基因页:克里姆
概括?
基因 | 1428 |
象征 | 克里姆 |
同义词 | DFNA40 | THBP |
描述 | 水晶素 |
参考 | MIM:123740|HGNC:HGNC:2418|ENSEMBL:ENSG00000103316|HPRD:08831|Vega:Otthumg0000000090707 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 16p12.2 |
Pascal P值 | 0.393 |
Sherlock P值 | 0.557 |
胎儿β | -0.61 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 梭子基底神经节 |
支持 | 结构可塑性 COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01775 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06816254 | 16 | 21287038 | 克里姆 | 1.065E-4 | 0.586 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS2005532 | 16 | 21191611 | 克里姆 | ENSG00000103316.6 | 1.40594E-6 | 0.01 | 122793 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CRYM_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
ITGB2 | 0.66 | 0.64 |
mpeg1 | 0.66 | 0.59 |
CSF1R | 0.64 | 0.65 |
CTSS | 0.63 | 0.65 |
BIN2 | 0.62 | 0.56 |
FCGR2A | 0.62 | 0.59 |
HCK | 0.62 | 0.57 |
FCGR3A | 0.62 | 0.62 |
Cybb | 0.62 | 0.62 |
laptm5 | 0.61 | 0.60 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RP9P | -0.27 | -0.36 |
SNHG12 | -0.25 | -0.28 |
Sycp3 | -0.25 | -0.22 |
AC120053.1 | -0.24 | -0.26 |
C8orf59 | -0.24 | -0.29 |
ACSM3 | -0.23 | -0.24 |
AC087071.1 | -0.23 | -0.24 |
FAM159B | -0.23 | -0.33 |
AC135724.1 | -0.23 | -0.22 |
RPL9 | -0.22 | -0.26 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003824 | 催化活性 | IEA | - | |
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0008473 | 鸟氨酸环氨基氨基氨酶活性 | 塔斯 | 1384048 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - | |
去:0007601 | 视觉感知 | 塔斯 | 1384048 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Basaki YBX1靶向DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hernandez异常有丝分裂由DOCETACEL 2NM DN | 25 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Taci的Moreaux多发性骨髓瘤 | 412 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chen LVAD支持失败的心脏DN | 42 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
安倍的内耳 | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
道格拉斯BMI1靶向 | 566 | 371 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh tamoxifen抗性 | 578 | 341 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Verhaak胶质母细胞瘤神经 | 129 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |