基因页:CTCFL
概括?
基因 | 140690 |
象征 | CTCFL |
同义词 | Boris | CT27 | CTCF-T | HMGB1L1 | DJ579F20.2 |
描述 | CCCTC结合因子类似 |
参考 | MIM:607022|HGNC:HGNC:16234|ENSEMBL:ENSG00000124092|HPRD:09512|Vega:Otthumg0000000032829 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20q13.31 |
Pascal P值 | 0.122 |
胎儿β | 0.286 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | 染色质重塑基因 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS7370564 | 0 | CTCFL | 140690 | 0.04 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CTCFL_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Koyama Sema3b靶向DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌20q12 Q13 Amplicon | 149 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在成纤维细胞中韦伯甲基化的ICP | 22 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ceribelli启动子不活跃,受NFY的约束 | 44 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |