基因页:AMZ1
概括?
基因 | 155185 |
象征 | AMZ1 |
同义词 | - |
描述 | 天生家族金属肽酶1 |
参考 | MIM:615168|HGNC:HGNC:22231|Ensembl:ENSG00000174945|HPRD:17232|Vega:Otthumg00000152111 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7p22.3 |
Pascal P值 | 0.058 |
胎儿β | -0.553 |
DMG | 1(#研究) |
主持人 | 尾状基底神经节 小脑半球 伏隔核基底神经节 梭子基底神经节 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
DMG:Wockner_2014 | 全基因组DNA甲基化分析 | 该数据集包括4641个差异甲基化探针,对应于精神分裂症患者(n = 24)和对照组(n = 24)之间的2929个独特基因。 | 2 |
DNM:Fromer_2014 | 整个外显子组测序分析 | 这项研究报道了WES对623个精神分裂症三重奏的研究,该研究使用基因组DNA报告了DNM。 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AMZ1 | CHR7 | 2752420 | G | 一种 | NM_133463 | p.469d> n | 错过 | 精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
差异甲基化基因
探测 | 染色体 | 位置 | 最近的基因 | p(dis) | beta(dis) | fdr(dis) | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CG06951352 | 7 | 2740160 | AMZ1 | 1.432E-4 | 0.339 | 0.031 | DMG:Wockner_2014 |
CG15847926 | 7 | 2749597 | AMZ1 | 3.26E-4 | -0.39 | 0.04 | DMG:Wockner_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS798468 | 7 | 2743283 | AMZ1 | ENSG00000174945.9 | 9.66844e-7 | 0.03 | 24127 | gtex_brain_putamen_basal |
RS35736244 | 7 | 2745766 | AMZ1 | ENSG00000174945.9 | 1.23029E-6 | 0.03 | 26610 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4721976 | 7 | 2749149 | AMZ1 | ENSG00000174945.9 | 1.37386E-6 | 0.03 | 29993 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/AMZ1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23岁)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7p22 Amplicon | 38 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Iwanaga癌变由Kras Pten DN | 353 | 226 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C D | 139 | 95 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应6小时 | 229 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Dutertre雌二醇反应24小时 | 324 | 193 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1目标不是通过AKT1向上的 | 211 | 131 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BHAT ESR1通过AKT1 UP目标 | 281 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |