基因页:fahd2b
概括?
基因 | 151313 |
象征 | fahd2b |
同义词 | - |
描述 | 含有2B |
参考 | HGNC:HGNC:25318|Ensembl:ENSG00000144199|HPRD:13198|Vega:Otthumg00000130533 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q11.2 |
Pascal P值 | 0.024 |
Sherlock P值 | 0.137 |
胎儿β | -1.159 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 小脑半球 小脑 皮质 梭子基底神经节 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.0004 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG15176895 | 2 | 97761354 | fahd2b | 4.273E-4 | 0.231 | 0.045 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS1256999 | 2 | 97679933 | fahd2b | ENSG00000144199.7 | 3.38029E-6 | 0.02 | 80686 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4577322 | 2 | 97862656 | fahd2b | ENSG00000144199.7 | 3.26369E-6 | 0.02 | -102037 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FAHD2B_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000287 | 镁离子结合 | IEA | - | |
去:0005509 | 钙离子结合 | IEA | - | |
GO:0016787 | 水解酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008152 | 代谢过程 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |