概括
基因 1392
象征 CRH
同义词 CRF | CRH1
描述 皮质激素释放激素
参考 MIM:122560|HGNC:HGNC:2355|ENSEMBL:ENSG00000147571|HPRD:07172|Vega:Otthumg00000164474
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q13
Pascal P值 0.153
胎儿β -3.183
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 神经营养蛋白信号传导

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
表达 基因表达的荟萃分析 p值:1.491
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG08215831 8 67090776 CRH 1.914E-4 -0.412 0.035 DMG:Wockner_2014
CG19035496 8 67090792 CRH 2.024e-4 -0.357 0.035 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS595174 CHR18 23542566 CRH 1392 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005184 神经肽激素活性 塔斯 轴突,突触,大脑,神经递质(GO期限:6) 7867564
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007268 突触传输 塔斯 神经元,突触,神经递质(GO期限:6) 7477348
去:0007165 信号转导 塔斯 7867564
去:0007611 学习或记忆 塔斯 7477348
去:0007567 分娩 塔斯 7585095
去:0007565 女性怀孕 塔斯 7585095
去:0006704 糖皮质激素生物合成过程 IEA -
去:0006954 炎症反应 IEA -
GO:0030325 肾上腺发育 IEA -
GO:0030324 肺发展 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005576 细胞外区域 IEA -
去:0005625 可溶性部分 塔斯 7477348

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG长期抑郁症 70 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
GPCR的反应组信号传导 920 449 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome B类2 Secralin家族受体 88 58 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR下游信号传导 805 368 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome G alpha的信号事件 121 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GPCR配体结合 408 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI在肺癌中扩增 178 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lu衰老的脑dn 153 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由HPV31 UP永生 84 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期DN 165 106 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP,带有H3K4ME3和H3K27ME3 210 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
MiR-200BC/429 59 65 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu