基因页:CSF1R
概括?
基因 | 1436年 |
象征 | CSF1R |
同义词 | C-FMS | CD115 | CSF-1R | CSFR | FIM2 | FMS | HDLS | M-CSF-R |
描述 | 菌落刺激因子1受体 |
参考 | MIM:164770|HGNC:HGNC:2433|ENSEMBL:ENSG00000182578|HPRD:01269|Vega:Otthumg00000130050 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 5Q32 |
Pascal P值 | 0.676 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0032 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01718 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00459 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CSF1R_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0005011 | 巨噬细胞刺激因子受体活性 | 塔斯 | 8981357 | |
去:0004872 | 受体活性 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
GO:0016740 | 转移酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007169 | 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 | IEA | - | |
去:0006468 | 蛋白氨基酸磷酸化 | IEA | - | |
去:0007165 | 信号转导 | 塔斯 | 8981357 | |
去:0008283 | 细胞增殖 | 塔斯 | 8981357 | |
去:0007275 | 多细胞生物发育 | 塔斯 | 8981357 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005886 | 质膜 | 塔斯 | 2421165 | |
去:0005887 | 质膜的积分 | 塔斯 | 2421165 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CBL | C-CBL |CBL2 |RNF55 | CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 | - | HPRD,Biogrid | 11847211 |
CSF1 | MCSF |MGC31930 | 菌落刺激因子1(巨噬细胞) | - | HPRD,Biogrid | 2408759|8355686 |
Fyn | MGC45350 |SLK |syn | Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 | - | HPRD,Biogrid | 7681396 |
grap2 | gads |grap-2 |grb2l |grblg |网格|grpl |grbx |grf40 |蒙娜|p38 | 与GRB2相关的衔接蛋白2 | 重构的复合物 | Biogrid | 9857184 |
GRB2 | 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 | 生长因子受体结合蛋白2 | - | HPRD,Biogrid | 8262059|9178909 |9380408 |
inpp5d | MGC104855 |MGC142140 |MGC142142 |船|Ship1 |SIP-145 |HP51CN | 肌醇聚磷酸5-磷酸酶,145KDA | CSF1R(C-FMS)与INPP5D相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的CSF1R和INPP5D之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15735664 |
inppl1 | Ship2 | 肌醇聚磷酸磷酸酶样1 | CSF1R(C-FMS)与Inppl1(Ship-2)相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的CSF1R和INPPL1之间的相互作用进行建模的。 | 绑定 | 15735664 |
林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | - | HPRD,Biogrid | 7636265 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | - | HPRD,Biogrid | 8947469 |
PIK3R1 | grb1 |P85 |p85-alpha | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) | CSF1R(C-FMS)与PIK3R1(PI3'-K)相互作用。他的相互作用是在未指定物种的CSF1R和PIK3R1之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 15735664 |
PIK3R2 | P85B |P85 |p85-beta | 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基2(beta) | - | HPRD | 1334406 |
rasa1 | CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP | Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 | - | HPRD,Biogrid | 2172781 |
SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | - | HPRD,Biogrid | 10022833|11297560 |
SOCS1 | 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 | 抑制细胞因子信号传导1 | SOCS1与CSF1-R相互作用。这种相互作用是在小鼠蛋白之间证明的相互作用上建模的。 | 绑定 | 10022833 |
SOCS3 | atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 | 抑制细胞因子信号传导3 | - | HPRD,Biogrid | 12133942 |
src | ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC | V-SRC肉瘤(Schmidt-Ruppin A-2)病毒癌基因同源物(Avian) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7681396 |
thoc5 | C22orf19 |fmip |PK1.3 |FSAP79 | 综合体5 | - | HPRD | 10597251 |
是的1 | HST441 |p61-yes |是|c-yes | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源1 | - | HPRD,Biogrid | 7681396 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 | 267 | 161 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG内吞作用 | 183 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG造血细胞谱系 | 88 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta CBL途径 | 13 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta ETS途径 | 18 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID PTP1B途径 | 52 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID TCPTP途径 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID AVB3整合素途径 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PID CMYB途径 | 84 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨型性白血病DN | 116 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甲状腺癌 | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1慢性LOF DN | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Markey RB1急性lof | 215 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BCR ABL1融合的klein目标 | 45 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rashi对电离辐射6的响应6 | 84 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN | 164 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN | 514 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
洛佩兹MBD目标 | 957 | 597 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ferrando Tal1邻居 | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖 | 61 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lenaour树突状细胞成熟DN | 128 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN | 63 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ramalho茎DN | 74 | 55 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN | 20 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙齿龋齿DN | 245 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
江式下丘脑老化 | 47 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
麦克拉克兰牙科龋齿 | 253 | 147 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1靶向DN | 543 | 317 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向 | 601 | 369 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
张乳腺癌祖细胞DN | 145 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Qi Plasmacytoma Up | 259 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vilimas Notch1靶向DN | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Ichiba移植与宿主疾病35D UP | 131 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 | 76 | 46 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
维萨拉衰老的淋巴细胞向上 | 10 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染4小时DN | 254 | 158 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rattenbacher由Celf1绑定 | 467 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-155 | 763 | 770 | 1A,M8 | HSA-MIR-155 | uuaaugcuaaucgugauagggg |
mir-22 | 594 | 601 | 1A,M8 | HSA-MIR-22脑 | Aagcugccaguugaagaacugu |
mir-34/449 | 192 | 199 | 1A,M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc |