概括
基因 155185
象征 AMZ1
同义词 -
描述 天生家族金属肽酶1
参考 MIM:615168|HGNC:HGNC:22231|Ensembl:ENSG00000174945|HPRD:17232|Vega:Otthumg00000152111
基因类型 蛋白质编码
地图位置 7p22.3
Pascal P值 0.058
胎儿β -0.553
DMG 1(#研究)
主持人 尾状基底神经节
小脑半球
伏隔核基底神经节
梭子基底神经节
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
DMG:Wockner_2014 全基因组DNA甲基化分析 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 2
DNM:Fromer_2014 整个外显子组测序分析 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
AMZ1 CHR7 2752420 G 一种 NM_133463 p.469d> n 错过 精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@差异甲基化基因

探测 染色体 位置 最近的基因 p(dis) beta(dis) fdr(dis) 学习
CG06951352 7 2740160 AMZ1 1.432E-4 0.339 0.031 DMG:Wockner_2014
CG15847926 7 2749597 AMZ1 3.26E-4 -0.39 0.04 DMG:Wockner_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS798468 7 2743283 AMZ1 ENSG00000174945.9 9.66844e-7 0.03 24127 gtex_brain_putamen_basal
RS35736244 7 2745766 AMZ1 ENSG00000174945.9 1.23029E-6 0.03 26610 gtex_brain_putamen_basal
RS4721976 7 2749149 AMZ1 ENSG00000174945.9 1.37386E-6 0.03 29993 gtex_brain_putamen_basal

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon 38 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Iwanaga癌变由Kras Pten DN 353 226 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C D 139 95 该途径中的所有SZGR 2.0基因
陈代谢综合征网络 1210 725 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应6小时 229 149 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Dutertre雌二醇反应24小时 324 193 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 211 131 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 281 183 该途径中的所有SZGR 2.0基因