 178 | 108 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lu衰老的脑dn | 153 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由HPV31 UP永生 | 84 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期DN | 165 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 210 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
MiR-200BC/429 | 59 | 65 | M8 | HSA-MIR-200B | uaauacugccugguaaugaugac |
HSA-MIR-200C | uaauacugccggguaaugaugg | ||||
HSA-MIR-429 | uaauacuguguguguguguaaaaaccgu |