概括
基因 1436年
象征 CSF1R
同义词 C-FMS | CD115 | CSF-1R | CSFR | FIM2 | FMS | HDLS | M-CSF-R
描述 菌落刺激因子1受体
参考 MIM:164770|HGNC:HGNC:2433|ENSEMBL:ENSG00000182578|HPRD:01269|Vega:Otthumg00000130050
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5Q32
Pascal P值 0.676

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00459
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0005011 巨噬细胞刺激因子受体活性 塔斯 8981357
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0005524 ATP结合 IEA -
GO:0016740 转移酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007169 跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号传导途径 IEA -
去:0006468 蛋白氨基酸磷酸化 IEA -
去:0007165 信号转导 塔斯 8981357
去:0008283 细胞增殖 塔斯 8981357
去:0007275 多细胞生物发育 塔斯 8981357
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005886 质膜 塔斯 2421165
去:0005887 质膜的积分 塔斯 2421165

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

互动者 别名b 官方全名b 实验 资源 PubMed ID
CBL C-CBL |CBL2 |RNF55 CAS-BR-M(鼠)生态逆转录病毒转化序列 - HPRD,Biogrid 11847211
CSF1 MCSF |MGC31930 菌落刺激因子1(巨噬细胞) - HPRD,Biogrid 2408759|8355686
Fyn MGC45350 |SLK |syn Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 - HPRD,Biogrid 7681396
grap2 gads |grap-2 |grb2l |grblg |网格|grpl |grbx |grf40 |蒙娜|p38 与GRB2相关的衔接蛋白2 重构的复合物 Biogrid 9857184
GRB2 灰烬|EGFRBP-GRB2 |Grb3-3 |MST084 |MSTP084 生长因子受体结合蛋白2 - HPRD,Biogrid 8262059|9178909
|9380408
inpp5d MGC104855 |MGC142140 |MGC142142 |船|Ship1 |SIP-145 |HP51CN 肌醇聚磷酸5-磷酸酶,145KDA CSF1R(C-FMS)与INPP5D相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的CSF1R和INPP5D之间的相互作用进行建模的。 绑定 15735664
inppl1 Ship2 肌醇聚磷酸磷酸酶样1 CSF1R(C-FMS)与Inppl1(Ship-2)相互作用。这种相互作用是基于未指定物种的CSF1R和INPPL1之间的相互作用进行建模的。 绑定 15735664
林恩 FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 - HPRD,Biogrid 7636265
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) - HPRD,Biogrid 8947469
PIK3R1 grb1 |P85 |p85-alpha 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基1(alpha) CSF1R(C-FMS)与PIK3R1(PI3'-K)相互作用。他的相互作用是在未指定物种的CSF1R和PIK3R1之间的相互作用上建模的。 绑定 15735664
PIK3R2 P85B |P85 |p85-beta 磷酸肌醇3-激酶,调节亚基2(beta) - HPRD 1334406
rasa1 CM-AVM |cmavm |DKFZP434N071 |差距|pkws |拉萨|rasgap |P120GAP |P120RASGAP Ras P21蛋白激活剂(GTPase激活蛋白)1 - HPRD,Biogrid 2172781
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 - HPRD,Biogrid 10022833|11297560
SOCS1 顺式1 |cish1 |jab |SOCS-1 |SSI-1 |SSI1 |提示3 抑制细胞因子信号传导1 SOCS1与CSF1-R相互作用。这种相互作用是在小鼠蛋白之间证明的相互作用上建模的。 绑定 10022833
SOCS3 atod4 |顺式3 |cish3 |MGC71791 |SOCS-3 |SSI-3 |SSI3 抑制细胞因子信号传导3 - HPRD,Biogrid 12133942
src ASV |src1 |C-SRC |P60-SRC V-SRC肉瘤(Schmidt-Ruppin A-2)病毒癌基因同源物(Avian) 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 7681396
thoc5 C22orf19 |fmip |PK1.3 |FSAP79 综合体5 - HPRD 10597251
是的1 HST441 |p61-yes |是|c-yes V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒癌基因同源1 - HPRD,Biogrid 7681396


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG内吞作用 183 132 该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG造血细胞谱系 88 60 该途径中的所有SZGR 2.0基因
癌症中的KEGG途径 328 259 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta CBL途径 13 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Biocarta ETS途径 18 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID PTP1B途径 52 40 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID TCPTP途径 43 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID AVB3整合素途径 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID CMYB途径 84 61 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨型性白血病DN 116 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甲状腺癌 443 294 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1慢性LOF DN 118 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Markey RB1急性lof 215 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BCR ABL1融合的klein目标 45 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rashi对电离辐射6的响应6 84 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
洛佩兹MBD目标 957 597 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ferrando Tal1邻居 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖 61 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HOXA9和MEIS1 DN的HESS目标 77 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lenaour树突状细胞成熟DN 128 90 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HADDAD T淋巴细胞和NK祖细胞DN 63 41 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho茎DN 74 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nielsen Gist和滑膜肉瘤DN 20 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 该途径中的所有SZGR 2.0基因
罗德韦尔老化的肾脏 487 303 该途径中的所有SZGR 2.0基因
江式下丘脑老化 47 31 该途径中的所有SZGR 2.0基因
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1靶向DN 543 317 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向 601 369 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞DN 145 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Qi Plasmacytoma Up 259 185 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vilimas Notch1靶向DN 20 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ichiba移植与宿主疾病35D UP 131 79 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nakayama软组织肿瘤PCA1向上 76 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
维萨拉衰老的淋巴细胞向上 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Browne HCMV感染4小时DN 254 158 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rattenbacher由Celf1绑定 467 251 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-155 763 770 1A,M8 HSA-MIR-155 uuaaugcuaaucgugauagggg
mir-22 594 601 1A,M8 HSA-MIR-22 Aagcugccaguugaagaacugu
mir-34/449 192 199 1A,M8 HSA-MIR-34A uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc