Gene Page:CTH
概括?
| 基因 | 1491 |
| Symbol | CTH |
| Synonyms | - |
| Description | 胱硫醚gamma-lyase |
| Reference | MIM:607657|HGNC:HGNC:2501|ENSEMBL：ENSG00000116761|HPRD:09633|Vega：Otthumg00000009352 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | 1p31.1 |
| Pascal p-value | 0.019 |
| Fetal beta | 0.362 |
| eGene | 元 |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:GWAScat | Genome-wide Association Studies | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| PMID:cooccur | High-throughput literature-search | Systematic search in PubMed for genes co-occurring with SCZ keywords. A total of 3027 genes were included. | |
| GSMA_IIA | Genome scan meta-analysis (All samples) | Psr: 0.02692 | |
| Literature | High-throughput literature-search | Co-occurance with Schizophrenia keywords: schizophrenia,schizophrenias | Click to show details |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression during devlopment (BrainCloud)
脚注：
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
No co-expressed genes in brain regions
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0004123 | 胱淀粉γ-裂解酶活性 | IEA | - | |
| GO:0016829 | lyase activity | IEA | - | |
| GO:0030170 | pyridoxal phosphate binding | IEA | - | |
| 生物过程 | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| 去：0008652 | amino acid biosynthetic process | IEA | - | |
| GO:0019344 | cysteine biosynthetic process | IEA | - | |
| Cellular component | GO term | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005737 | 细胞质 | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
| Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG GLYCINE SERINE AND THREONINE METABOLISM | 31 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG CYSTEINE AND METHIONINE METABOLISM | 34 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG SELENOAMINO ACID METABOLISM | 26 | 18 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG NITROGEN METABOLISM | 23 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME SULFUR AMINO ACID METABOLISM | 24 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME METABOLISM OF AMINO ACIDS AND DERIVATIVES | 200 | 136 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA CANCER MICROENVIRONMENT DN | 46 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PARENT MTOR SIGNALING UP | 567 | 375 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONKEN UVEAL MELANOMA DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GARY CD5 TARGETS UP | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BASAKI YBX1 TARGETS UP | 290 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 1 UP | 276 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MULLIGHAN NPM1 MUTATED SIGNATURE 2 UP | 139 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MULLIGHAN NPM1 SIGNATURE 3 UP | 341 | 197 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| UDAYAKUMAR MED1 TARGETS DN | 240 | 171 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS DN | 536 | 332 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KINSEY TARGETS OF EWSR1 FLII FUSION UP | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAGASHIMA NRG1 SIGNALING UP | 176 | 123 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DODD NASOPHARYNGEAL CARCINOMA UP | 1821 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR DN | 64 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 96HR DN | 75 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE UP | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DELYS THYROID CANCER DN | 232 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CONCANNON APOPTOSIS BY EPOXOMICIN UP | 239 | 157 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS F DN | 33 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Tang衰老TP53靶向DN | 57 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MCBRYAN PUBERTAL BREAST 3 4WK DN | 39 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAN RESPONSE TO ARSENIC TRIOXIDE | 123 | 80 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 XPCS UP | 28 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHLOSSER SERUM RESPONSE DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TERAMOTO OPN TARGETS CLUSTER 7 | 19 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 UP | 309 | 199 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AMUNDSON RESPONSE TO ARSENITE | 217 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CEBALLOS TARGETS OF TP53 AND MYC UP | 21 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM4 | 261 | 153 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GROSS ELK3 TARGETS DN | 32 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GROSS HYPOXIA VIA ELK3 DN | 156 | 106 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GROSS HYPOXIA VIA HIF1A UP | 77 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUYTTEN EZH2 TARGETS UP | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BUYTAERT PHOTODYNAMIC THERAPY STRESS UP | 811 | 508 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH SOX2 TARGETS | 734 | 436 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GEORGES TARGETS OF MIR192 AND MIR215 | 893 | 528 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JEON SMAD6 TARGETS DN | 19 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 1 UP | 140 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHEPARD CRUSH AND BURN MUTANT UP | 197 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMITH TERT TARGETS UP | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| DORSAM HOXA9 TARGETS UP | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FLECHNER BIOPSY KIDNEY TRANSPLANT REJECTED VS OK DN | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHAN MULTIPLE MYELOMA CD1 UP | 45 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RORIE TARGETS OF EWSR1 FLI1 FUSION UP | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODWELL AGING KIDNEY NO BLOOD DN | 150 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| vietor ifrd1目标 | 23 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RODWELL AGING KIDNEY DN | 145 | 88 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 48HR UP | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SU LIVER | 55 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE AMINO ACID DEPRIVATION | 29 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 6HR UP | 953 | 554 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KRIGE RESPONSE TO TOSEDOSTAT 24HR UP | 783 | 442 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YEGNASUBRAMANIAN PROSTATE CANCER | 128 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HELLER SILENCED BY METHYLATION DN | 105 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HELLER HDAC TARGETS DN | 292 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Heller HDAC靶向被甲基化的沉默 | 461 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MITSIADES RESPONSE TO APLIDIN UP | 439 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZHANG BREAST CANCER PROGENITORS UP | 425 | 253 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOCHKIS FOXA2 TARGETS | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WEST ADRENOCORTICAL TUMOR DN | 546 | 362 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHO NR4A1 TARGETS | 33 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BHATI G2M ARREST BY 2METHOXYESTRADIOL DN | 127 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUECKNER TARGETS OF MIRLET7A3 UP | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEN HOXA5 TARGETS 9HR UP | 223 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BLUM RESPONSE TO SALIRASIB UP | 245 | 159 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYLAN MULTIPLE MYELOMA C D UP | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Yoshimura MAPK8目标DN | 366 | 257 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHAFFER IRF4 TARGETS IN ACTIVATED B LYMPHOCYTE | 81 | 66 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHIANG LIVER CANCER SUBCLASS PROLIFERATION DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHICAS RB1 TARGETS SENESCENT | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bakker FOXO3靶向DN | 187 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PURBEY C的目标TBP1 NOT SATB1 UP | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WAKABAYASHI ADIPOGENESIS PPARG BOUND 8D | 658 | 397 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Plasari TGFB1靶向10小时 | 199 | 143 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ALFANO MYC TARGETS | 239 | 156 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY | 1839 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |