基因页面:XXYLT1
总结吗?
GeneID | 152002年 |
象征 | XXYLT1 |
同义词 | C3orf21 |
描述 | 木糖苷xylosyltransferase 1 |
参考 | MIM: 614552|HGNC: HGNC: 26639|运用:ENSG00000173950|HPRD: 08757|织女:OTTHUMG00000155915 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 q29 |
帕斯卡假定值 | 0.107 |
夏洛克假定值 | 0.48 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Jaffe_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括2104探针/论文认定与深圳病人(n = 108)比136年控制在Bonferroni-adjusted P < 0.05。 | 1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg17362109 | 3 | 194981274 | XXYLT1 | 2.44平台以及 | -0.02 | 6.18 e - | DMG: Jaffe_2016 |
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs6785291 | chr3 | 194782393 | C3orf21 | 152002年 | 0.11 | 独联体 | ||
rs7645177 | chr3 | 194785564 | C3orf21 | 152002年 | 0.02 | 独联体 | ||
rs6794037 | chr3 | 194789162 | C3orf21 | 152002年 | 0.08 | 独联体 | ||
rs7514423 | chr1 | 29778112 | C3orf21 | 152002年 | 0.07 | 反式 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/XXYLT1_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
郑受FOXP3 | 491年 | 310年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
OUILLETTE CLL 13 q14删除DN | 60 | 38 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝癌了 | 973年 | 570年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |