概括
基因 151313
象征 fahd2b
同义词 -
描述 含有2B
参考 HGNC:HGNC:25318|Ensembl:ENSG00000144199|HPRD:13198|Vega:Otthumg00000130533
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q11.2
Pascal P值 0.024
Sherlock P值 0.137
胎儿β -1.159
DMG 1(#研究)
主持人 小脑半球
小脑
皮质
梭子基底神经节

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 1
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0004

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG15176895 2 97761354 fahd2b 4.273E-4 0.231 0.045 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS1256999 2 97679933 fahd2b ENSG00000144199.7 3.38029E-6 0.02 80686 gtex_brain_putamen_basal
RS4577322 2 97862656 fahd2b ENSG00000144199.7 3.26369E-6 0.02 -102037 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000287 镁离子结合 IEA -
去:0005509 钙离子结合 IEA -
GO:0016787 水解酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0008152 代谢过程 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
阿塞维多肝癌DN 540 340 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN 274 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因