基因页:CSF2RB
Summary?
GeneID | 1439 |
Symbol | CSF2RB |
同义词 | CD131|CDw131|IL3RB|IL5RB|SMDP5 |
描述 | 菌落刺激因子2受体β公共亚基 |
参考 | MIM:138981|HGNC:HGNC:2436|ENSEMBL:ENSG00000100368|HPRD:00739|Vega:Otthumg00000150546 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22q13.1 |
Pascal P值 | 0.09 |
胎儿β | -0.125 |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASdb | Genome-wide Association Studies | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
协会 | 组合的优势比方法(Sun等。2008), association studies | 2 | 链接到Szgene |
Literature | 高通量文献搜索 | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | 点击显示详细信息 |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | PPI网络中最短路径的贡献:0.0294 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CSF2RB_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
Footnote:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
No co-expressed genes in brain regions
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
GO:0004872 | 受体活性 | TAS | 9410898 | |
去:0004914 | 白介素-5受体活性 | TAS | 9410898 | |
去:0004912 | 白介素-3受体活性 | TAS | 9410898 | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007165 | signal transduction | nas | 1702217 | |
GO:0007585 | respiratory gaseous exchange | TAS | 9410898 | |
GO:0019221 | 细胞因子介导的信号通路 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0016020 | membrane | IEA | - | |
GO:0030526 | 粒细胞巨噬细胞刺激因子受体复合物 | TAS | 9410898 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
CSF2 | GMCSF |MGC131935 |MGC138897 | colony stimulating factor 2 (granulocyte-macrophage) | - | HPRD | 2645577|8278375 |
CSF2RA | CD116 |CDW116 |CSF2R |CSF2RAX |CSF2RARY |CSF2RX |CSF2RY |GM-CSF-R-Alpha |GMCSFR |GMR | MGC3848 | MGC4838 | 菌落刺激因子2受体,α,低亲和力(粒细胞巨噬细胞) | - | HPRD | 9211889 |
CSF2RB | CD131 |CDW131 |IL3RB |IL5RB | 菌落刺激因子2受体,β,低亲和力(粒细胞巨噬细胞) | - | HPRD,Biogrid | 11207369 |
EPOR | MGC138358 | erythropoietin receptor | - | HPRD | 12488507 |
GNB2L1 | Gnb2-rs1 | H12.3 | HLC-7 | PIG21 | RACK1 | 鸟嘌呤核苷酸结合蛋白(G蛋白),β多肽2类样1 | - | HPRD,Biogrid | 10490850 |
IL3 | IL-3 |MCGF |MGC79398 |MGC79399 |多-CSF | 白介素3(刺激因子,多个) | 重构的复合物 | Biogrid | 8649415 |
IL3 | IL-3 |MCGF |MGC79398 |MGC79399 |多-CSF | 白介素3(刺激因子,多个) | - | HPRD | 9278420 |
IL5RA | CD125 |CDW125 |HSIL5R3 |IL5R |MGC26560 | 白介素5受体,α | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9516124 |
JAK2 | JTK10 | Janus激酶2(蛋白酪氨酸激酶) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 体内 重构的复合物 |
Biogrid | 7527392|7775438 |10772872 |
林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | - | HPRD | 7636265|9973406 |
林恩 | FLJ26625 |JTK8 | V-YES-1 Yamaguchi肉瘤病毒相关的癌基因同源物 | 体内 蛋白质肽 |
Biogrid | 7636265|9973406 |
MAD2L1 | HSMAD2 |MAD2 | MAD2有丝分裂逮捕不足1(酵母) | - | HPRD,Biogrid | 11551900 |
MAD2L1 | HSMAD2 |MAD2 | MAD2有丝分裂逮捕不足1(酵母) | MAD2与CSF2RB互动。这种相互作用是建立在小鼠MAD2和人CSFR2B之间的相互作用上的。 | 绑定 | 11551900 |
Prkcb | MGC41878 |pkc-beta |PKCB |prkcb1 |PRKCB2 | 蛋白激酶C,β | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10490850 |
PTPN11 | BPTP3 | CFC | MGC14433 | NS1 | PTP-1D | PTP2C | SH-PTP2 | SH-PTP3 | SHP2 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 11 | - | HPRD,Biogrid | 9162089 |
PTPN6 | HCP | HCPH | HPTP1C | PTP-1C | SH-PTP1 | SHP-1 | SHP-1L | SHP1 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 | - | HPRD,Biogrid | 8246974 |
SHC1 | FLJ26504 |SHC |SHCA | SHC(SRC同源性2结构域)转化蛋白1 | - | HPRD,Biogrid | 10477722|10704825 |
YWHAZ | KCIP-1 |MGC111427 |MGC126532 |MGC138156 | 酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,Zeta多肽 | - | HPRD,Biogrid | 8278375|10477722 |