基因页：VTI1A

概括？
基因 143187
象征 VTI1A
同义词 MMDS3 | MVTI1 | VTI1RP2 | VTI1-RP2
描述 通过与T-Snares 1A相互作用的囊泡运输
参考 MIM：614316|HGNC：HGNC：17792|ENSEMBL：ENSG00000151532|HPRD：18290|Vega：Otthumg0000000019063
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q25.2
Pascal P值 0.082
胎儿β 0.233
DMG 1（＃研究）
支持 细胞内贩运

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 2
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关的关键字的命中：1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG03530074 10 114536223 VTI1A 4.57E-5 -0.652 0.021 DMG：Wockner_2014
CG18903373 10 114469566 VTI1A 2.104E-4 0.282 0.035 DMG：Wockner_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005484 SNAP受体活性 艾达 15215310
去：0008565 蛋白质转运蛋白活性 nas -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0006886 细胞内蛋白转运 IEA -
GO：0016192 囊泡介导的运输 nas -
GO：0042147 逆行运输，内体向高尔基 艾达 15215310
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0031201 军鼓复合物 塔斯 神经元，突触（GO期限：6） 15215310
去：0016020 膜 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
囊泡运输中的kegg圈圈相互作用 38 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
THUM收缩心力衰竭DN 244 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn 800 473 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Xu GH1自分泌目标 268 157 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kondo EZH2目标 245 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
fontaine乳头状甲状腺癌 66 38 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-137 2598 2604 M8 HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-15/16/195/424/497 3145 3151 M8 HSA-MIR-15A脑 uagcagcacauaugguugug
HSA-MIR-16脑 uagcagcacguaaauauuggcg
HSA-MIR-15B脑 uagcagcacaucaugguuaca
HSA-MIR-195SZ uagcagaaaaauauuggc
HSA-MIR-424 Cagcagcaauucauguuuugaa
HSA-MIR-497 cagcagcacacuguguuugu
mir-155 3337 3343 1a HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-186 3089 3095 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-19 3077 3084 1A，M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
MiR-200BC/429 3113 3119 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-203.1 3108 3114 1a HSA-MIR-203 ugaaauguuuaggaccacuag
mir-214 3143 3149 M8 HSA-MIR-214脑 acagcaggcacagacaggcag
mir-223 3190 3196 1a HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-24 2794 2800 M8 HSA-MIR-24SZ uggcucucagagcaggaagag
mir-326 3206 3212 M8 HSA-MIR-326 ccucugggcccuccag
mir-330 2778 2784 M8 HSA-MIR-330脑 GCAAAGCACGGCCUGCAGAGA
mir-375 2829 2835 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga