基因页:CYC1
概括?
基因 | 1537年 |
象征 | CYC1 |
同义词 | MC3DN6 | UQCR4 |
描述 | 细胞色素C1 |
参考 | MIM:123980|HGNC:HGNC:2579|Ensembl:ENSG00000179091|HPRD:00480|Vega:Otthumg00000165242 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 8Q24.3 |
Pascal P值 | 0.778 |
Sherlock P值 | 0.931 |
胎儿β | -0.642 |
DMG | 2(#研究) |
支持 | G2CDB.HUMAN_MITOCHONDRIA g2cdb.humanpsd G2CDB.HUMANPSP |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
DMG:Vaneijk_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括432个差异甲基化的CpG位点,对应于精神分裂症患者(n = 260)和未受影响的对照(n = 250)之间的391个独特的转录本。 | 3 |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 3 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG21765577 | 8 | 145150022 | CYC1 | 2.36E-5 | -0.21 | 0.017 | DMG:Wockner_2014 |
CG03576425 | 8 | 145151285 | CYC1 | 9.88e-5 | 0.301 | 0.028 | DMG:Wockner_2014 |
CG02868338 | 8 | 145133133 | CYC1 | 2.665E-4 | 4.917 | DMG:Vaneijk_2014 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYC1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C1orf175 | 0.62 | 0.68 |
NTN5 | 0.59 | 0.60 |
Malat1 | 0.58 | 0.64 |
UAP1L1 | 0.58 | 0.62 |
C15orf52 | 0.58 | 0.59 |
RYR1 | 0.57 | 0.63 |
CCDC88B | 0.57 | 0.61 |
C9orf31 | 0.57 | 0.57 |
MUC5B | 0.57 | 0.65 |
PNPLA7 | 0.56 | 0.55 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
mettl9 | -0.48 | -0.58 |
ASNSD1 | -0.47 | -0.52 |
TSG101 | -0.47 | -0.54 |
ZCCHC10 | -0.47 | -0.54 |
PDCD2 | -0.46 | -0.56 |
C11orf57 | -0.46 | -0.56 |
PAIP1 | -0.46 | -0.53 |
polb | -0.46 | -0.54 |
polr2b | -0.46 | -0.51 |
txnl1 | -0.46 | -0.55 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG氧化磷酸化 | 135 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg心肌收缩 | 80 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg阿尔茨海默氏病 | 169 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg帕金森氏病 | 133 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg Huntingtons病 | 185 | 109 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome TCA循环和呼吸电子传输 | 141 | 85 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组线粒体蛋白进口 | 58 | 24 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
蛋白质的反应组代谢 | 518 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome呼吸电子传输 | 79 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组呼吸电子传输ATP通过化学含量耦合和热量产生通过解偶联蛋白来合成 | 98 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Onken Uveal黑色素瘤 | 783 | 507 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
casorelli急性临时细胞白血病DN | 663 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
deurig t细胞促进性白血病 | 368 | 234 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Vecchi胃癌先进与早期DN | 138 | 70 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期 | 430 | 232 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴里斯甲状腺癌 | 23 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
McBryan Pubertal TGFB1靶向 | 169 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
MYC增强的Schlosser血清反应 | 108 | 74 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
patil肝癌 | 747 | 453 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Stark前额叶皮层22Q11删除DN | 517 | 309 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌8Q23 Q24 AMPLICON | 157 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
巴索B淋巴细胞网络 | 143 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
史密斯·泰特(Smith Tert) | 145 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Flechner PBL肾脏移植OK vs捐助者 | 151 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Voxphos | 87 | 51 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
霍夫曼细胞淋巴瘤DN | 39 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo卡路里限制肌肉DN | 87 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伯顿成生成5 | 126 | 78 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kaab心脏中心与心室DN | 261 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
WELCSH BRCA1靶向DN | 141 | 92 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Heller HDAC靶向由甲基化DN沉默 | 281 | 179 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿隆索转移 | 198 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha PGC | 420 | 269 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病少突胶质细胞编号corr up | 756 | 494 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
金双相情感障碍少突胶质细胞密度相关 | 682 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim所有疾病Calb1 Corr Up | 548 | 370 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Li DCP2绑定mRNA | 89 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Johnstone Parvb目标2 DN | 336 | 211 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2靶向DN | 882 | 538 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |