概括
基因 151295
象征 SLC23A3
同义词 e2bp3 | svct3 | yspl1
描述 Solute Carrier家族23成员3
参考 HGNC:HGNC:20601|ENSEMBL:ENSG00000213901|HPRD:15350|Vega:Otthumg00000154616
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q35
Pascal P值 7.439e-5
胎儿β 0.24

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01016
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00916
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005215 转运蛋白活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006810 运输 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Rashi对电离辐射1的响应1 45 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen IPS LCP带有H3K27Me3 10 7 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-338 48 54 1a HSA-MIR-338 uccagauuuuuguuga