基因页：VCAN
概括?
| 基因 | 1462 |
| 象征 | VCAN |
| 同义词 | cspg2 | ervr | ghap | pg-m | wgn | wgn1 |
| 描述 | versican |
| 参考 | MIM：118661|HGNC：HGNC：2464|Ensembl：ENSG0000000038427|HPRD：00340|Vega:OTTHUMG00000131321 |
| 基因type | protein-coding |
| 地图位置 | 5q14.3 |
| Pascal P值 | 0.037 |
| Sherlock P值 | 8.207E-4 |
| Fetal beta | 3.395 |
| DMG | 1（＃研究） |
| eGene | Cerebellum 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2Cdb.human_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSENSUS g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因set name | 基因组方法 | 描述 | Info |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG:Jaffe_2016 | Genome-wide DNA methylation analysis | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 1 |
| Expression | 基因表达的荟萃分析 | P价值：3.122 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM table
DNM table| 基因 | Chromosome | Position | Ref | Alt | Transcript | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | Trait | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| VCAN | chr5 | 82837297 | A | G | NM_001126336 NM_001164097 NM_001164098 NM_004385 |
. . . . |
内含子 沉默的 内含子 沉默的 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
差异甲基化基因
| 探测 | Chromosome | Position | 最近的基因 | P (dis) | beta（dis） | FDR (dis) | Study |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cg00328900 | 5 | 82769097 | VCAN | 2.6e-8 | -0.022 | 8.31E-6 | DMG:Jaffe_2016 |
EQTL注释
| SNP ID | Chromosome | Position | eGene | 基因Entrez ID | PVALUE | qvalue | TSS distance | eQTL type |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS11035999 | Chr11 | 40679588 | VCAN | 1462 | 0.08 | trans |
Section II. Transcriptome annotation
基因ral gene expression (GTEx)
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
大脑区域没有共表达基因
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0005529 | sugar binding | IEA | - | |
| GO:0005540 | 透明质酸结合 | 塔斯 | 2583089 | |
| GO:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
| GO:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | 塔斯 | 2583089 | |
| GO:0007507 | heart development | IEA | - | |
| 去：0008037 | 细胞识别 | 塔斯 | 2583089 | |
| 去：0007275 | 多细胞生物发育 | 塔斯 | 2583089 | |
| 细胞分量 | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005576 | extracellular region | IEA | - | |
| GO:0005578 | 蛋白质细胞外基质 | 塔斯 | 2583089 |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| Interactors | Aliases B | Official full name B | Experimental | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| 一个罐头 | AGC1 |Agcan |CSPG1 |CSPGCP |MSK16 |塞克 | Aggrecan | Affinity Capture-Western Reconstituted Complex |
BioGRID | 12888576 |
| CCL2 | GDCF -2 | HC11 | HSMCR30 | MCAF | MCP-1 | MCP1 | MGC9434 | SCYA2 | SMC-CF | 趋化因子（C-C基序）配体2 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| CCL20 | CKb4 | LARC | MIP-3a | MIP3A | SCYA20 | ST38 | 趋化因子（C-C基序）配体20 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| CCL21 | 6ckine |CKB9 |ECL |MGC34555 |Scya21 |SLC |TCA4 | 趋化因子（C-C基序）配体21 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| CCL5 | D17S136E |MGC17164 |rantes |scya5 |SISD |TCP228 | 趋化因子（C-C基序）配体5 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| CCL8 | HC14 |MCP-2 |MCP2 |Scya10 |Scya8 | 趋化因子（C-C基序）配体8 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| CD44 | CDW44 | CSPG8 | ECMR-III | HCELL | IN | LHR | MC56 | MDU2 | MDU3 | MGC10468 | MIC4 | MUTCH-I | Pgp1 | CD44molecule (Indian blood group) | - | HPRD，Biogrid | 10950950 |
| CXCL10 | C7 |ifi10 |INP10 |IP-10 |Scyb10 |CRG-2 |GIP-10 |MOB-1 | 趋化因子（C-X-C基序）配体10 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| FBLN1 | fbln | 斐杜蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 10400671 |
| FBLN2 | - | 斐杜蛋白2 | - | HPRD，Biogrid | 11038354 |
| FBN1 | fbn |质量|MFS1 |八月|SGS |WMS | 纤维蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 11726670 |
| Hapln1 | CRTL1 | 透明质酸和蛋白聚糖链接蛋白1 | - | HPRD，Biogrid | 12888576 |
| ITGA4 | CD49D | IA4 | MGC90518 | 整合素，α4（抗原CD49D，alpha 4的VLA-4受体亚基） | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
| ITGB1 | CD29 | FNRB | GPIIA | MDF2 | MSK12 | VLA-BETA | VLAB | 整合素，β1（纤连蛋白受体，β多肽，抗原CD29包括MDF2，MSK12） | - | HPRD，Biogrid | 11805102 |
| PLA2G2A | MOM1 | PLA2 | PLA2B | PLA2L | PLA2S | PLAS1 | sPLA2 | 磷脂酶A2，IIA组（血小板，滑液） | - | HPRD，Biogrid | 8824283|9848887 |
| 卖 | CD62L |Lam-1 |LAM1 |lecam1 |lnhr |LSEL |lyam1 |Leu-8 |lyam-1 |plnhr | TQ1 | hLHRc | selectin l | Reconstituted Complex | BioGRID | 10950950 |
| SELP | CD62 | CD62P | FLJ45155 | GMP140 | GRMP | LECAM3 | PADGEM | PSEL | 选择素P（颗粒膜蛋白140KDA，抗原CD62） | - | HPRD，Biogrid | 10950950 |
| TNR | MGC149328 | TN-R | tenascin R (restrictin, janusin) | - | HPRD | 9294172 |
| XCL1 | ATAC | LPTN | LTN | SCM-1 | SCM-1a | SCM1 | SCYC1 | chemokine (C motif) ligand 1 | - | HPRD，Biogrid | 11083865 |
V.途径注释
| Pathway name | Pathway size | ＃szgr 2.0基因 | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG CELL ADHESION MOLECULES CAMS | 134 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID P53下游途径 | 137 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Beta Catenin nuc途径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID TOLL内源性途径 | 25 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CS DS DEGRADATION | 12 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CHONDROITIN SULFATE BIOSYNTHESIS | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CHONDROITIN SULFATE DERMATAN SULFATE METABOLISM | 49 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME HEPARAN SULFATE HEPARIN HS GAG METABOLISM | 52 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome糖胺聚糖代谢 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME A TETRASACCHARIDE LINKER SEQUENCE IS REQUIRED FOR GAG SYNTHESIS | 25 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME METABOLISM OF CARBOHYDRATES | 247 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 中村肿瘤区周围与中央 | 285 | 181 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu肿瘤脉管系统 | 29 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Schuetz乳腺癌导管侵入性 | 351 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sengupta鼻咽癌 | 294 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房导管癌与导管正常 | 44 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TURASHVILI BREAST DUCTAL CARCINOMA VS LOBULAR NORMAL UP | 73 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房小叶癌与导管正常 | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| turashvili乳房小叶癌与小叶正常DN | 74 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIU TARGETS OF VMYB VS CMYB DN | 43 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ROY WOUND BLOOD VESSEL UP | 50 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| gal白血病干细胞DN | 244 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vecchi胃癌先进与早期 | 175 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP | 185 | 126 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TONKS TARGETS OF RUNX1 RUNX1T1 FUSION ERYTHROCYTE UP | 157 | 104 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| runx1 runx1t1融合的TONKS目标维持在红细胞中 | 44 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 斋丁嫩造血干细胞DN | 226 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODRIGUES THYROID CARCINOMA ANAPLASTIC UP | 722 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DELYS THYROID CANCER UP | 443 | 294 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| chiaradonna肿瘤转化cdc25 | 120 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1慢性洛夫 | 115 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Markey RB1急性LOF DN | 228 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN DN | 172 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS G DN | 35 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房4 5WK | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McBryan Pubertal乳房6 7WK DN | 79 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL TGFB1 TARGETS UP | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LUCAS HNF4A TARGETS DN | 8 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN对砷三氧化物的反应 | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEREZ TP53 TARGETS | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LINDGREN BLADDER CANCER HIGH RECURRENCE | 49 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TP53和TP63的Schavolt目标 | 16 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 埃尔南德斯有丝分裂逮捕Docetaxel 2 DN | 19 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DACOSTA ERCC3 ALLELE XPCS VS TTD DN | 36 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP | 176 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRUETZMANN PANCREATIC CANCER UP | 358 | 245 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LI WILMS TUMOR VS FETAL KIDNEY 2 UP | 30 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Ingram SHH靶向DN | 64 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MANTOVANI VIRAL GPCR SIGNALING DN | 49 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS DN | 637 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEI MYCN TARGETS WITH E BOX | 795 | 478 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIAO HAVE SOX4 BINDING SITES | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LIAO METASTASIS | 539 | 324 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU细胞迁移 | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH SOX2 TARGETS | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 唱歌转移基质 | 110 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 2 UP | 256 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CTNNB1发出的CDH1信号传导 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kannan TP53目标 | 58 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WILLERT WNT SIGNALING | 24 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| POMEROY MEDULLOBLASTOMA DESMOPLASIC VS CLASSIC DN | 59 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT OK VS DONOR UP | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HESS TARGETS OF HOXA9 AND MEIS1 DN | 77 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GERY CEBP目标 | 126 | 90 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1的Verhaak AML突变 | 183 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Petrova内皮淋巴与血液DN | 162 | 102 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Chiaretti急性淋巴细胞白血病ZAP70 | 67 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PETROVA PROX1 TARGETS DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HADDAD T LYMPHOCYTE AND NK PROGENITOR DN | 63 | 41 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牙肺纹状横纹肌肉瘤DN | 408 | 274 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Weston Vegfa目标6小时 | 59 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kaab心脏中心与心室 | 249 | 170 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21 TARGETS UP | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PAL PRMT5 TARGETS UP | 203 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JI对FSH DN的响应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MAHAJAN RESPONSE TO IL1A DN | 76 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLALOCK ALZHEIMERS DISEASE UP | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LINDVALL IMMORTALIZED BY TERT DN | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 韦斯顿Vegfa目标 | 108 | 71 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C1的反应 | 19 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GERHOLD ADIPOGENESIS DN | 64 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU AGING BRAIN UP | 262 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BURTON ADIPOGENESIS 3 | 101 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1的早期反应 | 58 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV 24小时DN | 91 | 64 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 18HR DN | 178 | 121 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zhu CMV全部DN | 128 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21 TARGETS 2 UP | 428 | 266 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DEBIASI APOPTOSIS BY REOVIRUS INFECTION DN | 287 | 208 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BACOLOD RESISTANCE TO ALKYLATING AGENTS DN | 60 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MARTINEZ RESPONSE TO TRABECTEDIN DN | 271 | 175 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 伯顿成年时期16小时 | 40 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BILD CTNNB1致癌特征 | 82 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 转移DN期间的clasper淋巴管 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| monnier tradiatiation肿瘤逃脱 | 393 | 244 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性4 | 307 | 185 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION UP | 180 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RIGGI EWING SARCOMA PROGENITOR DN | 191 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的甲基化 | 56 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564 | 326 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOQUEST STEM CELL UP | 260 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yague pryumor耐药性DN | 13 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| mirlet7a3的Brueckner目标 | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU TUMOR ENDOTHELIAL MARKERS UP | 22 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU TUMOR ANGIOGENESIS UP | 25 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Alonso转移EMT | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALONSO METASTASIS UP | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Jiang Tip30目标 | 46 | 28 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU SILENCED BY METHYLATION IN BLADDER CANCER | 55 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 在肿瘤血管生成期间沉默的Hellebrekers | 80 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Takeer吉西他滨抗性DN | 122 | 84 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Rutella对HGF DN的响应 | 235 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RUTELLA RESPONSE TO HGF VS CSF2RB AND IL4 DN | 245 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| cro骨基质刺激 | 60 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CROONQUIST NRAS VS STROMAL STIMULATION DN | 99 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集5 | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| POOLA INVASIVE BREAST CANCER UP | 288 | 168 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS CTNNB1 DN | 170 | 105 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 洛佩兹间皮瘤生存DN | 12 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KORKOLA EMBRYONIC CARCINOMA VS SEMINOMA UP | 22 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S1 | 237 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 钱德兰转移 | 221 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAO TEMPORAL RESPONSE TO PROGESTERONE CLUSTER 16 | 79 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| EWSR1 ETS融合DN的Miyagawa目标 | 229 | 135 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PASINI SUZ12 TARGETS DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gobert少突胶质细胞分化 | 570 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PHONG TNF RESPONSE VIA P38 COMPLETE | 227 | 151 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 山乳房干细胞DN | 146 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALTEMEIER RESPONSE TO LPS WITH MECHANICAL VENTILATION | 128 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ANASTASSIOU CANCER MESENCHYMAL TRANSITION SIGNATURE | 64 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 林乳腺干细胞向上 | 489 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA蛋白聚糖 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA核心母质 | 275 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NABA矩阵 | 1028 | 559 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| miRNA family | 目标位置 | mirna id | miRNA seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR start | UTR end | Match method | |||
| miR-101 | 293 | 299 | 1a | HSA-MIR-101 | UACAGUACUGUGAUAACUGAAG |
| mir-124/506 | 56 | 62 | m8 | HSA-MIR-506 | uaaggcacccuucugugaguaga |
| hsa-miR-124脑 | UAAGGCACGCGGUGAAUGCC | ||||
| mir-136 | 704 | 710 | m8 | hsa-miR-136 | ACUCCAUUUGUUUUGAUGAUGGA |
| mir-144 | 293 | 299 | 1a | hsa-miR-144 | uacaguauagauguauguaguag |
| mir-186 | 238 | 244 | 1a | hsa-miR-186 | caaagaauuuugggcuu |
| mir-203.1 | 30 | 36 | 1a | HSA-MIR-203 | UGAAAUGUUUAGGACCACUAG |
| mir-496 | 333 | 340 | 1a,m8 | hsa-miR-496 | Auuacauggccaaucuc |