基因页：SYT6
概括？
| 基因 | 148281 |
| 象征 | SYT6 |
| 同义词 | Sytvi |
| 描述 | Synaptotagmin 6 |
| 参考 | MIM：607718|HGNC：HGNC：18638|Ensembl：ENSG00000134207|HPRD：09654|Vega：Otthumg00000011755 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 1p13.2 |
| Pascal P值 | 0.097 |
| 主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
| 支持 | canabinoid 多巴胺 胞吞作用 代谢性谷氨酸受体 5-羟色胺 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV：GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0235 | |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
EQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS969607 | CHR4 | 63403137 | SYT6 | 148281 | 0.18 | 反式 | ||
| RS11941778 | CHR4 | 63417928 | SYT6 | 148281 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
| 去：0005215 | 转运蛋白活性 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0006810 | 运输 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0008021 | 突触囊泡 | IEA | 突触，神经递质（GO期限：12） | - |
| GO：0045202 | 突触 | IEA | 神经元，突触，神经递质，神经胶质（GO期限：2） | - |
| 去：0016020 | 膜 | IEA | - | |
| GO：0016021 | 膜不可或缺 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - | |
| GO：0031410 | 细胞质囊泡 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| Benporath Suz12目标 | 1038 | 678 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 松本自然杀手差分 | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| McClung Delta FOSB目标8WK | 47 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kondo EZH2目标 | 245 | 148 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yauch刺猬信号传导旁分泌DN | 264 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner NPC HCP带有H3K4ME2 | 491 | 319 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-103/107 | 15 | 22 | 1A，M8 | HSA-MIR-103脑 | agcagcauuguacggcuauga |
| HSA-MIR-107脑 | agcagcauuguacgggcuauca | ||||
| mir-140 | 103 | 109 | M8 | HSA-MIR-140脑 | agugguuuuacccuaugguag |
| mir-142-5p | 967 | 973 | 1a | HSA-MIR-142-5P | cauaaaguagaaagcacuac |
| mir-320 | 965 | 971 | 1a | HSA-MIR-320 | aaaagcugggugagaggggcgaa |
| mir-495 | 1215 | 1221 | M8 | HSA-MIR-495脑 | Aaacaaacauggugcacuuuuu |
| mir-542-3p | 2795 | 2801 | 1a | HSA-MIR-542-3P | ugugacauugauaacugaaa |