基因页：ncan

概括？
基因 1463
象征 ncan
同义词 CSPG3
描述 Neurocan
参考 MIM：600826|HGNC：HGNC：2465|Ensembl：ENSG00000130287|HPRD：02897|Vega：Otthumg00000182218
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19p12
Pascal P值 7.64e-6
Sherlock P值 0.112
TADA P值 0.021
胎儿β 1.092
DMG 1（＃研究）
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 细胞粘附和透射信号传导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG：JAFFE_2016 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 1
DNM：Gulsuner_2013 整个外显子组测序分析 155 DNM通过外显子组对精神分裂症个体及其父母的三重奏测序确定。
LK：是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV：RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 筛 CG46 特征 学习
ncan CHR19 19359527 C t NM_004386 p.1219p> l 错过 精神分裂症 DNM：Gulsuner_2013

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p（dis） beta（dis） fdr（dis） 学习
CG08181476 19 19322676 ncan 6.02E-8 -0.036 1.52E-5 DMG：JAFFE_2016

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17095163 CHR14 97767256 ncan 1463 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
PID Syndecan 3途径 17 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome发育生物学 396 292 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome CS DS降解 12 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐生物合成 21 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组软骨素硫酸盐皮肤硫酸盐代谢 49 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome硫酸乙酰肝素肝素HS GAG代谢 52 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome糖胺聚糖代谢 111 69 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome GAG合成需要四糖接头序列 25 17 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Axon指导 251 188 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM1相互作用 39 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome NCAM信号传导，用于神经突的生长 64 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome L1CAM相互作用 86 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
碳水化合物的反应组代谢 247 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应生活 485 293 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Huttmann B Cll生存不佳 276 187 该途径中的所有SZGR 2.0基因
runx1 runx1t1融合HSC的TONKS目标UP 185 126 该途径中的所有SZGR 2.0基因
周的炎症反应fima 544 308 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche皮肤肿瘤启动子 142 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险低DN 165 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Darwiche Papilloma风险高 147 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
darwiche鳞状细胞癌 146 104 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向神经上皮DN 164 111 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM6 46 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein星形胶质细胞标记 42 35 该途径中的所有SZGR 2.0基因
海勒被甲基化沉默 282 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 461 298 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smid乳腺癌基础 648 398 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yauch刺猬信号传导旁分泌DN 264 159 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 ICP带有H3K27ME3 74 46 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF ICP与H3K27Me3 206 108 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen ES ICP带有H3K4ME3和H3K27ME3 137 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC ICP带有H3K4Me3 445 257 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组B响应UVC响应 549 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gobert少突胶质细胞分化DN 1080 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA蛋白聚糖 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA核心母质 275 148 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因