基因页：CTNNA2
概括？
| 基因 | 1496年 |
| 象征 | CTNNA2 |
| 同义词 | CAP-R | CAPR | CT114 | CTNR |
| 描述 | Catenin alpha 2 |
| 参考 | MIM：114025|HGNC：HGNC：2510|ENSEMBL：ENSG0000000066032|HPRD：00228|Vega：Otthumg00000152903 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 2P12-P11.1 |
| Sherlock P值 | 0.215 |
| TADA P值 | 0.017 |
| 胎儿β | -1.603 |
| 主持人 | 元 |
| 支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS COMPOSITESET 潜在的突触基因 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DNM：Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究，该研究使用基因组DNA报告了DNM。 | |
| PMID：cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
| 文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症，精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
DNM表| 基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CTNNA2 | CHR2 | 80136810 | G | 一个 | NM_001164883 NM_004389 |
p.315a> t p.315a> t |
错过 错过 |
精神分裂症 | DNM：Fromer_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
| 分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| 去：0005515 | 蛋白质结合 | IEA | - | |
| 去：0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
| 去：0005200 | 细胞骨架的结构成分 | nas | 8432524 | |
| GO：0045296 | 钙粘蛋白结合 | IEA | - | |
| 生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | IEA | - | |
| 去：0007155 | 细胞粘附 | nas | - | |
| 细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
| 去：0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
| 去：0005886 | 质膜 | IEA | - | |
| GO：0015629 | 肌动蛋白细胞骨架 | IEA | - | |
| GO：0030054 | 细胞连接 | IEA | - |
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| kegg粘附交界处 | 75 | 53 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg thright连接点 | 134 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| kegg白细胞跨内皮迁移 | 118 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 癌症中的KEGG途径 | 328 | 259 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG子宫内膜癌 | 52 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KEGG心律失常右心肌病ARVC | 76 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Biocarta Cell2Cell途径 | 14 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Piepoli LGI1靶向 | 15 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 周炎性反应lps up | 431 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 史密斯肝癌 | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BYSTRYKH造血干细胞QTL Trans | 882 | 572 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 通过nova2拼接 | 43 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染48小时 | 180 | 125 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Cheng由雌二醇印记 | 110 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CCND1和CDK4的Molenaar靶标 | 67 | 48 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Boyault肝癌子类G6 UP | 65 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 布朗HCMV感染30分钟 | 56 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
| mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
|---|---|---|---|---|---|
| UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
| mir-183 | 597 | 603 | M8 | HSA-MIR-183 | uauggcacugguagaauucacug |
| mir-363 | 430 | 436 | 1a | HSA-MIR-363 | auugcacgguauccaucuguaa |
| mir-409-3p | 233 | 239 | M8 | HSA-MIR-409-3P | cgauauguugcucggugaaccccu |