基因页：GLIPR2
概括？
| 基因 | 152007 |
| 象征 | GLIPR2 |
| 同义词 | C9orf19 | GAPR-1 | GAPR1 |
| 描述 | GLI发病机理相关2 |
| 参考 | MIM：607141|HGNC：HGNC：18007|ENSEMBL：ENSG00000122694|HPRD：06187|Vega：Otthumg0000000019900 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| 地图位置 | 9p13.3 |
| Pascal P值 | 0.603 |
| Sherlock P值 | 0.321 |
| 胎儿β | -0.499 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
| 基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 3 |
| DMG：Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点，对应于精神分裂症患者（n = 260）和未受影响的对照（n = 250）之间的391个独特的转录本。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
差异甲基化基因| 探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | beta（dis） | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CG06484397 | 9 | 36137132 | GLIPR2 | 1.66E-9 | -0.023 | 1.48e-6 | DMG：JAFFE_2016 |
| CG12876594 | 9 | 35791798 | GLIPR2 | 1.34E-5 | -2.535 | DMG：Vaneijk_2014 | |
| CG24194775 | 9 | 35791475 | GLIPR2 | 1.94E-5 | -2.688 | DMG：Vaneijk_2014 |
EQTL注释
| SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| RS4893866 | CHR2 | 177363635 | GLIPR2 | 152007 | 0.01 | 反式 | ||
| RS3804100 | CHR4 | 154625408 | GLIPR2 | 152007 | 0.15 | 反式 | ||
| RS17061055 | CHR13 | 40835399 | GLIPR2 | 152007 | 0.09 | 反式 | ||
| RS2701519 | CHR15 | 37408650 | GLIPR2 | 152007 | 0.12 | 反式 | ||
| RS289799 | CHR15 | 63720989 | GLIPR2 | 152007 | 0 | 反式 | ||
| RS6023981 | CHR20 | 53868217 | GLIPR2 | 152007 | 0.13 | 反式 | ||
| RS16979927 | CHR20 | 55019249 | GLIPR2 | 152007 | 0 | 反式 | ||
| RS17347454 | Chrx | 23347700 | GLIPR2 | 152007 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达（brainspan）
脚注：
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
| 路径名 | 路径大小 | ＃szgr 2.0基因 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 乳腺癌腔与间充质DN | 460 | 312 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NUP98 HOXA9融合8D DN的Takeda目标 | 205 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌的Rodrigues分化不佳的DN | 805 | 505 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 甲状腺癌变性DN | 537 | 339 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Lindgren膀胱癌簇2B | 392 | 251 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dairkee Tert目标DN | 124 | 79 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Sheth肝癌与TXNIP损失PAM5 | 94 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Nuytten EZH2靶向 | 1037 | 673 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath Nanog目标 | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Benporath EED目标 | 1062 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 与H3K27me3的Benporath ES | 1118 | 744 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 棕色髓样细胞的发育 | 165 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王顺铂反应和XPC DN | 228 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 罗德韦尔老化的肾脏 | 487 | 303 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Wang Smarce1靶向 | 280 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Creighton内分泌疗法抗性2 | 473 | 224 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Gavin Foxp3目标集群P7 | 90 | 52 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 促进耐受巨噬细胞DN | 409 | 268 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 王肿瘤的侵入性 | 374 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 张TLX目标36hr | 221 | 150 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Meissner Brain HCP带有H3K4ME3和H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| li诱导了自然杀手 | 307 | 182 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Dutertre雌二醇反应24小时DN | 505 | 328 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Bruins通过TP53组A的UVC响应 | 898 | 516 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| pasini suz12靶向DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |