概括
基因 143
象征 PARP4
同义词 adprtl1 | artd4 | parp-4 | parpl | ph5p | vault3 | vparp | vwa5c | p193
描述 聚(ADP-核糖)聚合酶家族成员4
参考 MIM:607519|HGNC:HGNC:271|ENSEMBL:ENSG00000102699|HPRD:09598|Vega:Otthumg0000000016582
基因类型 蛋白质编码
地图位置 13Q11
Pascal P值 0.189
胎儿β 0.343
DMG 1(#研究)

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG10904715 13 25115837 PARP4 3.29e-8 -0.013 9.87e-6 DMG:JAFFE_2016


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
KCNC2 0.82 0.76
RASSF5 0.81 0.84
ankrd34c 0.81 0.85
NPTX2 0.80 0.85
TRPM2 0.80 0.84
SSTR3 0.80 0.88
pthlh 0.80 0.84
GPR123 0.80 0.78
anxa6 0.80 0.86
SGPP2 0.79 0.82
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
RBMX2 -0.44 -0.63
FADS2 -0.43 -0.49
tubb2b -0.43 -0.59
traf4 -0.43 -0.61
RPL23A -0.43 -0.60
GTF3C6 -0.42 -0.50
KIAA1949 -0.42 -0.48
carhsp1 -0.42 -0.64
pde9a -0.41 -0.58
SEMA4B -0.41 -0.48

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0003950 NAD+ ADP-核糖基转移酶活性 nas 10644454
去:0003677 DNA结合 塔斯 10100603
GO:0016757 转移酶活性,转移糖基团 IEA -
GO:0019899 酶结合 艾达 15169895
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006464 蛋白质修饰过程 塔斯 10100603
去:0006471 蛋白氨基酸ADP-核糖基化 nas 10644454
去:0008219 细胞死亡 小鬼 12140175
去:0006281 DNA修复 nas 12101391
去:0006810 运输 nas 11855821
去:0006954 炎症反应 小鬼 12123754
GO:0042493 对药物的反应 nas 11291045
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005622 细胞内 IEA -
去:0005634 nas 10644454
去:0005737 细胞质 IEA -
去:0030529 核糖核蛋白复合物 nas 11479319

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg基础切除修复 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 391 222 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
奥斯曼膀胱癌 404 246 该途径中的所有SZGR 2.0基因
在喉癌中放大了耶维宁 40 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
AIYAR COBRA1靶向 39 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meinhold卵巢癌低级 19 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌 358 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN 584 395 该途径中的所有SZGR 2.0基因
唱机转移基质DN 54 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kauffmann DNA修复基因 230 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shepard BMYB Morpholino Up 205 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
der ifn beta响应 102 67 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FAELT B CLL具有VH重排DN 48 26 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染10小时DN 56 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染14小时DN 298 200 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21靶向DN 31 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王顺铂反应和XPC DN 228 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN 287 208 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染6小时DN 160 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性4 307 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
级结肠癌 871 505 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshioka肝癌早期复发DN 65 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌的王转移 15 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smad2或Smad3的Koinuma目标 824 528 该途径中的所有SZGR 2.0基因