Summary
GeneID 1439
Symbol CSF2RB
同义词 CD131|CDw131|IL3RB|IL5RB|SMDP5
描述 菌落刺激因子2受体β公共亚基
参考 MIM:138981|HGNC:HGNC:2436|ENSEMBL:ENSG00000100368|HPRD:00739|Vega:Otthumg00000150546
基因类型 蛋白质编码
地图位置 22q13.1
Pascal P值 0.09
胎儿β -0.125

Gene in Data Sources
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASdb Genome-wide Association Studies 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
协会 组合的优势比方法(Sun等。2008), association studies 2 链接到Szgene
Literature 高通量文献搜索 Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias 点击显示详细信息
网络 Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network PPI网络中最短路径的贡献:0.0294

Section I. Genetics and epigenetics annotation


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

No co-expressed genes in brain regions


第三节。基因本体论注释

Molecular function 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0004872 受体活性 TAS 9410898
去:0004914 白介素-5受体活性 TAS 9410898
去:0004912 白介素-3受体活性 TAS 9410898
Biological process 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007165 signal transduction nas 1702217
GO:0007585 respiratory gaseous exchange TAS 9410898
GO:0019221 细胞因子介导的信号通路 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0016020 membrane IEA -
GO:0030526 粒细胞巨噬细胞刺激因子受体复合物 TAS 9410898

Section IV. Protein-protein interaction annotation

Interactors 别名b 官方全名b 实验 Source PubMed ID
CSF2 GMCSF |MGC131935 |MGC138897 colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) - HPRD 2645577|8278375
CSF2RA CD116 |CDW116 |CSF2R |CSF2RAX |CSF2RARY |CSF2RX |CSF2RY |GM-CSF-R-Alpha |GMCSFR |GMR | MGC3848 | MGC4838 菌落刺激因子2受体,α,低亲和力(粒细胞巨噬细胞) - HPRD 9211889
CSF2RB CD131 |CDW131 |IL3RB |IL5RB 菌落刺激因子2受体,β,低亲和力(粒细胞巨噬细胞) - HPRD,Biogrid 11207369
EPOR MGC138358 erythropoietin receptor - HPRD 12488507
GNB2L1 Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 - HPRD,Biogrid 10490850
IL3 IL-3 |MCGF |MGC79398 |MGC79399 |多-CSF 白介素3(刺激因子,多个) 重构的复合物 Biogrid 8649415
IL3 IL-3 |MCGF |MGC79398 |MGC79399 |多-CSF 白介素3(刺激因子,多个) - HPRD 9278420
IL5RA CD125 |CDW125 |HSIL5R3 |IL5R |MGC26560 白介素5受体,α 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 9516124
JAK2 JTK10 Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) 亲和力捕获 - 韦斯特恩
体内
重构的复合物
Biogrid 7527392|7775438
|10772872
林恩 FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 - HPRD 7636265|9973406
林恩 FLJ26625 |JTK8 V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 体内
蛋白质肽
Biogrid 7636265|9973406
MAD2L1 HSMAD2 |MAD2 MAD2有丝分裂逮捕不足1(酵母) - HPRD,Biogrid 11551900
MAD2L1 HSMAD2 |MAD2 MAD2有丝分裂逮捕不足1(酵母) MAD2与CSF2RB互动。这种相互作用是建立在小鼠MAD2和人CSFR2B之间的相互作用上的。 绑定 11551900
Prkcb MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 蛋白激酶C,β 亲和力捕获 - 韦斯特恩 Biogrid 10490850
PTPN11 BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 - HPRD,Biogrid 9162089
PTPN6 HCP | HCPH | HPTP1C | PTP-1C | SH-PTP1 | SHP-1 | SHP-1L | SHP1 protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 - HPRD,Biogrid 8246974
SHC1 FLJ26504 |SHC |SHCA SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 - HPRD,Biogrid 10477722|10704825
YWHAZ KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 - HPRD,Biogrid 8278375|10477722


Section V. Pathway annotation

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG细胞因子细胞因子受体相互作用 267 161 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kegg凋亡 88 62 All SZGR 2.0 genes in this pathway
KEGG JAK STAT SIGNALING PATHWAY 155 105 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta IL3途径 15 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Biocarta坏路 26 23 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID GMCSF途径 37 31 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL5途径 14 11 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PID IL3途径 27 19 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ILS的Reactome信号传导 107 86 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome IL 3 5和GM CSF信号传导 43 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome IL受体SHC信号传导 27 21 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME IL 2 SIGNALING 41 34 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Reactome免疫系统 933 616 All SZGR 2.0 genes in this pathway
REACTOME CYTOKINE SIGNALING IN IMMUNE SYSTEM 270 204 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Schuetz乳腺癌导管侵入性 351 230 All SZGR 2.0 genes in this pathway
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 All SZGR 2.0 genes in this pathway
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 All SZGR 2.0 genes in this pathway
runx1 runx1t1融合HSC DN的TONKS目标 187 115 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PAPASPYRIDONOS UNSTABLE ATEROSCLEROTIC PLAQUE UP 52 36 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Graham正常静止与正常分裂DN 87 49 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王食道癌与正常 121 72 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Martoriati MDM4靶向胎儿肝DN 514 319 All SZGR 2.0 genes in this pathway
JAZAG TGFB1 SIGNALING UP 108 69 All SZGR 2.0 genes in this pathway
PUJANA ATM PCC NETWORK 1442 892 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Benporath Myc Max目标 775 494 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Galindo对肠毒素的免疫反应 85 67 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤CD1和CD2 DN 51 32 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Zhan多发性骨髓瘤LB 48 28 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BASSO CD40 SIGNALING DN 68 44 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YAGI AML FAB MARKERS 191 131 All SZGR 2.0 genes in this pathway
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙齿龋齿DN 245 144 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦克拉克兰牙科龋齿 253 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
kyng DNA损坏紫外线 62 43 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Kyng DNA损伤DN 195 135 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stearman肿瘤场效应 36 22 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Stearman肺癌早期与晚期DN 61 39 All SZGR 2.0 genes in this pathway
海勒被甲基化沉默 282 183 All SZGR 2.0 genes in this pathway
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Marzec IL2发出信号 115 80 All SZGR 2.0 genes in this pathway
麦凯布(McCabe)由HOXC6绑定 469 239 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Boquest干细胞DN 216 143 All SZGR 2.0 genes in this pathway
王肿瘤的侵入性DN 210 128 All SZGR 2.0 genes in this pathway
YOSHIMURA MAPK8 TARGETS UP 1305 895 All SZGR 2.0 genes in this pathway
池子侵入性乳腺癌 288 168 All SZGR 2.0 genes in this pathway
由MYC约束 1103 714 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Browne HCMV感染1小时DN 222 147 All SZGR 2.0 genes in this pathway
马顿人维甲酸的反应 857 456 All SZGR 2.0 genes in this pathway
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 All SZGR 2.0 genes in this pathway
BAKKER FOXO3 TARGETS UP 61 41 All SZGR 2.0 genes in this pathway
ALTEMEIER响应与机械VENTILAT有限合伙人ION 128 81 All SZGR 2.0 genes in this pathway