基因页面:ZMAT2
总结吗?
GeneID | 153527年 |
象征 | ZMAT2 |
同义词 | Ptg-12 | Snu23 |
描述 | 锌指matrin-type 2 |
参考 | HGNC: HGNC: 26433|运用:ENSG00000146007|HPRD: 08094|织女:OTTHUMG00000129503 |
基因型 | 蛋白质编码 |
地图上的位置 | 5 q31.3 |
帕斯卡假定值 | 5.329 e-6 |
夏洛克假定值 | 0.557 |
eGene | 前扣带皮层BA24 |
基因数据来源
基因集名称 | 基因的方法设置 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCnp | 全基因组关联研究 | GWAS | |
GSMA_I | 基因组扫描分析 | Psr: 0.0032 |
部分即遗传学和表观遗传学注释
eQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | eGene | 基因Entrez ID | pvalue | qvalue | TSS距离 | eQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
rs201868746 | 5 | 140079407 | ZMAT2 | ENSG00000146007.6 | 5.64907 e-6 | 0.05 | -512年 | gtex_brain_ba24 |
rs801181 | 5 | 140092814 | ZMAT2 | ENSG00000146007.6 | 6.04715 e-6 | 0.05 | 12895年 | gtex_brain_ba24 |
第二部分。转录组注释
通用基因表达(GTEx)
![不可用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/ZMAT2_DE_GTEx.png)
基因表达的时空变化(BrainSpan)
补充说明:
SC:分皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶部皮层
某胎儿(13 - 26 postconception周),ST2:婴儿早期到晚期的童年(4个月到11年),和ST3:青春期到成年(13 - 23年)
代表低25%,显示的栏上25%的表达分布。
没有大脑中的基因区域
第三部分。基因本体论注释
分子功能 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0003677 | DNA结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0008270 | 锌离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0046872 | 金属离子结合 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
蜂窝组件 | 去的术语 | 证据 | 神经的关键词 | PubMed ID |
去:0005622 | 细胞内的 | 国际能源机构 | - - - - - - | |
去:0005634 | 核 | 国际能源机构 | - - - - - - |
部分诉通路注释
路径名称 | 通道尺寸 | # SZGR 2.0基因通路 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG剪接体 | 128年 | 72年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
GAUSSMANN MLL AF4融合目标C | 170年 | 114年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
挞挞浆细胞VS PLASMABLAST DN | 309年 | 206年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
ACEVEDO肝脏肿瘤与邻近正常组织 | 863年 | 514年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性了 | 518年 | 299年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
米利伪足趋触性DN | 668年 | 419年 | 所有SZGR 2.0基因通路 |
部分VI. microRNA注释
microrna的家庭 | 目标位置 | microrna的ID | microrna的seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir - 129 - 5 - p | 792年 | 799年 | 1、m8 | hsa - mir - 129大脑 | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGC |
hsa - mir - 129 - 5 - p | CUUUUUGCGGUCUGGGCUUGCU | ||||
mir - 134 | 224年 | 230年 | 1 | hsa - mir - 134大脑 | UGUGACUGGUUGACCAGAGGG |
mir - 450 | 792年 | 798年 | 1 | hsa - mir - 450 | UUUUUGCGAUGUGUUCCUAAUA |
mir - 496 | 629年 | 635年 | m8 | hsa - mir - 496 | AUUACAUGGCCAAUCUC |