基因页：CTNNA1
概括？
| 基因 | 1495 |
| 象征 | CTNNA1 |
| 同义词 | CAP102 |
| 描述 | Catenin alpha 1 |
| 参考 | MIM：116805|HGNC：HGNC：2509|Ensembl：ENSG00000044115|HPRD：00285|Vega：Otthumg00000163502 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 5q31.2 |
| Pascal P值 | 0.586 |
| Sherlock P值 | 0.88 |
| 胎儿β | 0.146 |
| DMG | 1（＃研究） |
| 主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 小脑 额叶皮质BA9 |
| 支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET Ascano FMRP目标 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 1 |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR：0.0032 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
| go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关的关键字的命中：1 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG01873236 | 5 | 138088662 | CTNNA1 | 2.563E-4 | -0.406 | 0.038 | DMG：Wockner_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| Adamts10 | 0.88 | 0.79 |
| CNKSR1 | 0.88 | 0.80 |
| LPAR2 | 0.88 | 0.76 |
| HGFAC | 0.88 | 0.78 |
| MAMDC4 | 0.88 | 0.77 |
| VWCE | 0.87 | 0.78 |
| atad3b | 0.87 | 0.78 |
| JMJD7-PLA2G4B | 0.87 | 0.80 |
| mical1 | 0.87 | 0.80 |
| CCDC57 | 0.86 | 0.76 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| 基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| ABCG2 | -0.54 | -0.58 |
| ITM2B | -0.53 | -0.56 |
| ACOT13 | -0.52 | -0.57 |
| PLA2G4A | -0.52 | -0.59 |
| AF347015.31 | -0.51 | -0.61 |
| AF347015.27 | -0.51 | -0.61 |
| FAM162A | -0.51 | -0.55 |
| C5orf53 | -0.50 | -0.55 |
| HLA-C | -0.50 | -0.47 |
| aldoc | -0.50 | -0.49 |
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 12477722 | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
| 去：0051015 | 肌动蛋白丝结合 | IEA | - | |
| GO：0017166 | Vinculin结合 | IPI | 9700171 | |
| GO：0045296 | 钙粘蛋白结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007406 | 神经细胞增殖的阴性调节 | IEA | 神经发生（GO期限：10） | - |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | nas | 8323564 | |
| 去：0007163 | 细胞极性的建立或维护 | IEA | - | |
| 去：0043066 | 凋亡的负调节 | IEA | - | |
| GO：0043297 | 顶点交界器组件 | nas | 9700171 | |
| GO：0045880 | 平滑信号通路的正调控 | IEA | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| GO：0030027 | 薄片 | IEA | - | |
| 去：0005915 | Zonula粘附器 | IEA | - | |
| 去：0005912 | 粘附交界处 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | IEA | - |
第四节。蛋白质蛋白相互作用注释
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | 资源 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| ACTN1 | FLJ40884 | 肌动蛋白，alpha 1 | - | HPRD，Biogrid | 7790378 |
| APC | BTPS2 |DP2 |DP2.5 |dp3 |GS | 腺瘤息肉大肠杆菌 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7651399|8259519 |
| CA9 | Caix |Mn | 碳酸酐酶IX | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 14567991 |
| CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1，1型，e-钙粘蛋白（上皮） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7542250|8227214 |9233779|10381631 |11960376 |
| CDH2 | CD325 |CDHN |CDW325 |NCAD | 钙粘蛋白2，1型，N-钙粘蛋白（神经元） | 亲和力捕获ms 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12604612|14625392 |
| CDH3 | CDHP |HJMD |PCAD | 钙粘蛋白3，1型，p-钙粘蛋白（胎盘） | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 共纯化 |
Biogrid | 10381631|10910767 |
| CDH5 | 7B4 |CD144 |FLJ17376 | 钙粘蛋白5，2型（血管内皮） | - | HPRD，Biogrid | 12003790 |
| CTNNA1 | CAP102 |FLJ36832 | Catenin（cadherin相关蛋白），α1，102KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9762469 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | - | HPRD，Biogrid | 7706414 |
| CTNNB1 | ctnnb |DKFZP686D02253 |FLJ25606 |FLJ37923 | Catenin（cadherin相关蛋白），β1，88KDA | β-catenin与α-catenin相互作用。这种相互作用是建立在人β-catenin和小鼠α-catenin之间的相互作用的模型。 | 绑定 | 15294866 |
| ctnnd1 | cas |ctnnd |KIAA0384 |P120CAS |P120CTN |P120 | Catenin（钙粘蛋白相关蛋白），三角洲1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7651399 |
| DLG1 | DKFZP761P0818 |DKFZP781B0426 |dlgh1 |SAP97 |DJ1061C18.1.1 |HDLG | 圆盘，大型同源物1（果蝇） | - | HPRD，Biogrid | 9512503 |
| FAM84B | BCMP101 |NSE2 | 具有序列相似性的家庭84，成员b | - | HPRD，Biogrid | 12477722 |
| jub | Ajuba |MGC15563 | Jub，Ajuba同源物（Xenopus laevis） | - | HPRD | 12417594 |
| JUP | ARVD12 |ctnng |dp3 |dpiii |PDGB |PKGB | 交界处Plakoglobin | - | HPRD，Biogrid | 7650039|9110993 |
| mllt4 | AF-6 |AF6 |Afadin |FLJ34371 |RP3-431P23.3 | 髓样/淋巴样或混合细胞白血病（果蝇Trithorax同源物）；易位为4 | - | HPRD，Biogrid | 11907041 |
| myo7a | DFNA11 |DFNB2 |Myoviia |myu7a |NSRD2 |USH1B | 肌球蛋白VIIA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 11080149 |
| PSEN1 | ad3 |时尚|PS1 |S182 | Presenilin 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 10635315 |
| PTPN14 | MGC126803 |pez |ptp36 | 蛋白质酪氨酸磷酸酶，非受体14型 | 亲和力捕获ms | Biogrid | 12808048 |
| SPTAN1 | （alpha）ii-spectrin |FLJ44613 |Neas | 光谱，α，非肉毒细胞1（阿尔法 - - - - - - - --------） | - | HPRD | 11069925 |
| SPTBN1 | 精灵|SPTB2 |Betaspii | 光谱，β，非肉毒杆菌1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11069925 |
| TJP2 | MGC26306 |x104 |ZO-2 |ZO2 | 紧密连接蛋白2（Zona occludens 2） | - | HPRD，Biogrid | 10026224 |
| VCL | CMD1W |MVCL | Vinculin | - | HPRD，Biogrid | 9700171 |
| Vezt | DKFZP761C241 |vezatin | Vezatin，粘附连接跨膜蛋白 | - | HPRD，Biogrid | 11080149 |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Cell2Cell途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID遇到了路径 | 80 | 60 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID ARF6贩运途径 | 49 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID nectin途径 | 30 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID CDC42途径 | 70 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pid ajdiss 2Pathway | 48 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin新生AJ途径 | 39 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin角质形成细胞途径 | 21 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Ecadherin稳定途径 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID VEGFR1 2途径 | 69 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID NCADHERIN途径 | 33 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PID Rac1途径 | 54 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome发育生物学 | 396 | 292 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞通信 | 120 | 77 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome Adherens连接相互作用 | 27 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞连接组织 | 56 | 31 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Reactome细胞连接组织 | 78 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 反应组肌发生 | 28 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过CD40 DN的Hollmann凋亡 | 267 | 178 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| thum收缩性心力衰竭 | 423 | 283 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AKL HTLV1感染 | 27 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1靶向 | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Senese HDAC1和HDAC2靶向 | 238 | 144 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim WT1目标12小时DN | 209 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Provenzani转移DN | 136 | 94 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV响应角质形成细胞DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUELLET卵巢癌侵入性与LMP UP | 117 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Baris甲状腺癌DN | 59 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 牛甲基化的乳腺癌 | 35 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Kim Myc放大目标DN | 97 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 肺癌吸烟者 | 80 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Shen Smarca2目标 | 424 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Iizuka肝癌进展L0 L1 DN | 21 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 彭葡萄糖剥夺DN | 169 | 112 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Flechner活检肾脏移植OK vs捐助者 | 555 | 346 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NPM1本地化的Alcalay AML | 140 | 83 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 用VH3 21 DN的FAELT B CLL | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sesto对UV C8的反应 | 72 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TBH和H2O2的Weigel氧化应激 | 36 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kaab失败的心房DN | 141 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制肌肉 | 43 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia对TGFB1 C5的反应 | 21 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Verrecchia延迟对TGFB1的响应 | 39 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lee Calorie限制新皮层DN | 88 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Hedenfalk乳腺癌BRCA1与BRCA2 | 163 | 113 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 贝尔德糖尿病性肾病DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Mitsiades对aplidin DN的反应 | 249 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤D簇DN | 40 | 26 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤D DN | 78 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Goldrath抗原反应 | 346 | 192 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindstedt树突状细胞成熟C | 69 | 49 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| p210 bcr abl融合的射线目标 | 18 | 13 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MILI假足趋化性DN | 457 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集4 | 31 | 17 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Valk AML群集15 | 31 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| cebpa的valk aml | 37 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine甲状腺肿瘤不确定恶性肿瘤 | 36 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| fontaine乳头状甲状腺癌 | 66 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boylan多发性骨髓瘤PCA3 DN | 69 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 黄胚胎干细胞核心 | 335 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 惠特菲尔德细胞周期g2 m | 216 | 124 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| lu eszh2靶向DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CTBP1的PURBEY目标不是SATB1 | 344 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-141/200a | 717 | 723 | M8 | HSA-MIR-141 | uaacacugucugugugugugaugg |
| HSA-MIR-200A | uaacacugucuguguguguaaacgaugu | ||||