基因页:TTC9B
概括?
基因 | 148014 |
象征 | TTC9B |
同义词 | - |
描述 | 四肽重复域9b |
参考 | HGNC:HGNC:26395|ENSEMBL:ENSG00000174521|HPRD:08329|Vega:Otthumg00000182600 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 19q13.2 |
Pascal P值 | 0.83 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG14882636 | 19 | 40722039 | TTC9B | 1.471E-4 | 0.449 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS17028363 | CHR2 | 41913161 | TTC9B | 148014 | 0.16 | 反式 | ||
RS16829545 | CHR2 | 151977407 | TTC9B | 148014 | 5.266e-11 | 反式 | ||
RS7584986 | CHR2 | 184111432 | TTC9B | 148014 | 0.06 | 反式 | ||
RS10491487 | CHR5 | 80323367 | TTC9B | 148014 | 0.03 | 反式 | ||
RS16955618 | CHR15 | 29937543 | TTC9B | 148014 | 2.282E-8 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/TTC9B_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Odonnell TFRC靶向DN | 139 | 76 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 | 35 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pedrioli mir31靶向 | 221 | 120 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |