基因页:ctnnd1
Summary?
GeneID | 1500 |
Symbol | ctnnd1 |
同义词 | CAS | CTNND | P120CAS | P120CTN | P120 | P120(CAS)| P120(CTN) |
描述 | catenin delta 1 |
Reference | MIM: 601045|HGNC:HGNC:2515|Ensembl:ENSG00000198561|HPRD:03026|织女:OTTHUMG00000167272 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 11q11 |
Pascal P值 | 2.403E-6 |
Sherlock p-value | 0.26 |
支持 | 细胞内信号转导 G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS CompositeSet |
Gene in Data Sources
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
网络 | Shortest path distance of core genes in the Human protein-protein interaction network | Contribution to shortest path in PPI network: 0.5323 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
Footnote:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
No co-expressed genes in brain regions
第三节。基因本体论注释
Molecular function | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005488 | 捆绑 | IEA | - | |
去:0005515 | protein binding | IEA | - | |
去:0005198 | 结构分子活性 | IEA | - | |
Biological process | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0006355 | 调节转录,DNA依赖性的调节 | IEA | - | |
GO:0006350 | 转录 | IEA | - | |
GO:0016055 | Wnt受体信号通路 | IEA | - | |
GO:0016337 | 细胞细胞粘附 | nas | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005624 | 膜分数 | IEA | - | |
去:0005634 | nucleus | nas | - | |
去:0005737 | cytoplasm | nas | - | |
GO:0030027 | 薄片 | IEA | - | |
去:0005886 | 质膜 | IEA | - |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
Interactors | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
---|---|---|---|---|---|
ACTG1 | 行为|ACTG |DFNA20 |DFNA26 | actin, gamma 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12835311 |
CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) | CDH1(ECAD)与P120CTN 3AC相互作用。这种相互作用是在小鼠CDH1(ECAD)和人P120CTN 3AC之间的相互作用上建模的。 | 绑定 | 12707304 |
CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) | - | HPRD | 7651399|10409703 | 10225956 |10931041 |
CDH1 | 弧1 |CD324 |cdhe |ECAD |lcam |UVO | 钙粘蛋白1,1型,e-钙粘蛋白(上皮) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 7542250|7651399 |7876318|9535896 |10409703|12427869 |12640114|12707304 |
CDH2 | CD325 | CDHN | CDw325 | NCAD | 钙粘蛋白2,1型,N-钙粘蛋白(神经元) | Affinity Capture-MS 亲和力捕获 - 韦斯特恩 |
Biogrid | 12604612|14625392 |
CDH24 | CDH11L | FLJ25193 | MGC131880 | 钙粘蛋白样24 | - | HPRD | 12734196 |
CDH3 | CDHP |HJMD |PCAD | cadherin 3, type 1, P-cadherin (placental) | - | HPRD,Biogrid | 8660921 |
CDH5 | 7B4 |CD144 |FLJ17376 | 钙粘蛋白5,2型(血管内皮) | - | HPRD,Biogrid | 11855855 |
Col17a1 | BA16H23.2 |BP180 |BPAG2 |FLJ60881 |KIAA0204 |lad-1 | 胶原蛋白,第XVII型,Alpha 1 | - | HPRD,Biogrid | 10321838 |
CTNNA1 | CAP102 |FLJ36832 | Catenin(cadherin相关蛋白),α1,102KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 7651399 |
CTNNB1 | CTNNB | DKFZp686D02253 | FLJ25606 | FLJ37923 | Catenin(cadherin相关蛋白),β1,88KDA | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 9535896|11712088 |
cttn | EMS1 | FLJ34459 | cortactin | - | HPRD,Biogrid | 12835311 |
egfr | ERBB |ERBB1 |her1 |PIG61 |梅纳 | 表皮生长因子受体(红细胞性白血病病毒(V-ERB-B)癌基因同源物,鸟类) | 重构的复合物 | Biogrid | 9535896 |
ERBB2IP | Erbin |LAP2 | erbb2 interacting protein | - | HPRD,Biogrid | 11821434 |
FER | tyk3 | FER(FPS/FES相关)酪氨酸激酶 | - | HPRD | 12640114 |
FYN | MGC45350 | SLK | SYN | Fyn Oncogene与SRC,FGR,是的 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 生化活动 |
Biogrid | 12640114|12835311 |
Grik2 | EAA4 |Glr6 |Gluk6 |glur6 |MGC74427 |MRT6 | 谷氨酸受体,离子型,海藻酸盐2 | - | HPRD | 12151522 |
LCK | yt16 |p56lck |pp58lck | 淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶 | 生化活动 | Biogrid | 12835311 |
MUC1 | CD227 |EMA |H23AG |mam6 |Pem |Pemt |棕榈 | 粘蛋白1,细胞表面相关 | - | HPRD,Biogrid | 11181067 |
NPHS1 | CNF |nphn | 肾脏病1,先天性,芬兰类型(肾素) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 |
Biogrid | 15331416 |
PSEN1 | ad3 |时尚|PS1 |S182 | Presenilin 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 重构的复合物 Two-hybrid |
Biogrid | 10208590 |
PTPN6 | HCP | HCPH | HPTP1C | PTP-1C | SH-PTP1 | SHP-1 | SHP-1L | SHP1 | protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 6 | - | HPRD,Biogrid | 10835420 |
ptprj | CD148 |dep1 |hptpeta |R-PTP-ETA |SCC1 | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,J | - | HPRD,Biogrid | 12370829 |
ptprm | MGC166994 |ptprl1 |R-PTP-MU |rptpm |rptpu |HR-PTPU | 蛋白酪氨酸磷酸酶,受体类型,M | - | HPRD,Biogrid | 10753936 |
SRC | ASV | SRC1 | c-SRC | p60-Src | v-src sarcoma (Schmidt-Ruppin A-2) viral oncogene homolog (avian) | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12640114 |
是的1 | HST441 |p61-yes |是|c-yes | v-yes-1 Yamaguchi sarcoma viral oncogene homolog 1 | 亲和力捕获 - 韦斯特恩 | Biogrid | 12640114 |
ZBTB33 | Znf-Kaiso |ZNF348 | zinc finger and BTB domain containing 33 | - | HPRD,Biogrid | 10207085 |