基因页:PARP4
概括?
基因 | 143 |
象征 | PARP4 |
同义词 | adprtl1 | artd4 | parp-4 | parpl | ph5p | vault3 | vparp | vwa5c | p193 |
描述 | 聚(ADP-核糖)聚合酶家族成员4 |
参考 | MIM:607519|HGNC:HGNC:271|ENSEMBL:ENSG00000102699|HPRD:09598|Vega:Otthumg0000000016582 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 13Q11 |
Pascal P值 | 0.189 |
胎儿β | 0.343 |
DMG | 1(#研究) |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG(n = 108),而在Bonferroni调整后的P <0.05时,其中136个对照。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG10904715 | 13 | 25115837 | PARP4 | 3.29e-8 | -0.013 | 9.87e-6 | DMG:JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/PARP4_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
KCNC2 | 0.82 | 0.76 |
RASSF5 | 0.81 | 0.84 |
ankrd34c | 0.81 | 0.85 |
NPTX2 | 0.80 | 0.85 |
TRPM2 | 0.80 | 0.84 |
SSTR3 | 0.80 | 0.88 |
pthlh | 0.80 | 0.84 |
GPR123 | 0.80 | 0.78 |
anxa6 | 0.80 | 0.86 |
SGPP2 | 0.79 | 0.82 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
RBMX2 | -0.44 | -0.63 |
FADS2 | -0.43 | -0.49 |
tubb2b | -0.43 | -0.59 |
traf4 | -0.43 | -0.61 |
RPL23A | -0.43 | -0.60 |
GTF3C6 | -0.42 | -0.50 |
KIAA1949 | -0.42 | -0.48 |
carhsp1 | -0.42 | -0.64 |
pde9a | -0.41 | -0.58 |
SEMA4B | -0.41 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003950 | NAD+ ADP-核糖基转移酶活性 | nas | 10644454 | |
去:0003677 | DNA结合 | 塔斯 | 10100603 | |
GO:0016757 | 转移酶活性,转移糖基团 | IEA | - | |
GO:0019899 | 酶结合 | 艾达 | 15169895 | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006464 | 蛋白质修饰过程 | 塔斯 | 10100603 | |
去:0006471 | 蛋白氨基酸ADP-核糖基化 | nas | 10644454 | |
去:0008219 | 细胞死亡 | 小鬼 | 12140175 | |
去:0006281 | DNA修复 | nas | 12101391 | |
去:0006810 | 运输 | nas | 11855821 | |
去:0006954 | 炎症反应 | 小鬼 | 12123754 | |
GO:0042493 | 对药物的反应 | nas | 11291045 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内 | IEA | - | |
去:0005634 | 核 | nas | 10644454 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0030529 | 核糖核蛋白复合物 | nas | 11479319 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg基础切除修复 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chemnitz对前列腺素E2 DN的反应 | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌腔与基础DN | 455 | 304 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
奥斯曼膀胱癌 | 404 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在喉癌中放大了耶维宁 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
AIYAR COBRA1靶向 | 39 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meinhold卵巢癌低级 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gruetzmann胰腺癌 | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲DN | 584 | 395 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
唱机转移基质DN | 54 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kauffmann DNA修复基因 | 230 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shepard BMYB Morpholino Up | 205 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
der ifn beta响应 | 102 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FAELT B CLL具有VH重排DN | 48 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染10小时DN | 56 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染14小时DN | 298 | 200 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CUI TCF21靶向DN | 31 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
葡萄病毒感染DN的Debiasi凋亡DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染6小时DN | 160 | 101 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 | 863 | 514 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
级结肠癌 | 871 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshioka肝癌早期复发DN | 65 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
乳腺癌的王转移 | 15 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smad2或Smad3的Koinuma目标 | 824 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |