概括
基因 153830
象征 RNF145
同义词 -
描述 环手指蛋白145
参考 HGNC:HGNC:20853|ENSEMBL:ENSG00000145860|HPRD:08113|Vega:Otthumg00000130306
基因类型 蛋白质编码
地图位置 5q33.3
Pascal P值 7.397E-5
Sherlock P值 0.009
胎儿β 0.528
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.0032
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01718
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00459

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS17788483 CHR20 49379810 RNF145 153830 0.17 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005515 蛋白质结合 IEA -
去:0008270 锌离子结合 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0016020 IEA -
GO:0016021 膜不可或缺 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
Corre多发性骨髓瘤 74 45 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与基础DN 455 304 该途径中的所有SZGR 2.0基因
乳腺癌腔与间充质DN 460 312 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂黄色DN的反应 23 15 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gargalovic对氧化磷脂的反应绿色DN 25 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
狮子转移 539 324 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Ramalho Stemness 206 118 该途径中的所有SZGR 2.0基因
道格拉斯BMI1靶向 566 371 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Creighton内分泌疗法抗性3 720 440 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sarrio上皮间质转变DN 154 101 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mir34b和Mir34C的丰田目标 463 262 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vantveer乳腺癌ESR1 DN 240 153 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标36hr 221 150 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标60小时 293 203 该途径中的所有SZGR 2.0基因
张TLX目标 108 78 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chicas RB1靶向低血清 100 51 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-1/206 111 118 1A,M8 HSA-MIR-1 Uggaauguaaagaaguaugua
HSA-MIR-206SZ Uggaauguaaggaagugugugg
HSA-MIR-613 aggaauguucuuugcc
mir-130/301 910 916 M8 HSA-MIR-130A cagugcaauguaaaaggggau
HSA-MIR-301 cagugcaauaugucaaagc
HSA-MIR-130b Cagugcaaugaagggauggau
HSA-MIR-454-3P uagugcaauauugcuuauaggguuu
mir-141/200a 888 895 1A,M8 HSA-MIR-141 uaacacugucugugugugugaugg
HSA-MIR-200A uaacacugucuguguguguaaacgaugu
mir-181 1229 1235 M8 HSA-MIR-181A aacauucaacgcugucggugagu
HSA-MIR-181BSZ aacauucauugcugucggggg
HSA-MIR-181C aacauucaaccugucggugagu
HSA-MIR-181D aacauucauuguugucggggguggguu
mir-19 909 915 M8 HSA-MIR-19A ugugcaaauaugauaugaaaacuga
HSA-MIR-19B ugugcaaauccaugcaaaacuga
mir-208 1234 1240 1a HSA-MIR-208 auaagacgaaaaaagcuugu
mir-223 1214 1220 1a HSA-MIR-223 ugucuuugucaauacccc
mir-362 1001 1007 M8 HSA-MIR-362 aauccuuggaaccuaggugugugugugugagu
mir-377 739 746 1A,M8 HSA-MIR-377 aucacacaaaggaacuuuuugu
mir-409-3p 1027 1033 1a HSA-MIR-409-3P cgauauguugcucggugaaccccu
mir-485-3p 936 942 M8 HSA-MIR-485-3P gucauacgggcucucucucucucu
mir-495 709 715 1a HSA-MIR-495 Aaacaaacauggugcacuuuuu
mir-499 1234 1240 1a HSA-MIR-499 uuaagacuugcagugauguuaa