基因页：CSNK2B

概括?
基因ID 1460
Symbol CSNK2B
同义词 CK2B|CK2N|CSK2B|G5A
描述 酪蛋白激酶2β
参考 MIM:115441|HGNC：HGNC：2460|Ensembl:ENSG00000204435|HPRD:00278|Vega：Otthumg00000177888
基因type protein-coding
地图位置 6p21.3
Pascal P值 1E-12
Sherlock P值 1.106E-6
eGene 迈尔斯的顺式和跨性别
Meta
支持 细胞内信号转导

数据源中的基因
基因set name 基因组方法 描述 Info
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR：0.033
网络 人蛋白蛋白质相互作用网络中核心基因的最短路径距离 Contribution to shortest path in PPI network: 0.4231

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID Chromosome Position eGene 基因Entrez ID PVALUE qvalue TSS distance eQTL type
RS4854166 chr2 3297005 CSNK2B 1460 0.15 trans
RS16836102 chr4 4716366 CSNK2B 1460 0.14 trans
rs16869851 chr4 20690056 CSNK2B 1460 0.19 trans
RS1578978 chr8 118196802 CSNK2B 1460 0.11 trans

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

无法使用

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

Top co-expressed genes in brain regions

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
apoe 0.91 0.96
AC011427.1 0.90 0.94
METRN 0.87 0.94
TLCD1 0.86 0.94
S100A16 0.85 0.92
HSD17B14 0.85 0.92
PLA2G5 0.84 0.93
AIFM3 0.84 0.90
RAMP1 0.83 0.92
ifi27 0.83 0.90
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
Zranb1 -0.76 -0.84
Arih2 -0.75 -0.83
UBP1 -0.75 -0.81
C6orf168 -0.75 -0.82
TERF2 -0.75 -0.86
par -0.74 -0.79
rasa1 -0.74 -0.80
NFX1 -0.74 -0.85
RNASEN -0.74 -0.87
HEATR5B -0.74 -0.85

Section III. Gene Ontology annotation

Molecular function 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0008605 protein kinase CK2 regulator activity IEA -
GO:0008605 protein kinase CK2 regulator activity NAS 2666134
GO:0005515 protein binding IEA -
GO:0004674 蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性 塔斯 1856204
GO:0019904 蛋白质域特异性结合 新闻学会 11984006
GO:0016301 激酶活性 IEA -
GO:0042802 相同的蛋白质结合 新闻学会 10094392
Biological process 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
GO:0016055 Wnt受体信号通路 IEA -
去：0007165 signal transduction 塔斯 2513884
细胞分量 去的术语 Evidence Neuro keywords PubMed ID
去：0005956 蛋白激酶CK2复合物 IEA -
去：0005956 蛋白激酶CK2复合物 NAS 2666134

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors Aliases B Official full name B Experimental 资源 PubMed ID
APC BTPS2 |DP2 |DP2.5 |dp3 |GS 腺瘤息肉大肠杆菌 Affinity Capture-Western BioGRID 11972058
ARAF a-raf |araf1 |pks2 |rafa1 v-raf murine sarcoma 3611 viral oncogene homolog - HPRD，Biogrid 9042965
ATF1 ews-atf1 |FUS/ATF-1 |Treb36 激活转录因子1 Reconstituted Complex BioGRID 9685505
BRCA1 BRCAI | BRCC1 | IRIS | PSCP | RNF53 乳腺癌1，早发 Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 10403822
BRCA1 BRCAI | BRCC1 | IRIS | PSCP | RNF53 乳腺癌1，早发 BRCA1通过与CSNK2B的物理相互作用被酪蛋白激酶2磷酸化 BIND 10403822
BTF3 BETA-NAC | BTF3a | BTF3b | NACB 基本转录因子3 - HPRD，Biogrid 10094400
CD163 M130 |MM130 CD163分子 - HPRD，Biogrid 11298324
CDC25B - cell division cycle 25 homolog B (S. pombe) - HPRD 12527891
CDC34 E2-CDC34 |UBC3 |ube2r1 cell division cycle 34 homolog (S. cerevisiae) - HPRD，Biogrid 11546811
CDKN1A CAP20 | CDKN1 | CIP1 | MDA-6 | P21 | SDI1 | WAF1 | p21CIP1 cyclin-dependent kinase inhibitor 1A (p21, Cip1) - HPRD，Biogrid 10679299
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide CK2-BETA亚基（PDB ID：1JWH_D）和CK2-Alpha子单位（PDB ID：1JWH_A）之间的相互作用。 BIND 11092945|11574463
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide Interaction between CK2-beta subunit (PDB ID: 1JWH_C) and CK2-alpha subunit (PDB ID: 1JWH_B). BIND 11092945|11574463
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide CK2-BETA亚基（PDB ID：1JWH_D）和CK2-Alpha子单位（PDB ID：1JWH_B）之间的相互作用。 BIND 11092945|11574463
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide - HPRD，Biogrid 9188720|9571630
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide Interaction between CK2-beta subunit (PDB ID: 1JWH_C) and CK2-alpha subunit (PDB ID: 1JWH_A). BIND 11092945|11574463
CSNK2A1 CK2A1 |CKII casein kinase 2, alpha 1 polypeptide CK2-Alpha亚基与CK2-BETA亚基相互作用。 BIND 7768894
CSNK2A2 CK2A2 | CSNK2A1 | FLJ43934 casein kinase 2, alpha prime polypeptide - HPRD，Biogrid 9571630
CSNK2A2 CK2A2 | CSNK2A1 | FLJ43934 casein kinase 2, alpha prime polypeptide CK2-alpha' subunit interacts with CK2-beta subunit. BIND 7768894
CSNK2B CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 casein kinase 2, beta polypeptide CK2-beta subunit interacts with another copy of itself. BIND 7768894
CSNK2B CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 casein kinase 2, beta polypeptide - HPRD，Biogrid 9188720|9571630
CSNK2B CK2B |CK2N |CSK2B |g5a |MGC138222 |MGC138224 casein kinase 2, beta polypeptide Interaction between CK2-beta subunit (PDB ID: 1JWH_D) and CK2-beta subunit (PDB ID: 1JWH_C). BIND 11092945|11574463
EIF2S2 DKFZP686L18198 |EIF2 |EIF2B |eif2beta |MGC8508 eukaryotic translation initiation factor 2, subunit 2 beta, 38kDa EIF2BETA与CK2BETA相互作用。 BIND 12901717
FAF1 CGI-03 |FLJ37524 |HFAF1S |ubxd12 |ubxn3a |HFAF1 Fas (TNFRSF6) associated factor 1 - HPRD，Biogrid 10094392|11378439
|11713579
FGF1 AFGF |ECGF |ECGF-beta |ECGFA |ECGFB |fgf-alpha |fgfa |glio703 |HBGF1 成纤维细胞生长因子1（酸性） - HPRD，Biogrid 12145206
FGF2 BFGF |FGFB |HBGF-2 成纤维细胞生长因子2（基本） Reconstituted Complex BioGRID 12145206
FIBP fgfibp |FIBP-1 fibroblast growth factor (acidic) intracellular binding protein - HPRD 12145206
GADD45GIP1 CKBBP2 | CRIF1 | MGC4667 | MGC4758 | PLINP-1 | PRG6 | Plinp1 growth arrest and DNA-damage-inducible, gamma interacting protein 1 - HPRD，Biogrid 11710515
HNRNPA2B1 DKFZP779B0244 |FLJ22720 |hnrnpa2 |HNRNPB1 |HNRPA2 |HNRPA2B1 |HNRPB1 |RNPA2 |SNRPB1 异质核核糖核蛋白A2/B1 Reconstituted Complex BioGRID 10381337
IRF1 IRF-1 |3月 干扰素调节因子1 CK2-beta interacts with IRF-1 promoter. BIND 15893730
LYN FLJ26625 |JTK8 v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral related oncogene homolog 两个杂交 BioGRID 14667819
LYST CHS | CHS1 lysosomal trafficking regulator - HPRD，Biogrid 11984006
mageb2 DAM6 | MAGE-XP-2 | MGC26438 黑色素瘤抗原家族B，2 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
MAPK14 CSBP1 | CSBP2 | CSPB1 | EXIP | Mxi2 | PRKM14 | PRKM15 | RK | SAPK2A | p38 | p38ALPHA mitogen-activated protein kinase 14 - HPRD 10747897
MBD4 MED1 甲基-CPG结合结构域蛋白4 两个杂交 BioGRID 14667819
MCRS1 ICP22BP | INO80Q | MCRS2 | MSP58 | P78 微球蛋白1 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
NCF1 FLJ79451 |NCF1A |noxo2 |SH3PXD1A |p47phox neutrophil cytosolic factor 1 两个杂交 BioGRID 11485312
NCF1C SH3PXD1C neutrophil cytosolic factor 1C pseudogene - HPRD 11485312
NOLC1 KIAA0035 | NOPP130 | NOPP140 | NS5ATP13 | P130 nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1 - HPRD，Biogrid 9013635
PIN1 DOD | UBL5 peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1 - HPRD 11940573
PRKCZ PKC-Zeta |PKC2 protein kinase C, zeta - HPRD，Biogrid 10764587
prnp ascr |CD230 |CJD |GSS |MGC26679 |prip |prp |PRP27-30 |PRP33-35C |PRPC | prion prion蛋白 PrPc interacts with CSNK2B (CK2 beta) albeit weakly. This interaction was modeled on a demonstrated interaction between bovine PrPc and human CSNK2B (CK2 beta). BIND 11062072
RNF7 CKBBP1 | ROC2 | SAG ring finger protein 7 Reconstituted Complex
两个杂交		 BioGRID 11710515
RNPS1 E5.1 |MGC117332 RNA结合蛋白S1，富含丝氨酸的结构域 亲和力捕获ms BioGRID 17353931
RPL41 - ribosomal protein L41 - HPRD 11710515
RPL41 - ribosomal protein L41 - HPRD 9299532|11710515
RPL5 MGC117339 |MSTP030 核糖体蛋白L5 - HPRD 8806611|9042965
|9738462|10491318
RPL5 MGC117339 |MSTP030 核糖体蛋白L5 两个杂交 BioGRID 8806611|9042965
|11710515|14667819
RPS6KB1 PS6K | S6K | S6K1 | STK14A | p70(S6K)-alpha | p70-S6K | p70-alpha ribosomal protein S6 kinase, 70kDa, polypeptide 1 Affinity Capture-Western
Reconstituted Complex		 BioGRID 16895915
SHMT1 CSHMT | MGC15229 | MGC24556 | SHMT 丝氨酸羟基转移酶1（可溶性） - HPRD 10549165
SHMT2 glya |SHMT serine hydroxymethyltransferase 2 (mitochondrial) - HPRD 10549165
SNCAIP MGC39814 | SYPH1 突触核蛋白，α相互作用蛋白 CK2B interacts with Synphilin-1. BIND 14645218
TERF2 TRBF2 | TRF2 端粒重复结合因子2 CK2-β与TAF7启动子相互作用。 BIND 15893730
top2b TOPIIB | top2beta topoisomerase (DNA) II beta 180kDa - HPRD，Biogrid 11710515
TP53 FLJ92943 |LFS1 |trp53 |p53 tumor protein p53 - HPRD 10214938
Znhit1 CG1I |Znfn4a1 zinc finger, HIT type 1 - HPRD 14667819


V.途径注释

Pathway name Pathway size ＃szgr 2.0基因 Info
kegg wnt信号通路 151 112 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg粘附交界处 75 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg thright连接点 134 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NFKAPPAB ATYPICAL PATHWAY 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID DNA PK途径 16 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID Ecadherin新生AJ途径 39 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID ALK1 PATHWAY 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID p38 alpha beta下游途径 38 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME AXON GUIDANCE 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
L1反应组信号转导 34 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌Znf217扩增DN 335 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ginestier乳腺癌20Q13扩增DN 180 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
RHEIN ALL GLUCOCORTICOID THERAPY DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP 117 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BARIS THYROID CANCER DN 59 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Grasemann视网膜细胞瘤，具有6p扩增 14 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
DEN INTERACT WITH LCA5 26 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PENG RAPAMYCIN RESPONSE DN 245 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zhan多发性骨髓瘤亚组 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
SESTO RESPONSE TO UV C1 72 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
CHENG RESPONSE TO NICKEL ACETATE 45 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
3月SON BOUND BY E2F4 UNSTIMULATED 728 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO HOUSEKEEPING GENES 389 245 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 17 181 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金所有障碍OLIGODENDROCYTE NUMBER CORR UP 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HIRSCH CELLULAR TRANSFORMATION SIGNATURE UP 242 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标3 DN 918 550 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

miRNA family 目标位置 mirna id miRNA seq
UTR start UTR end Match method
mir-378 58 64 1a hsa-miR-378 cuccugacuccaggucugugu