基因页：CSRP2
Summary？
| 基因 | 1466年 |
| 象征 | CSRP2 |
| 同义词 | CRP2 | LMO5 | Smlim |
| 描述 | 半胱氨酸和富含甘氨酸的蛋白2 |
| Reference | MIM：601871|HGNC:HGNC:2470|ENSEMBL：ENSG00000175183|HPRD：03523|Vega:OTTHUMG00000169919 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 12Q21.1 |
| Pascal P值 | 0.493 |
| Sherlock p-value | 0.737 |
| 胎儿β | 4.013 |
| DMG | 1(# studies) |
| 主持人 | 尾状基底神经节 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 Myers' cis & trans |
基因in Data Sources
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG10582318 | 12 | 77273011 | CSRP2 | 1.929E-4 | -0.352 | 0.035 | DMG：Wockner_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| rs1868354 | CHR12 | 77440580 | CSRP2 | 1466年 | 0.18 | 顺式 | ||
| RS1257641 | CHR14 | 99480394 | CSRP2 | 1466年 | 0.19 | 反式 | ||
| rs9612557 | CHR22 | 24535629 | CSRP2 | 1466年 | 0.07 | 反式 | ||
| RS1495333 | 12 | 77300447 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.195E-8 | 0 | -27607 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS201910500 | 12 | 77300644 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 2.819E-9 | 0 | -27804 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs773464 | 12 | 77304373 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 4.706E-7 | 0 | -31533 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs773463 | 12 | 77304825 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 9.457E-8 | 0 | -31985 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS398020216 | 12 | 77308842 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 5.252E-10 | 0 | -36002 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7960465 | 12 | 77309358 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.195E-8 | 0 | -36518 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7976747 | 12 | 77313694 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.516E-9 | 0 | -40854 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12812426 | 12 | 77314197 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.288E-9 | 0 | -41357 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1873913 | 12 | 77315273 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 9.059E-10 | 0 | -42433 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11116211 | 12 | 77315824 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 7.434e-10 | 0 | -42984 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs773481 | 12 | 77318084 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 4.973E-8 | 0 | -45244 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs773484 | 12 | 77319533 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 5.295E-7 | 0 | -46693 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7302529 | 12 | 77321581 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 3.63e-9 | 0 | -48741 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS35877960 | 12 | 77322751 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 3.63e-9 | 0 | -49911 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS34311394 | 12 | 77323112 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 3.354e-9 | 0 | -50272 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12823997 | 12 | 77323760 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 9.909E-8 | 0 | -50920 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1691551 | 12 | 77324116 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 5.109E-8 | 0 | -51276 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS1493428 | 12 | 77326330 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.514E-6 | 0 | -53490 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs12813099 | 12 | 77374813 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 1.829E-6 | 0 | -101973 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs11829785 | 12 | 77376271 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 8.696E-7 | 0 | -103431 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7961235 | 12 | 77377378 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 8.567E-7 | 0 | -104538 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs7976098 | 12 | 77379179 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 9.817E-7 | 0 | -106339 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7976452 | 12 | 77381447 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 8.316E-7 | 0 | -108607 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS11832777 | 12 | 77383787 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 8.201E-7 | 0 | -110947 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS7963478 | 12 | 77384897 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 8.161E-7 | 0 | -112057 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS10506723 | 12 | 77386509 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 7.803E-7 | 0 | -113669 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS310880 | 12 | 77387885 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 3.58e-7 | 0 | -115045 | gtex_brain_putamen_basal |
| RS12833647 | 12 | 77391378 | CSRP2 | ENSG00000175183.5 | 6.479E-7 | 0 | -118538 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| RNF34 | 0.93 | 0.93 |
| KIAA0406 | 0.93 | 0.94 |
| C17orf71 | 0.93 | 0.94 |
| KIAA0174 | 0.93 | 0.94 |
| PRPF4 | 0.92 | 0.93 |
| SMU1 | 0.92 | 0.94 |
| eftud2 | 0.92 | 0.92 |
| polr3c | 0.92 | 0.92 |
| BUB3 | 0.92 | 0.95 |
| CSTF2 | 0.92 | 0.91 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.83 | -0.86 |
| AF347015.31 | -0.82 | -0.85 |
| AF347015.8 | -0.81 | -0.86 |
| AF347015.33 | -0.81 | -0.84 |
| mt-cyb | -0.80 | -0.84 |
| AF347015.27 | -0.79 | -0.84 |
| AF347015.15 | -0.78 | -0.84 |
| AF347015.2 | -0.77 | -0.83 |
| AF347015.21 | -0.77 | -0.85 |
| FXYD1 | -0.76 | -0.83 |