基因页：RTN4RL1
概括？
| 基因 | 146760 |
| 象征 | RTN4RL1 |
| 同义词 | NGRH2 | NGR3 |
| 描述 | 网状4受体样1 |
| 参考 | MIM：610461|HGNC：HGNC：21329|ENSEMBL：ENSG00000185924|HPRD：11523|Vega：Otthumg00000180184 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 17p13.3 |
| Pascal P值 | 0.007 |
| 胎儿β | -0.095 |
| DMG | 1（＃研究） |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG12967327 | 17 | 1906190 | RTN4RL1 | 3.54e-5 | 0.404 | 0.02 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23岁）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0004872 | 受体活性 | 艾达 | 12694398 | |
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| GO：0031103 | 轴突再生 | 塔斯 | Axon，神经突（GO期限：13） | 14664809 |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0046658 | 锚定在质膜上 | 艾达 | 12694398 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 留置权乳腺癌化生型与导管DN | 114 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标 | 380 | 213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Vantveer乳腺癌转移 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CUI TCF21目标2 DN | 830 | 547 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 游动乳腺癌预后不良 | 55 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang MLL目标 | 289 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Durand Stroma S向上 | 297 | 194 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-133 | 1038 | 1045 | 1A，M8 | HSA-MIR-133A | uugguccccuucaaccagcugu |
| HSA-MIR-133B | uguguccccuucaaccagcua | ||||
| mir-141/200a | 1271 | 1278 | 1A，M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||
| mir-326 | 1732年 | 1738年 | 1a | HSA-MIR-326 | ccucugggcccuccag |
| mir-335 | 480 | 486 | M8 | HSA-MIR-335脑 | UCAAGAGCAAUAACGAAAAAUAUGU |
| mir-34/449 | 24 | 31 | 1A，M8 | HSA-MIR-34A脑 | uggcaguguuaguguguuuu |
| HSA-MIR-34C | Aggcaguguaguagcugauugc | ||||
| HSA-MIR-449 | uggcaguguauuguagcuggu | ||||
| HSA-MIR-449B | Aggcaguguauuguuagcuggc | ||||
| mir-370 | 394 | 400 | 1a | HSA-MIR-370脑 | gccugggggguggaaccugg |
| mir-374 | 156 | 162 | 1a | HSA-MIR-374 | uuauaauacaAccugauaagug |
| mir-410 | 721 | 727 | 1a | HSA-MIR-410 | aauauaacacagauggcugu |
| mir-500 | 691 | 697 | M8 | HSA-MIR-500 | augcaccuggggaggagauucug |
| mir-9 | 625 | 631 | M8 | HSA-MIR-9SZ | ucuuuguuaucuagcuguauga |