基因页面:ROPN1B
总结吗?
| GeneID | 152015年 |
| 象征 | ROPN1B |
| 同义词 | - - - - - - |
| 描述 | rhophilin尾部相关蛋白1 b |
| 参考 | HGNC: HGNC: 31927|运用:ENSG00000114547|HPRD: 17985|织女:OTTHUMG00000162651 |
| 基因型 | 蛋白质编码 |
| 地图上的位置 | 3 q21.2 |
| 帕斯卡假定值 | 0.024 |
| eGene | 尾状基底神经节 皮质 额叶皮质BA9 下丘脑 伏隔核基底神经节 硬膜基底神经节 |
基因数据来源
| 基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
|---|---|---|---|
| 简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
eQTL注释| SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| rs4447711 | 3 | 125809715 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 5.635 e - | 0 | 121728年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs71327750 | 3 | 125815056 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 3.332 e - | 0 | 127069年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs34049220 | 3 | 125815634 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 3.586 e-8 | 0 | 127647年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2365012 | 3 | 125817204 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 6.446 e - | 0 | 129217年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2365011 | 3 | 125817218 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 4.046 e-8 | 0 | 129231年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs1077620 | 3 | 125819540 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 3.964 e-8 | 0 | 131553年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2004338 | 3 | 125819737 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 6.332 e - | 0 | 131750年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646768 | 3 | 125820571 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 9.504 e - | 0 | 132584年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2003334 | 3 | 125822003 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 6.332 e - | 0 | 134016年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646762 | 3 | 125822178 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 7.078 e - | 0 | 134191年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646761 | 3 | 125822272 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 9.504 e - | 0 | 134285年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646760 | 3 | 125822871 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 6.499 e - | 0 | 134884年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646755 | 3 | 125824334 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 1.411 e - | 0 | 136347年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs10934744 | 3 | 125824382 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 1.602 e-6 | 0 | 136395年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646754 | 3 | 125824899 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 1.604 e-6 | 0 | 136912年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs4646751 | 3 | 125825661 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 2.421 e-6 | 0 | 137674年 | gtex_brain_putamen_basal |
| rs2276730 | 3 | 125826213 | ROPN1B | ENSG00000114547.5 | 2.512 e-6 | 0 | 138226年 | gtex_brain_putamen_basal |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
中的基因在大脑区域
| 前10名中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| L3MBTL4 | 0.79 | 0.79 |
| 加 | 0.73 | 0.82 |
| LMO4 | 0.71 | 0.75 |
| MAFB | 0.70 | 0.82 |
| 科大 | 0.70 | 0.75 |
| NTN4 | 0.69 | 0.74 |
| NDST3 | 0.69 | 0.72 |
| BMP2 | 0.68 | 0.70 |
| ETV6 | 0.67 | 0.70 |
| ZSCAN18 | 0.67 | 0.80 |
| 十大负面中的基因 | ||
| 基因 | 皮尔森的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| MT-CO2 | -0.46 | -0.49 |
| AF347015.21 | -0.46 | -0.49 |
| AF347015.31 | -0.45 | -0.47 |
| AF347015.33 | -0.45 | -0.44 |
| AF347015.8 | -0.44 | -0.47 |
| MT-CYB | -0.44 | -0.45 |
| AF347015.27 | -0.43 | -0.46 |
| S100B | -0.42 | -0.42 |
| AF347015.26 | -0.42 | -0.43 |
| AC021016.1 | -0.42 | -0.43 |
部分诉通路注释
| 路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
|---|---|---|---|
| ONKEN葡萄膜黑色素瘤DN | 526年 | 357年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| TURASHVILI乳腺导管癌和小叶正常的DN | 69年 | 43 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多恩乳腺癌ESR1 DN | 48 | 28 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 多德鼻咽癌起来 | 1821年 | 933年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三骨DN乳腺癌复发 | 315年 | 197年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 乳腺癌萧述三腔的DN | 564年 | 326年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
| 萧述三乳腺癌基底 | 648年 | 398年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |