基因页:C7orf60
概括?
基因 | 154743 |
象征 | C7orf60 |
同义词 | - |
描述 | 染色体7开放阅读框60 |
参考 | HGNC:HGNC:26475|ENSEMBL:ENSG00000164603|HPRD:08108|Vega:Otthumg00000155233 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q31.1 |
Pascal P值 | 0.497 |
TADA P值 | 0.009 |
主持人 | 前扣带回皮层BA24 迈尔斯的顺式和跨性别 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C7orf60 | CHR7 | 112461833 | t | C | NM_152556 | p.395y> c | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 | ||
C7orf60 | CHR7 | 112579790 | C | G | NM_152556 | p.6g> r | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS843350 | CHR3 | 183946273 | C7orf60 | 154743 | 0.12 | 反式 | ||
RS16836102 | CHR4 | 4716366 | C7orf60 | 154743 | 0.05 | 反式 | ||
RS10248098 | 7 | 111636575 | C7orf60 | ENSG00000164603.7 | 1.55381E-6 | 0.04 | 943396 | gtex_brain_ba24 |
RS34645464 | 7 | 111638306 | C7orf60 | ENSG00000164603.7 | 1.44782E-6 | 0.04 | 941665 | gtex_brain_ba24 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/C7orf60_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
米利假足 | 518 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Linsley mir16目标 | 206 | 127 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ewsr1 fli1融合的骨靶标 | 271 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Delacroix Rar Bound ES | 462 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Krieg缺氧不是通过KDM3A | 770 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
rao由SALL4同工型B绑定 | 517 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |