基因页：ctnnd2

概括？
基因 1501
象征 ctnnd2
同义词 gt24 | nprap
描述 Catenin Delta 2
参考 MIM：604275|HGNC：HGNC：2516|ENSEMBL：ENSG00000169862|HPRD：09181|Vega：Otthumg0000000090511
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5p15.2
Pascal P值 0.056
Sherlock P值 0.001
胎儿β -0.159
支持 细胞内信号转导
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-CONSESUS
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-HUMAN-PSD-FULL
G2CDB.HUMAN_BAYES-COLLINS-MOUSE-PSD-CONSUS
COMPOSITESET
Darnell FMRP目标
潜在的突触基因

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历：Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
CV：GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历：PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID：cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在：精神分裂症，精神分裂症 点击显示详细信息
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中：2

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达（GTEX）

无法使用

Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达（brainspan）

脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
S100B 0.80 0.87
C10orf116 0.74 0.88
PTGD 0.73 0.85
FXYD1 0.73 0.87
S100A1 0.72 0.87
HSD17B14 0.72 0.84
myl3 0.71 0.84
S100A13 0.70 0.86
GSDMD 0.70 0.77
rom1 0.69 0.84
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
rnasen -0.64 -0.80
heatr5b -0.63 -0.76
C10ORF137 -0.63 -0.78
ZFP28 -0.63 -0.79
珀格 -0.63 -0.77
Stau1 -0.62 -0.76
RNF145 -0.62 -0.77
TOPBP1 -0.62 -0.76
PABPC4 -0.62 -0.77
COPG2 -0.62 -0.78

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005515 蛋白质结合 IEA -
去：0005198 结构分子活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO：0048167 突触可塑性的调节 IEA 突触（GO期限：8） -
去：0007158 神经元粘附 nas 神经元（GO期限：5） -
去：0006355 调节转录，DNA依赖性的调节 IEA -
去：0007155 细胞粘附 塔斯 9223106
去：0006350 转录 IEA -
去：0007165 信号转导 塔斯 9223106
去：0007612 学习 IEA -
去：0007275 多细胞生物发育 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去：0005634 核 IEA -
去：0005737 细胞质 塔斯 9342840
GO：0030054 细胞连接 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 ＃szgr 2.0基因 信息
Bertucci髓质与导管乳腺癌DN 169 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础 380 215 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质 450 256 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Doane对雄激素DN的反应 241 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王攀登目标 269 146 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gozgit ESR1靶向DN 781 465 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向G 238 135 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过Trail Up 584 356 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gruetzmann胰腺癌DN 203 134 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WEI mir34a目标 148 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath Suz12目标 1038 678 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath EED目标 1062 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
与H3K27me3的Benporath ES 1118 744 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Benporath PRC2目标 652 441 该途径中的所有SZGR 2.0基因
戈德拉斯体内平衡增殖 171 102 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Affar YY1目标 214 133 该途径中的所有SZGR 2.0基因
汉·詹克（Han Jnk）唱歌 35 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
XU GH1自分泌目标DN 142 94 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性5 482 296 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Riggins他莫昔芬抵抗DN 220 147 该途径中的所有SZGR 2.0基因
林黑色素瘤复制号码 73 53 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张乳腺癌祖细胞 425 253 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
甜肺癌克拉斯 491 316 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G1 UP 113 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌生存 73 49 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kyng Werner综合征和正常衰老 93 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时DN 91 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时DN 505 328 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ERBB2同工型的Pedersen转移7 403 240 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 780 786 1a HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-129-5p 662 668 1a HSA-MIR-129脑 cuuuuugcgguggggcuugc
HSA-MIR-129-5P cuuuuugcgguggggcuugcu
mir-141/200a 886 893 1A，M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-186 871 877 1a HSA-MIR-186 caaagaauuuugggcuu
MiR-200BC/429 699 705 M8 HSA-MIR-200B uaauacugccugguaaugaugac
HSA-MIR-200C uaauacugccggguaaugaugg
HSA-MIR-429 uaauacuguguguguguguaaaaaccgu
mir-218 341 348 1A，M8 HSA-MIR-218脑 uugugcuugaucuaaccaugu
mir-26 1330 1337 1A，M8 HSA-MIR-26A脑 Uucaaguaauccaggauaggc
HSA-MIR-26BSZ uucaaguaauucaggauagguu
mir-299-5p 1293 1299 1a HSA-MIR-299-5P ugguuuaccgucccacauacau
mir-30-5p 396 402 M8 HSA-MIR-30A-5P uguaaaacauccuccugagaag
HSA-MIR-30C脑 uguaaacauccuacucucucucucagc
HSA-MIR-30DSZ uguaaacauccccgacuggaag
HSA-MIR-30BSZ uguaaacauccuaccucucagcu
HSA-MIR-30E-5P uguaaacauccuugacugga
mir-31 468 474 M8 HSA-MIR-31 Aggcaagaugcuggcauagcug
mir-328 1322 1328 1a HSA-MIR-328脑 cuggcccucugccuuccgu
mir-34/449 813 819 M8 HSA-MIR-34A脑 uggcaguguuaguguguuuu
HSA-MIR-34C Aggcaguguaguagcugauugc
HSA-MIR-449 uggcaguguauuguagcuggu
HSA-MIR-449B Aggcaguguauuguuagcuggc
mir-34b 814 821 1A，M8 HSA-MIR-34B uaggcagugucauagcugauug
mir-361 712 718 M8 HSA-MIR-361脑 uuaucagaaucuccagggguac
mir-493-5p 505 511 M8 HSA-MIR-493-5p uuguacaugguaggcuuucauu
mir-495 476 482 1a HSA-MIR-495脑 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-496 1351 1357 1a HSA-MIR-496 Auuacauggccaaucuc
mir-543 1570年 1576年 1a HSA-MIR-543 aaacauucgcggugcacuucu