概括
基因 152
象征 ADRA2C
同义词 adra2l2 | adra2rl2 | adrarl2 | alpha2car
描述 adrenoceptor alpha 2c
参考 MIM:104250|HGNC:HGNC:283|ENSEMBL:ENSG00000184160|HPRD:00085|Vega:Otthumg00000159830
基因类型 蛋白质编码
地图位置 4P16
Pascal P值 0.049
Sherlock P值 0.002
胎儿β -0.685
主持人 小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
ADT:SUN_2012 系统研究抗精神病药及其靶标 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11186955 Chr10 94138670 ADRA2C 152 0.19 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0004872 受体活性 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0004938 α2-肾上腺素能受体活性 塔斯 9371698
去:0004935 adrenoceptor活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0000187 MAPK活动的激活 塔斯 10196213
去:0007186 G蛋白偶联受体蛋白信号通路 塔斯 9371698
去:0007267 细胞细胞信号传导 塔斯 9371698
去:0007165 信号转导 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005768 内体 塔斯 10196213
去:0005886 质膜 IEA -
去:0005887 质膜的积分 塔斯 9371698

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG神经活性配体受体相互作用 272 195 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Davicioni分子臂与ERMS 332 228 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gaussmann MLL AF4融合靶向D 38 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
哈马凋亡通过小径dn 186 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN APC目标 77 55 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hanson HRAS通过NFKB发出信号 22 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra靶向DN 105 63 该途径中的所有SZGR 2.0基因
华莱士前列腺癌竞赛 299 167 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rizki肿瘤侵入性3D 210 124 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 1069 729 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Valk AML群集13 30 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
具有H3K4ME2和H3K27ME3的Meissner NPC HCP 349 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 HCP带有H3K27ME3 435 318 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stein Esrra目标 535 325 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen NPC HCP带有H3K27ME3 341 243 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MEF HCP带有H3K27ME3 590 403 该途径中的所有SZGR 2.0基因
YAO对孕酮簇6的时间反应6 75 48 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马顿人维甲酸的反应 857 456 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-182 472 479 1A,M8 HSA-MIR-182 uuuggcaaugguagaacucaca
mir-96 473 479 1a HSA-MIR-96 uuuggcacuagcacauuuuugc