概括
基因 147657
象征 ZNF480
同义词 -
描述 锌指蛋白480
参考 MIM:613910|HGNC:HGNC:23305|ENSEMBL:ENSG00000198464|HPRD:15799|Vega:Otthumg00000157507
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.41
Pascal P值 0.483
Sherlock P值 0.722
TADA P值 9.04e-4
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Girard_2011 整个外显子组测序分析 数据集包括从14个精神分裂症概率及其父母的外部发现的15个DNM。
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
ZNF480 CHR19 52826001 C t NM_144684 p.500r>* 废话 精神分裂症 DNM:Girard_2011

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1537107 CHR21 40359032 ZNF480 147657 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Reactome通用转录途径 352 181 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Senese HDAC3靶向 501 327 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nuytten Nipp1靶向 769 437 该途径中的所有SZGR 2.0基因