概括
基因 148014
象征 TTC9B
同义词 -
描述 四肽重复域9b
参考 HGNC:HGNC:26395|ENSEMBL:ENSG00000174521|HPRD:08329|Vega:Otthumg00000182600
基因类型 蛋白质编码
地图位置 19q13.2
Pascal P值 0.83
DMG 1(#研究)
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG14882636 19 40722039 TTC9B 1.471E-4 0.449 0.031 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17028363 CHR2 41913161 TTC9B 148014 0.16 反式
RS16829545 CHR2 151977407 TTC9B 148014 5.266e-11 反式
RS7584986 CHR2 184111432 TTC9B 148014 0.06 反式
RS10491487 CHR5 80323367 TTC9B 148014 0.03 反式
RS16955618 CHR15 29937543 TTC9B 148014 2.282E-8 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Odonnell TFRC靶向DN 139 76 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kuuselo胰腺癌19Q13扩增 35 22 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 491 319 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bruins通过TP53组A的UVC响应 898 516 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pedrioli mir31靶向 221 120 该途径中的所有SZGR 2.0基因