SZGR2 - Beplay体育中心

概括?

GeneID	1400
Symbol	CRMP1
同义词	CRMP-1\|DPYSL1\|DRP-1\|DRP1\|ULIP-3
描述	折叠蛋白反应介质蛋白1
参考	MIM:602462\|HGNC：HGNC：2365\|Ensembl:ENSG00000072832\|HPRD：03913\|Vega:OTTHUMG00000125489
Gene type	protein-coding
地图位置	4p16.1
Pascal P值	0.27
Sherlock P值	0.98
Fetal beta	1.313
支持	细胞粘附和透射信号传导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS G2Cdb.human_clathrin G2Cdb.human_Synaptosome g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Darnell FMRP targets Potential synaptic genes

数据源中的基因

Gene set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	全基因组协会研究	GWAS
PMID:cooccur	高通量文献搜索	Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included.
文学	高通量文献搜索	与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症	Click to show details
GO_Annotation	Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations	Hits with neuro-related keywords: 3
网络	人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离	Contribution to shortest path in PPI network: 0.0069

第一节遗传学和表观遗传学注释

Section II. Transcriptome annotation

General gene expression (GTEx)

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
GO:0004157	dihydropyrimidinase activity	塔斯		8973361
GO:0005515	protein binding	新闻学会		15383276\|16169070
GO：0016810	hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds	IEA		-
Biological process	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0007399	神经系统的发展	塔斯	neurite (GO term level: 5)	8973361
GO:0006139	核苷酶，核苷，核苷酸和核酸代谢过程	塔斯		8973361
细胞分量	去的术语	Evidence	Neuro keywords	PubMed ID
去：0043025	cell soma	IEA	Axon，Dendrite（GO期限：4）	-
GO:0030425	dendrite	IEA	神经元，轴突，树突（GO期限：6）	-
GO:0005737	细胞质	IEA		-

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
AGR2	Ag2 \|GOB-4 \|hag-2 \|XAG-2	anterior gradient homolog 2 (Xenopus laevis)	两个杂交	BioGRID	16169070
aldh2	ALDH-E2 \| ALDHI \| ALDM \| MGC1806	aldehyde dehydrogenase 2 family (mitochondrial)	两个杂交	BioGRID	16169070
ARL15	arfrp2 \|FLJ20051	ADP-核糖基化因子样15	两个杂交	BioGRID	16169070
axin1	Axin \|MGC52315	axin 1	两个杂交	BioGRID	16169070
BTBD2	-	BTB (POZ) domain containing 2	两个杂交	BioGRID	16169070
CCDC106	HSU79303 \|ZNF581	包含106	两个杂交	BioGRID	16169070
CCL18	AMAC-1 \| AMAC1 \| CKb7 \| DC-CK1 \| DCCK1 \| MIP-4 \| PARC \| SCYA18	chemokine (C-C motif) ligand 18 (pulmonary and activation-regulated)	两个杂交	BioGRID	16169070
CCT7	CCT-ETA \| Ccth \| MGC110985 \| Nip7-1 \| TCP-1-eta	chaperonin containing TCP1, subunit 7 (eta)	两个杂交	BioGRID	16169070
CDK5RAP2	C48 \| Cep215 \| DKFZp686B1070 \| DKFZp686D1070 \| KIAA1633 \| MCPH3	CDK5 regulatory subunit associated protein 2	两个杂交	BioGRID	16169070
CDK5RAP3	C53 \| HSF-27 \| IC53 \| LZAP \| MST016 \| OK/SW-cl.114	CDK5 regulatory subunit associated protein 3	两个杂交	BioGRID	16169070
DPYSL2	CRMP2 \|DHPRP2 \|DRP-2 \|DRP2	dihydropyrimidinase-like 2	-	HPRD，Biogrid	12482610
EEF1D	EF-1D \| EF1D \| FLJ20897 \| FP1047	真核翻译伸长因子1增量（鸟嘌呤核苷酸交换蛋白）	两个杂交	BioGRID	16169070
EIF2S2	DKFZP686L18198 \|EIF2 \|EIF2B \|eif2beta \|MGC8508	eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta, 38kDa	两个杂交	BioGRID	16169070
EPN1	-	epsin 1	两个杂交	BioGRID	16169070
fas	ALPS1A \| APO-1 \| APT1 \| CD95 \| FAS1 \| FASTM \| TNFRSF6	Fas (TNF receptor superfamily, member 6)	两个杂交	BioGRID	16169070
FTH1	FHC \|fth \|fthl6 \|MGC104426 \|Pig15 \|plif	ferritin, heavy polypeptide 1	两个杂交	BioGRID	16169070
FUBP1	FBP \|fubp	far upstream element (FUSE) binding protein 1	两个杂交	BioGRID	16169070
FXR1	-	脆弱的X心理障碍，常染色体同源物1	两个杂交	BioGRID	16169070
HMGB1	DKFZp686A04236 \| HMG1 \| HMG3 \| SBP-1	high-mobility group box 1	两个杂交	BioGRID	16169070
hnrnph1	DKFZp686A15170 \| HNRPH \| HNRPH1 \| hnRNPH	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1 (H)	两个杂交	BioGRID	16169070
hnrnph3	2H9 \|FLJ34092 \|HNRPH3	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H3 (2H9)	两个杂交	BioGRID	16169070
hnrnpul1	E1B-AP5 \|e1bap5 \|FLJ12944 \|HNRPUL1	heterogeneous nuclear ribonucleoprotein U-like 1	两个杂交	BioGRID	16169070
HSPE1	CPN10 \| GROES \| HSP10	热冲击10KDA蛋白1（伴侣蛋白10）	两个杂交	BioGRID	16169070
KLHL20	khlhx \|Kleip \|klhlx \|RP3-383J4.3	类似Kelch的20（果蝇）	两个杂交	BioGRID	16169070
LRRC1	FLJ10775 \| FLJ11834 \| LANO \| dJ523E19.1	leucine rich repeat containing 1	两个杂交	BioGRID	16169070
LSM2	C6orf28 \| G7b \| YBL026W \| snRNP	LSM2 homolog, U6 small nuclear RNA associated (S. cerevisiae)	两个杂交	BioGRID	16169070
mobkl3	2C4D \| CGI-95 \| MGC12264 \| MOB1 \| MOB3 \| PREI3	MOB1，MPS一个粘合激酶激活剂样3（酵母）	两个杂交	BioGRID	16169070
MRPS12	MPR-S12 \|MT-RPS12 \|rpms12 \|RPS12 \|RPSM12	线粒体核糖体蛋白S12	两个杂交	BioGRID	16169070
NAT9	DKFZp564C103 \| EBSP	N-acetyltransferase 9 (GCN5-related, putative)	两个杂交	BioGRID	16169070
NDUFV2	-	NADH dehydrogenase (ubiquinone) flavoprotein 2, 24kDa	两个杂交	BioGRID	16169070
NVL	-	nuclear VCP-like	两个杂交	BioGRID	16169070
PAFAH1B3	-	血小板激活因子乙酰水合酶，同工型IB，伽马亚基29KDA	两个杂交	BioGRID	16169070
PFN1	-	profilin 1	两个杂交	BioGRID	16169070
PMF1	-	多胺调节因子1	两个杂交	BioGRID	16169070
PPP1R8	ARD-1 \| ARD1 \| NIPP-1 \| NIPP1 \| PRO2047	protein phosphatase 1, regulatory (inhibitor) subunit 8	两个杂交	BioGRID	16169070
PSMD11	MGC3844 \|rpn6 \|S9 \|P44.5	蛋白酶体（Prosome，大蛋白）26S亚基，非ATPase，11	两个杂交	BioGRID	16169070
RGL2	HKE1.5 \|ke1.5 \|rab2l	拉尔鸟嘌呤核苷酸解离刺激器样2	两个杂交	BioGRID	16169070
Rhoa	ARH12 \|arha \|Rho12 \|RHOH12	RAS同源基因家族，成员	Phenotypic Suppression	BioGRID	12482610
RPA2	repa2 \|RPA32	复制蛋白A2, 32 kda	两个杂交	BioGRID	16169070
RTN4	ASY \| NI220/250 \| NOGO \| NOGO-A \| NOGOC \| NSP \| NSP-CL \| Nbla00271 \| Nbla10545 \| Nogo-B \| Nogo-C \| RTN-X \| RTN4-A \| RTN4-B1 \| RTN4-B2 \| RTN4-C	网状4	两个杂交	BioGRID	16169070
SAT1	DC21 \| KFSD \| SAT \| SSAT \| SSAT-1	spermidine/spermine N1-acetyltransferase 1	两个杂交	BioGRID	16169070
SEPHS1	MGC4980 \|SELD \|SPS \|SPS1	硒磷酸合成酶1	两个杂交	BioGRID	16169070
SERPINB9	CAP-3 \| CAP3 \| PI9	serpin peptidase inhibitor, clade B (ovalbumin), member 9	两个杂交	BioGRID	16169070
SNRPG	MGC117317 \| SMG	小怒clear ribonucleoprotein polypeptide G	两个杂交	BioGRID	16169070
TFG	FLJ36137 \|TF6 \|trkt3	TRK-fused gene	两个杂交	BioGRID	16169070
TK1	TK2	胸苷激酶1，可溶性	两个杂交	BioGRID	16169070
Trip13	16e1bp	甲状腺激素受体相互作用13	两个杂交	BioGRID	16169070
ube2b	E2-17KDA \|HHR6B \|HR6B \|rad6b \|UBC2	泛素结合酶E2B（RAD6同源物）	两个杂交	BioGRID	16169070
ZNF24	KOX17 \| RSG-A \| ZNF191 \| ZSCAN3 \| Zfp191	zinc finger protein 24	两个杂交	BioGRID	16169070

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
Reactome发育生物学	396	292	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE	251	188	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME CRMPS IN SEMA3A SIGNALING	14	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME SEMAPHORIN INTERACTIONS	68	53	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP	332	228	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC1靶向DN	260	143	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANHARANTA UTERINE FIBROID UP	45	26	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G	238	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn	800	473	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GUENTHER GROWTH SPHERICAL VS ADHERENT UP	21	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer前列腺开发12小时DN	57	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schaeffer Sox9在前列腺发展中的目标DN	45	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BENPORATH ES 1	379	235	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标	1038	678	该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES	1118	744	该途径中的所有SZGR 2.0基因
pomeroy髓母细胞瘤预后	47	30	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PETROVA ENDOTHELIUM LYMPHATIC VS BLOOD UP	131	87	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合DN的Rorie目标	30	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE DN	1237	837	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROWNE HCMV INFECTION 48HR DN	504	323	该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向	566	371	该途径中的所有SZGR 2.0基因
AMUNDSON GAMMA RADIATION RESISTANCE	20	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ACEVEDO LIVER CANCER WITH H3K27ME3 DN	228	114	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MOOTHA PGC	420	269	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Goldrath抗原反应	346	192	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP	756	494	该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关	682	440	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KIM ALL DISORDERS CALB1 CORR UP	548	370	该途径中的所有SZGR 2.0基因
verhaak胶质母细胞瘤pro	177	132	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE VIA TP53 GROUP D	280	158	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PASINI SUZ12 TARGETS DN	315	215	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman vincristine抗性B	38	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因

Section VI. microRNA annotation

miRNA family	目标位置			mirna id	miRNA seq
miRNA family	UTR start	UTR end	Match method	mirna id	miRNA seq
miR-329	167	173	m8	HSA-MIR-329^脑	aacacaccugguaaccucuuu

SZ: miRNAs which differentially expressed in brain cortex of schizophrenia patients comparing with control samples using microarray. Click这里查看与SZ相关的miRNA列表。
Brain: miRNAs which are expressed in brain based on miRNA microarray expression studies. Click这里to see the list of brain related miRNAs.

基因页：CRMP1