概括
基因 154743
象征 C7orf60
同义词 -
描述 染色体7开放阅读框60
参考 HGNC:HGNC:26475|ENSEMBL:ENSG00000164603|HPRD:08108|Vega:Otthumg00000155233
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7q31.1
Pascal P值 0.497
TADA P值 0.009
主持人 前扣带回皮层BA24
迈尔斯的顺式和跨性别
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
C7orf60 CHR7 112461833 t C NM_152556 p.395y> c 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014
C7orf60 CHR7 112579790 C G NM_152556 p.6g> r 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS843350 CHR3 183946273 C7orf60 154743 0.12 反式
RS16836102 CHR4 4716366 C7orf60 154743 0.05 反式
RS10248098 7 111636575 C7orf60 ENSG00000164603.7 1.55381E-6 0.04 943396 gtex_brain_ba24
RS34645464 7 111638306 C7orf60 ENSG00000164603.7 1.44782E-6 0.04 941665 gtex_brain_ba24

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
米利假足 518 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Linsley mir16目标 206 127 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ewsr1 fli1融合的骨靶标 271 165 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Delacroix Rar Bound ES 462 273 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Krieg缺氧不是通过KDM3A 770 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
rao由SALL4同工型B绑定 517 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 1839年 928 该途径中的所有SZGR 2.0基因