基因页：lysmd4

概括？
基因 145748
象征 lysmd4
同义词 -
描述 包含4的Lysm域
参考 HGNC：HGNC：26571|Ensembl：ENSG00000183060|HPRD：08153|Vega：Otthumg00000149853
基因类型 蛋白质编码
地图位置 15Q26.3
Pascal P值 0.224
Sherlock P值 0.099
DEG P值 DEG：SANDERS_2014：DS1_P = 0.151：DS1_BETA = 0.038200：DS2_P = 1.37E-01：DS2_BETA = 0.076：DS2_FDR = 3.60E-011
胎儿β 0.155
DMG 1（＃研究）
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
小脑
皮质
额叶皮质BA9
海马
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
迈尔斯的顺式和跨性别
元

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DEG：Sanders_2013 微阵列 使用微阵列在413例和446例对照中使用微阵列（LCLS）上的微阵列进行全基因组基因表达谱。
DMG：Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG18550509 15 100273145 lysmd4 1.38e-5 -0.271 0.014 DMG：Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12898636 CHR15 100282240 lysmd4 145748 0.18 顺式
RS7923495 Chr10 83175767 lysmd4 145748 0.14 反式
RS17097683 Chr10 83176233 lysmd4 145748 0.14 反式
RS11203155 CHR21 43170140 lysmd4 145748 0.16 反式
RS35747287 15 100273607 lysmd4 ENSG00000183060.11 1.22468E-6 0.03 159 gtex_brain_putamen_basal
RS11631604 15 100273617 lysmd4 ENSG00000183060.11 1.97252E-6 0.03 149 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌15Q26 AMPLICON 22 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伊万诺娃造血早期祖先 532 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mirlet7a3 DN的Brueckner目标 78 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP与H3K4Me3 718 401 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SPI1和FLI1的Juban目标 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因