Gene Page:CXADR
概括?
| 基因 | 1525 |
| Symbol | CXADR |
| Synonyms | CAR|CAR4/6|HCAR |
| Description | coxsackie virus and adenovirus receptor |
| Reference | MIM:602621|HGNC:HGNC:2559|Ensembl:ENSG00000154639|HPRD:11804|Vega:OTTHUMG00000074508 |
| Gene type | protein-coding |
| Map location | 21q21.1 |
| Pascal p-value | 0.015 |
| Sherlock p-value | 0.429 |
数据源中的基因
| Gene set name | Method of gene set | Description | Info |
|---|---|---|---|
| CV:PGCnp | Genome-wide Association Study | GWAS | |
| GO_Annotation | Mapping neuro-related keywords to Gene Ontology annotations | 与神经相关的关键字的命中：1 |
Section I. Genetics and epigenetics annotation
Section II. Transcriptome annotation
General gene expression (GTEx)
Gene expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)
Footnote:
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.
Top co-expressed genes in brain regions
| Top 10 positively co-expressed genes | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| CSF1R | 0.86 | 0.88 |
| MPEG1 | 0.86 | 0.84 |
| LCP1 | 0.83 | 0.82 |
| TLR7 | 0.82 | 0.80 |
| NCKAP1L | 0.81 | 0.83 |
| LAPTM5 | 0.81 | 0.80 |
| CX3CR1 | 0.81 | 0.84 |
| CCR1 | 0.80 | 0.80 |
| ITGB2 | 0.79 | 0.82 |
| ITGAM | 0.79 | 0.75 |
| Top 10 negatively co-expressed genes | ||
| Gene | Pearson's Correlation | Spearman's Correlation |
| FXYD1 | -0.31 | -0.33 |
| AF347015.18 | -0.31 | -0.38 |
| AF347015.26 | -0.31 | -0.35 |
| EIF4EBP3 | -0.31 | -0.34 |
| MT-CO2 | -0.31 | -0.40 |
| AF347015.2 | -0.31 | -0.38 |
| NUDT8 | -0.30 | -0.33 |
| AL022328.1 | -0.30 | -0.34 |
| AF347015.21 | -0.29 | -0.33 |
| AF347015.8 | -0.28 | -0.37 |
Section III. Gene Ontology annotation
| Molecular function | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
|---|---|---|---|---|
| GO:0004872 | receptor activity | TAS | 9036860 | |
| GO:0005515 | protein binding | IEA | - | |
| Biological process | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0007155 | cell adhesion | IEA | - | |
| GO:0044419 | interspecies interaction between organisms | IEA | - | |
| Cellular component | 去的术语 | Evidence | Neuro keywords | PubMed ID |
| GO:0005923 | tight junction | IEA | Brain (GO term level: 10) | - |
| GO:0005794 | Golgi apparatus | IDA | 18029348 | |
| GO:0005576 | extracellular region | IEA | - | |
| GO:0005737 | cytoplasm | IDA | 18029348 | |
| GO:0005886 | plasma membrane | 经验 | 15800062 | |
| GO:0005886 | plasma membrane | IDA | 16780588 | |
| GO:0005887 | integral to plasma membrane | TAS | 9096397 | |
| GO:0016323 | basolateral plasma membrane | IEA | - | |
| GO:0030054 | cell junction | IEA | - |
Section V. Pathway annotation
| Pathway name | Pathway size | # SZGR 2.0 genes in pathway | Info |
|---|---|---|---|
| KEGG VIRAL MYOCARDITIS | 73 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IMMUNOREGULATORY INTERACTIONS BETWEEN A LYMPHOID AND A NON LYMPHOID CELL | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME CELL SURFACE INTERACTIONS AT THE VASCULAR WALL | 91 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME HEMOSTASIS | 466 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME IMMUNE SYSTEM | 933 | 616 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| REACTOME适应性免疫系统 | 539 | 350 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| NAKAMURA TUMOR ZONE PERIPHERAL VS CENTRAL DN | 634 | 384 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONKEN UVEAL MELANOMA DN | 526 | 357 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KIM RESPONSE TO TSA AND DECITABINE UP | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CHEMNITZ RESPONSE TO PROSTAGLANDIN E2 DN | 391 | 222 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HORIUCHI WTAP TARGETS DN | 310 | 188 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BASAKI YBX1 TARGETS DN | 384 | 230 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| JAEGER METASTASIS DN | 258 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC1 TARGETS UP | 457 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SENESE HDAC3 TARGETS UP | 501 | 327 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TIEN INTESTINE PROBIOTICS 24HR UP | 557 | 331 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ENK UV RESPONSE KERATINOCYTE DN | 485 | 334 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| VANHARANTA UTERINE FIBROID DN | 67 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN DN | 1781 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| GAUSSMANN MLL AF4 FUSION TARGETS A DN | 90 | 61 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| OUELLET CULTURED OVARIAN CANCER INVASIVE VS LMP UP | 69 | 40 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PEREZ TP53 TARGETS | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| RASHI RESPONSE TO IONIZING RADIATION 2 | 127 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| AIGNER ZEB1 TARGETS | 35 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SHETH LIVER CANCER VS TXNIP LOSS PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TOMLINS PROSTATE CANCER UP | 40 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SCHAEFFER PROSTATE DEVELOPMENT 6HR DN | 514 | 330 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KOYAMA SEMA3B TARGETS DN | 411 | 249 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WU CELL MIGRATION | 184 | 114 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH ES 1 | 379 | 235 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BENPORATH NANOG TARGETS | 988 | 594 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 TARGETS 2 DN | 464 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ONDER CDH1 SIGNALING VIA CTNNB1 | 83 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KANNAN TP53 TARGETS DN | 21 | 15 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BECKER TAMOXIFEN RESISTANCE UP | 50 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LEE LIVER CANCER E2F1 UP | 62 | 35 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MATSUDA NATURAL KILLER DIFFERENTIATION | 475 | 313 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YAGI AML FAB MARKERS | 191 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| IVANOVA HEMATOPOIESIS LATE PROGENITOR | 544 | 307 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SESTO RESPONSE TO UV C2 | 54 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KAAB HEART ATRIUM VS VENTRICLE DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 18HR UP | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| WELCSH BRCA1 TARGETS UP | 198 | 132 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BAELDE DIABETIC NEPHROPATHY DN | 434 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BROWNE HCMV INFECTION 24HR UP | 148 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| 转移期间的clasper淋巴管 | 20 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CREIGHTON ENDOCRINE THERAPY RESISTANCE 3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FOSTER TOLERANT MACROPHAGE UP | 156 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KYNG DNA DAMAGE BY GAMMA AND UV RADIATION | 88 | 65 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KYNG DNA DAMAGE UP | 226 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| SMID BREAST CANCER BASAL UP | 648 | 398 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUECKNER TARGETS OF MIRLET7A3 UP | 111 | 69 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MUELLER PLURINET | 299 | 189 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HAN SATB1 TARGETS DN | 442 | 275 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| MEISSNER BRAIN HCP WITH H3K4ME3 AND H3K27ME3 | 1069 | 729 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BOYAULT LIVER CANCER SUBCLASS G1 UP | 113 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| COULOUARN TEMPORAL TGFB1 SIGNATURE DN | 138 | 99 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| HOSHIDA LIVER CANCER SUBCLASS S2 | 115 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PYEON CANCER HEAD AND NECK VS CERVICAL UP | 193 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| KARLSSON TGFB1 TARGETS DN | 207 | 139 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| LU EZH2 TARGETS DN | 414 | 237 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PILON KLF1 TARGETS UP | 504 | 321 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| BRUINS UVC RESPONSE LATE | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| CERIBELLI GENES INACTIVE AND BOUND BY NFY | 45 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PASINI SUZ12 TARGETS DN | 315 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FEVR CTNNB1 TARGETS UP | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| YANG BCL3 TARGETS UP | 364 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| FORTSCHEGGER PHF8 TARGETS DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| PHONG TNF RESPONSE NOT VIA P38 | 337 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
| ACEVEDO FGFR1 TARGETS IN PROSTATE CANCER MODEL UP | 289 | 184 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |