基因页:adra1d
概括?
基因 | 146 |
象征 | adra1d |
同义词 | adra1 | adra1a | adra1r | alpha1 | dar | dj779e11.2 |
描述 | adrenoceptor alpha 1d |
参考 | MIM:104219|HGNC:HGNC:280|ENSEMBL:ENSG00000171873|HPRD:00079|Vega:Otthumg0000000031779 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 20p13 |
Pascal P值 | 0.221 |
Sherlock P值 | 0.234 |
胎儿β | -0.747 |
主持人 | 额叶皮质BA9 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
ADT:SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS6139439 | CHR20 | 4475429 | adra1d | 146 | 0.06 | 顺式 | ||
RS6139470 | CHR20 | 4521341 | adra1d | 146 | 0.18 | 顺式 | ||
RS2065704 | CHR20 | 4719343 | adra1d | 146 | 0.15 | 顺式 | ||
RS2065705 | CHR20 | 4719406 | adra1d | 146 | 0.05 | 顺式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ADRA1D_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg钙信号通路 | 178 | 134 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG神经活性配体受体相互作用 | 272 | 195 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg血管平滑肌收缩 | 115 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胃胃CREB信号传导途径通过PKC和MAPK | 205 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GPCR的反应组信号传导 | 920 | 449 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome A1级Rhodopsin喜欢受体 | 305 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胺配体结合受体 | 38 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha Q信号事件 | 184 | 116 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome G alpha1213信号传导事件 | 74 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR下游信号传导 | 805 | 368 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome GPCR配体结合 | 408 | 246 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标 | 259 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杨Bcl3靶向 | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |