概括
基因 1537年
象征 CYC1
同义词 MC3DN6 | UQCR4
描述 细胞色素C1
参考 MIM:123980|HGNC:HGNC:2579|Ensembl:ENSG00000179091|HPRD:00480|Vega:Otthumg00000165242
基因类型 蛋白质编码
地图位置 8Q24.3
Pascal P值 0.778
Sherlock P值 0.931
胎儿β -0.642
DMG 2(#研究)
支持 G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA
g2cdb.humanpsd
G2CDB.HUMANPSP

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
DMG:Vaneijk_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 3
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 3

第一节遗传学和表观遗传学注释

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG21765577 8 145150022 CYC1 2.36E-5 -0.21 0.017 DMG:Wockner_2014
CG03576425 8 145151285 CYC1 9.88e-5 0.301 0.028 DMG:Wockner_2014
CG02868338 8 145133133 CYC1 2.665E-4 4.917 DMG:Vaneijk_2014


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C1orf175 0.62 0.68
NTN5 0.59 0.60
Malat1 0.58 0.64
UAP1L1 0.58 0.62
C15orf52 0.58 0.59
RYR1 0.57 0.63
CCDC88B 0.57 0.61
C9orf31 0.57 0.57
MUC5B 0.57 0.65
PNPLA7 0.56 0.55
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
mettl9 -0.48 -0.58
ASNSD1 -0.47 -0.52
TSG101 -0.47 -0.54
ZCCHC10 -0.47 -0.54
PDCD2 -0.46 -0.56
C11orf57 -0.46 -0.56
PAIP1 -0.46 -0.53
polb -0.46 -0.54
polr2b -0.46 -0.51
txnl1 -0.46 -0.55

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG氧化磷酸化 135 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg心肌收缩 80 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg阿尔茨海默氏病 169 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg帕金森氏病 133 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kegg Huntingtons病 185 109 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 141 85 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组线粒体蛋白进口 58 24 该途径中的所有SZGR 2.0基因
蛋白质的反应组代谢 518 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome呼吸电子传输 79 44 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 98 56 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Onken Uveal黑色素瘤 783 507 该途径中的所有SZGR 2.0基因
casorelli急性临时细胞白血病DN 663 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
deurig t细胞促进性白血病 368 234 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vecchi胃癌先进与早期DN 138 70 该途径中的所有SZGR 2.0基因
vecchi胃癌早期 430 232 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴里斯甲状腺癌 23 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向 169 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
MYC增强的Schlosser血清反应 108 74 该途径中的所有SZGR 2.0基因
patil肝癌 747 453 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Stark前额叶皮层22Q11删除DN 517 309 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON 157 87 该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索B淋巴细胞网络 143 96 该途径中的所有SZGR 2.0基因
史密斯·泰特(Smith Tert) 145 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 151 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Voxphos 87 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
霍夫曼细胞淋巴瘤DN 39 29 该途径中的所有SZGR 2.0基因
纳德勒肥胖DN 48 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kayo卡路里限制肌肉DN 87 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
伯顿成生成5 126 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kaab心脏中心与心室DN 261 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因
WELCSH BRCA1靶向DN 141 92 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 281 179 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿隆索转移 198 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha PGC 420 269 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Aguirre胰腺癌复制号 298 174 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up 756 494 该途径中的所有SZGR 2.0基因
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 682 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim所有疾病Calb1 Corr Up 548 370 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Li DCP2绑定mRNA 89 57 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Johnstone Parvb目标2 DN 336 211 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2靶向DN 882 538 该途径中的所有SZGR 2.0基因