概括
基因 1428
象征 克里姆
同义词 DFNA40 | THBP
描述 水晶素
参考 MIM:123740|HGNC:HGNC:2418|ENSEMBL:ENSG00000103316|HPRD:08831|Vega:Otthumg0000000090707
基因类型 蛋白质编码
地图位置 16p12.2
Pascal P值 0.393
Sherlock P值 0.557
胎儿β -0.61
DMG 1(#研究)
主持人 梭子基底神经节
支持 结构可塑性
COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01775

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06816254 16 21287038 克里姆 1.065E-4 0.586 0.028 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS2005532 16 21191611 克里姆 ENSG00000103316.6 1.40594E-6 0.01 122793 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
ITGB2 0.66 0.64
mpeg1 0.66 0.59
CSF1R 0.64 0.65
CTSS 0.63 0.65
BIN2 0.62 0.56
FCGR2A 0.62 0.59
HCK 0.62 0.57
FCGR3A 0.62 0.62
Cybb 0.62 0.62
laptm5 0.61 0.60
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RP9P -0.27 -0.36
SNHG12 -0.25 -0.28
Sycp3 -0.25 -0.22
AC120053.1 -0.24 -0.26
C8orf59 -0.24 -0.29
ACSM3 -0.23 -0.24
AC087071.1 -0.23 -0.24
FAM159B -0.23 -0.33
AC135724.1 -0.23 -0.22
RPL9 -0.22 -0.26

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003824 催化活性 IEA -
去:0005488 捆绑 IEA -
去:0008473 鸟氨酸环氨基氨基氨酶活性 塔斯 1384048
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008152 代谢过程 IEA -
去:0007601 视觉感知 塔斯 1384048
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005737 细胞质 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Basaki YBX1靶向DN 384 230 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌 1821年 933 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN 25 18 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 555 346 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 412 249 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chen LVAD支持失败的心脏DN 42 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
安倍的内耳 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh tamoxifen抗性 578 341 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Verhaak胶质母细胞瘤神经 129 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向DN 553 343 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因