基因页:AIFM3
概括?
基因 | 150209 |
象征 | AIFM3 |
同义词 | aifl |
描述 | 凋亡诱导因子,线粒体相关3 |
参考 | HGNC:HGNC:26398|ENSEMBL:ENSG00000183773|HPRD:08085|Vega:Otthumg00000150804 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 22Q11.21 |
Pascal P值 | 0.312 |
Sherlock P值 | 0.208 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CNV:是的 | 拷贝数变异研究 | 手动策划 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.031 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11582961 | CHR1 | 184023058 | AIFM3 | 150209 | 0.06 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
去:0008656 | caspase激活剂活性 | 艾达 | 15764604 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0016491 | 氧化还原酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
GO:0050660 | 时尚结合 | IEA | - | |
GO:0051537 | 2铁,2个硫簇结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006917 | 诱导凋亡 | 艾达 | 15764604 | |
去:0008635 | 通过细胞色素c激活胱天冬酶 | 艾达 | 15764604 | |
去:0006810 | 运输 | IEA | - | |
去:0006915 | 凋亡 | IEA | - | |
去:0022900 | 电子传输链 | IEA | - | |
GO:0045454 | 细胞氧化还原稳态 | IEA | - | |
GO:0051882 | 线粒体去极化 | 艾达 | 15764604 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005829 | 细胞质 | 艾达 | 15764604 | |
去:0005634 | 核 | 艾达 | 15764604 | |
去:0005737 | 细胞质 | IEA | - | |
去:0005739 | 线粒体 | 艾达 | 15764604 | |
去:0005743 | 线粒体内膜 | 艾达 | 15764604 | |
去:0005783 | 内质网 | 艾达 | 15764604 | |
去:0005886 | 质膜 | 艾达 | 15764604 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Tong与PTTG1互动 | 57 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 | 435 | 318 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 | 590 | 403 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马顿人维甲酸的反应 | 857 | 456 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-96 | 68 | 74 | M8 | HSA-MIR-96脑 | uuuggcacuagcacauuuuugc |