基因页：CUX1
Summary？
| 基因 | 1523 |
| 象征 | CUX1 |
| Synonyms | casp | cdp | cdp/cut | cdp1 | coy1 | cutl1 | cux | clox | cux/cdp | golim6 | nbla10317 | p100 | p100 | p110 | p200 | p200 | p75 |
| Description | 像同型ox 1 |
| Reference | MIM：116896|HGNC：HGNC：2557|Ensembl:ENSG00000257923|HPRD：00295|Vega：Otthumg00000157129 |
| 基因类型 | 蛋白质编码 |
| Map location | 7Q22.1 |
| 帕斯卡假定值 | 0.008 |
| 胎儿β | 0.58 |
| DMG | 2（＃研究） |
| 主持人 | 小脑 |
| 支持 | CompositeSet Darnell FMRP目标 Ascano FMRP目标 |
Gene in Data Sources
| 基因集名称 | Method of gene set | Description | 信息 |
|---|---|---|---|
| CV:GWASdb | Genome-wide Association Studies | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
| 简历：PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
| DMG：JAFFE_2016 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括与SZ患者相关的2,104个探针/CPG（n = 108），而在Bonferroni调整后的P <0.05时，其中136个对照。 | 2 |
| DMG：Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针，对应于精神分裂症患者（n = 24）和对照组（n = 24）之间的2929个独特基因。 | 2 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
差异甲基化基因
差异甲基化基因| Probe | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p（dis） | Beta (dis) | fdr（dis） | 学习 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ch.7.2186304R | 7 | 101838045 | CUX1 | 8.31E-5 | -0.232 | 0.026 | DMG：Wockner_2014 |
| CG02987984 | 7 | 101457447 | CUX1 | 8.35e-9 | -0.011 | 3.93E-6 | DMG：JAFFE_2016 |
第二节。转录组注释
一般基因表达（GTEX）
Devlopment期间的基因表达（BrainCloud）
Footnote:
A total of 269 time points ploted, with n=38 fetal samples (x=1:38). Each triangle represents one time point.
时间变化的基因表达（brainspan）
Footnote:
SC：亚皮质区域；SM：感觉运动区域；FC：额叶皮层；和TP：颞顶皮层
ST1：胎儿（13-26个概念后周），ST2：婴儿早期至童年（4个月至11年）和ST3：青春期至成年期（13-23年）
所示的栏表示表达分布的较低25％和上层25％。
大脑区域的顶级共表达基因
| 前10个积极共表达的基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| STMN3 | 0.84 | 0.89 |
| CHAC1 | 0.83 | 0.88 |
| PRMT6 | 0.82 | 0.82 |
| KCNC4 | 0.82 | 0.88 |
| SEZ6L2 | 0.82 | 0.89 |
| SYNGR3 | 0.81 | 0.86 |
| PDGFB | 0.81 | 0.76 |
| GPR61 | 0.81 | 0.89 |
| Brunol4 | 0.81 | 0.87 |
| ABCG4 | 0.80 | 0.88 |
| 前10个负共表达基因 | ||
| Gene | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
| AF347015.2 | -0.41 | -0.29 |
| AF347015.18 | -0.41 | -0.32 |
| AC098691.2 | -0.40 | -0.42 |
| AF347015.21 | -0.40 | -0.29 |
| MT-CO2 | -0.39 | -0.31 |
| AF347015.8 | -0.39 | -0.31 |
| AF347015.26 | -0.39 | -0.28 |
| AF347015.33 | -0.39 | -0.29 |
| AP002478.3 | -0.38 | -0.39 |
| AF347015.31 | -0.38 | -0.30 |
Section IV. Protein-protein interaction annotation
| 互动者 | 别名b | 官方全名b | 实验 | Source | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|---|
| Bin1 | amph2 |amphl |DKFZP547F068 |MGC10367 |SH3P9 | bridging integrator 1 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| CCNA1 | - | cyclin A1 | 重构的复合物 | Biogrid | 11584018 |
| CDC2 | cdc28a |CDK1 |DKFZP686L20222 |MGC111195 | 细胞分裂周期2，G1至S和G2至M | 生化活动 | Biogrid | 11584018 |
| cdc25a | CDC25A2 | 细胞分裂周期25同源物A（S. Pombe） | - | HPRD | 11584018 |
| CDK7 | cak1 |CDKN7 |mo15 |STK1 |P39MO15 | 细胞周期蛋白依赖性激酶7 | 重构的复合物 | Biogrid | 11584018 |
| 克雷布 | 海关与边境保护局| KAT3A | rst | CREB结合蛋白 | - | HPRD,BioGRID | 10852958 |
| ELAC2 | ELC2 |FLJ10530 |FLJ36693 |FLJ42848 |HPC2 | elaC homolog 2 (E. coli) | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| Golga5 | golim5 |RFG5 |ret-ii | Golgi Autoantigen，Golgin亚家族A，5 | Glogin-84与CASP相互作用。这种相互作用是建立在大鼠Golgin-84和人CASP之间的相互作用上的模型。 | 绑定 | 15718469 |
| HMGB1 | DKFZP686A04236 |HMG1 |HMG3 |SBP-1 | 高机动性组框1 | - | HPRD | 11748221 |
| kat2b | CAF |P |P/CAF |PCAF | K（赖氨酸）乙酰转移酶2B | - | HPRD,BioGRID | 10852958 |
| RB1 | OSRC |RB |P105-RB |PRB |PP110 | 视网膜细胞瘤1 | - | HPRD,BioGRID | 12891711 |
| RECQL5 | FLJ90603 |RECQ5 | RECQ蛋白样5 | Two-hybrid | Biogrid | 16169070 |
| SATB1 | - | SATB HONEOBOX 1 | - | HPRD,BioGRID | 10373541 |
| SDC3 | n-syndecan |SDCN |Synd3 | Syndecan 3 | - | HPRD | 8662884 |