基因页：CPNE8

概括？
基因 144402
象征 CPNE8
同义词 -
描述 美洲8
参考 HGNC：HGNC：23498|ENSEMBL：ENSG00000139117|HPRD：16747|Vega：Otthumg00000169396
基因类型 蛋白质编码
地图位置 12Q12
Pascal P值 0.064
Sherlock P值 0.028
胎儿β -0.695
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：Nishioka_2013 全基因组DNA甲基化分析 作者研究了来自18例第一期精神分裂症（FESZ）和15个正常对照的18例外周血细胞中DNA的甲基化谱。 1
表达 基因表达的荟萃分析 p价值：2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG20857455 12 39300142 CPNE8 -0.035 0.86 DMG：Nishioka_2013

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS7882576 Chrx 38501487 CPNE8 144402 0.08 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Fulcher炎症反应凝集素与LPS DN 463 290 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌先进与早期 175 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿色 23 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
剑麻结肠直肠腺瘤DN 291 176 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王对贝克索烯DN的响应 29 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten EZH2靶向 1037 673 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤CD1 vs CD2 UP 66 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血晚期祖先 544 307 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CUI TCF21目标2 DN 830 547 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的相邻组织向上 863 514 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng胶质母细胞瘤可塑性 250 168 该途径中的所有SZGR 2.0基因
惠特菲尔德细胞周期S 162 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化 570 339 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ikeda mir30目标 116 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林乳腺干细胞向上 489 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang 1类由EGF瞬时诱导 516 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-124.1 1197 1203 1a HSA-MIR-124A UUAAGGCACGCGGUGAAUGCCA
mir-137 489 495 1a HSA-MIR-137 uauugcuuaagaauacgcguag
mir-151 905 911 1a HSA-MIR-151脑 Acuagacugaagcucuugagg
mir-186 1181 1187 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
mir-188 924 931 1A，M8 HSA-MIR-188 cucccuugcaugguggggu
mir-204/211 923 929 M8 HSA-MIR-204脑 Uucccuuugucauccuaugccu
HSA-MIR-211 uucccuuugucauccuucgccu
mir-218 302 309 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-221/222 865 872 1A，M8 HSA-MIR-221脑 agcuacauugucugugggggguc
HSA-MIR-222脑 agcuacaucuggcuacugggucuc
mir-224 1391 1397 M8 HSA-MIR-224 caagucacuaguguguccuuua
mir-25/32/92/363/367 468 474 1a HSA-MIR-25脑 Cauugcacuugucucggucuga
HSA-MIR-32 uauugcacauacuaaguugc
HSA-MIR-92 uauugcacuugucccgcgcug
HSA-MIR-367 Aauugcacuuuagcaaugga
HSA-MIR-92BSZ uauugcacucgucccgcgcuc
mir-29 62 68 M8 HSA-MIR-29ASZ uagcaccaucugaaaucgguu
HSA-MIR-29BSZ uagcaccauuugaaaucaguguu
HSA-MIR-29CSZ uagcaccauuugaaaucggu
mir-299-5p 156 162 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-30-5p 376 383 1A，M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-375 1188 1194 1a HSA-MIR-375 uuuguucguucggcucgcguga
mir-493-5p 1125 1131 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-539 96 102 1a HSA-MIR-539 ggagaauuauccuuggugugu