基因页：cry1
Summary？
| GeneID | 1407 |
| 象征 | cry1 |
| 同义词 | PHLL1 |
| 描述 | 加密颗粒昼夜节律1 |
| 参考 | MIM：601933|HGNC：HGNC：2384|ENSEMBL：ENSG00000008405|HPRD：09050|Vega:OTTHUMG00000170005 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12q23-Q24.1 |
| Pascal P值 | 0.057 |
| Sherlock P值 | 0.048 |
| 胎儿β | 1.304 |
| 主持人 | 皮质 Frontal Cortex BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11924592 | CHR3 | 146371577 | cry1 | 1407 | 0.09 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
| 去：0003677 | DNA结合 | 塔斯 | 9801304 | |
| 去：0003913 | DNA光溶解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| GO：0016829 | 裂解酶活性 | IEA | - | |
| 去：0008020 | G蛋白偶联的光感受器活性 | 塔斯 | 8909283 | |
| Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO:0006355 | 调节转录，DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
| GO:0006350 | 转录 | IEA | - | |
| 去：0006281 | DNA修复 | IEA | - | |
| 去：0007623 | 昼夜节律 | 塔斯 | 10217146 | |
| GO：0018298 | 蛋白质 - 肉眼团连接 | IEA | - | |
| GO：0050896 | response to stimulus | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005634 | 核 | IEA | - | |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005739 | 线粒体 | 塔斯 | 9801304 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| arntl | BMAL1 |bmal1c |JAP3 |MGC47515 |mop3 |pasd3 |抽动|Bhlhe5 | aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator-like | - | HPRD，Biogrid | 10531061 |
| CBLB | DKFZp686J10223 | DKFZp779A0729 | DKFZp779F1443 | FLJ36865 | FLJ41152 | Nbla00127 | RNF56 | CAS-BR-M（鼠）生态逆转录病毒转化序列B | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
| cry1 | PHLL1 | 加密1（光溶解酶样） | 生化活动 | Biogrid | 17073458 |
| CSNK1E | HCKIE | MGC10398 | 酪蛋白激酶1，Epsilon | - | HPRD | 11875063 |
| KRTAP4-12 | kap4.12 |KRTAP4.12 | 角蛋白相关蛋白4-12 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
| MDFI | I-MF |I-MFA | Myod家族抑制剂 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
| per1 | MGC88021 |per |里格|hper | 时期同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 10531061 |
| PER2 | fasps |KIAA0347 | 时期同源物2（果蝇） | - | HPRD | 10428031|10531061 |
| PER2 | fasps |KIAA0347 | 时期同源物2（果蝇） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Two-hybrid |
Biogrid | 10531061|11533252 |
| PER3 | Gig13 | 时期同源物3（果蝇） | - | HPRD | 10428031 |
| PLSCR1 | mmtra1b | 磷脂cramblase 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
| 永恒 | FLJ12640 |FLJ20714 |蒂姆|tim1 |htim | 永恒的同源物（果蝇） | - | HPRD | 10428031 |
| traf2 | MGC：45012 |陷阱|陷阱3 | TNF受体相关因子2 | Two-hybrid | Biogrid | 16189514 |
V.途径注释
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| miR-361 | 312 | 318 | M8 | HSA-MIR-361脑 | uuaucagaaucuccagggguac |
| mir-381 | 184 | 190 | 1a | HSA-MIR-381 | uauacaagggcaagcucucugu |
| mir-448 | 624 | 631 | 1A，M8 | HSA-MIR-448 | uugcauauguaggauguccccau |
| miR-496 | 219 | 225 | 1a | HSA-MIR-496 | Auuacauggccaaucuc |