基因页面:FGD5
总结吗?
GeneID | 152273年 |
象征 | FGD5 |
同义词 | ZFYVE23 |
描述 | FYVE, RhoGEF和PH值域包含5 |
参考 | MIM: 614788|HGNC: HGNC: 19117|运用:ENSG00000154783|HPRD: 13322|织女:OTTHUMG00000155556 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 3 p25.1 |
帕斯卡假定值 | 0.049 |
胎儿β | -0.443 |
DMG | 1(#研究) |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
DMG: Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 这个数据集包括4641个不同甲基化探针对应2929个独特的基因之间的精神分裂症患者(n = 24)和控制(n = 24)。 | 1 |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.006 | |
GO_Annotation | neuro-related关键字映射到基因本体论注释 | 支安打与neuro-related关键词:1 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
不同甲基化基因
探针 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | P (dis) | β(dis) | 罗斯福(dis) | 研究 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
cg12178431 | 3 | 14860764 | FGD5 | 9.83 e-5 | -0.639 | 0.028 | DMG: Wockner_2014 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/FGD5_DE_GTEx.png)
基因表达在发展脉络(BrainCloud)
补充说明:
共有269个时间点秘密策划,n = 38胎儿样本(x = 1) 38分到来。每个三角形代表一个时间点。
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005089 | ρguanyl-nucleotide交换因素的活动 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005085 | guanyl-nucleotide交换因素活动 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005515 | 蛋白结合 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0031267 | 小GTPase绑定 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
生物过程 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0046847 | 外肉伪足的形成 | 国际空间站 | 轴突(词级:10) | - - - - - - |
去:0007010 | 细胞骨架组织 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0008360 | 调节细胞形状 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0030036 | 肌动蛋白细胞骨架组织 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0035023 | ρ调节蛋白信号转导 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0043088 | Cdc42 GTPase活动的监管 | 国际空间站 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0001726 | 莱夫 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005794 | 高尔基体 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0005856 | 细胞骨架 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005737 | 细胞质 | 国际空间站 | - - - - - - | |
去:0030027 | lamellipodium | 国际空间站 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
刘前列腺癌DN | 481年 | 290年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
JAATINEN造血干细胞 | 316年 | 190年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
LASTOWSKA神经母细胞瘤拷贝数DN | 800年 | 473年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
佩雷斯TP53的目标 | 1174年 | 695年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
崔TCF21目标2 DN | 830年 | 547年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
伊万诺娃造血干细胞和祖 | 681年 | 420年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
阿塞维多甲基化在肝癌DN | 940年 | 425年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
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UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
miR-17-5p / 20/93.mr / 106/519.d | 459年 | 466年 | 1、m8 | hsa-miR-17-5p | CAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGU |
hsa-miR-20a大脑 | UAAAGUGCUUAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 106 a | AAAAGUGCUUACAGUGCAGGUAGC | ||||
hsa - mir - 106 b深圳 | UAAAGUGCUGACAGUGCAGAU | ||||
hsa-miR-20b深圳 | CAAAGUGCUCAUAGUGCAGGUAG | ||||
hsa - mir - 519 d | CAAAGUGCCUCCCUUUAGAGUGU | ||||
米尔- 93. - hd / 291 - 3 - p / 294/295/302/372/373/520 | 458年 | 464年 | m8 | hsa - mir - 93大脑 | AAAGUGCUGUUCGUGCAGGUAG |
hsa - mir - 302 a | UAAGUGCUUCCAUGUUUUGGUGA | ||||
hsa - mir - 302 b | UAAGUGCUUCCAUGUUUUAGUAG | ||||
hsa - mir - 302 c | UAAGUGCUUCCAUGUUUCAGUGG | ||||
hsa - mir - 302 d | UAAGUGCUUCCAUGUUUGAGUGU | ||||
hsa - mir - 372 | AAAGUGCUGCGACAUUUGAGCGU | ||||
hsa - mir - 373 | GAAGUGCUUCGAUUUUGGGGUGU | ||||
hsa - mir - 520 e | AAAGUGCUUCCUUUUUGAGGG | ||||
hsa - mir - 520 a | AAAGUGCUUCCCUUUGGACUGU | ||||
hsa - mir - 520 b | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGG | ||||
hsa - mir - 520 c | AAAGUGCUUCCUUUUAGAGGGUU | ||||
hsa - mir - 520 d | AAAGUGCUUCUCUUUGGUGGGUU |