基因页:CYP2C9
概括?
基因 | 1559年 |
象征 | CYP2C9 |
同义词 | CPC9 | CYP2C | CYP2C10 | CYPIIC9 | P450IIC9 |
描述 | 细胞色素P450家族2亚家族C成员9 |
参考 | MIM:601130|HGNC:HGNC:2623|ENSEMBL:ENSG00000138109|HPRD:03084|Vega:Otthumg0000000018805 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q24 |
Pascal P值 | 0.691 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP2C9_DE_GTEx.png)
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
Arpp-21 | 0.80 | 0.85 |
TMEM145 | 0.77 | 0.77 |
SLC26A8 | 0.76 | 0.76 |
PARP2 | 0.74 | 0.73 |
SNX32 | 0.72 | 0.71 |
OR2W3 | 0.72 | 0.81 |
R3HDM1 | 0.72 | 0.79 |
ZFR2 | 0.71 | 0.78 |
CCDC64 | 0.71 | 0.74 |
C3orf62 | 0.71 | 0.69 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
MT-CO2 | -0.58 | -0.54 |
AF347015.31 | -0.57 | -0.53 |
AF347015.8 | -0.57 | -0.53 |
AF347015.33 | -0.56 | -0.50 |
AF347015.26 | -0.56 | -0.53 |
AF347015.2 | -0.56 | -0.52 |
mt-cyb | -0.55 | -0.51 |
AF347015.27 | -0.55 | -0.51 |
AF347015.15 | -0.55 | -0.51 |
AF347015.21 | -0.53 | -0.52 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
GO:0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
GO:0016712 | 氧化还原酶的活性,作用于配对供体,并掺入或还原分子氧,黄蛋白或黄素蛋白作为一个供体,并掺入一个氧气原子 | IEA | - | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0018675 | (S) - 柠檬烯6-千氧酶活性 | IEA | - | |
GO:0018676 | (S) - 丙烯7-千氧酶活性 | IEA | - | |
GO:0033767 | 4-羟基乙烯酮单加氧酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0055114 | 还原氧化 | nas | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005792 | 微型体 | 塔斯 | 2827463|3032244 | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | nas | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG亚油酸代谢 | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg视黄醇代谢 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组异生物学 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应生活 | 485 | 293 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王攀登目标 | 269 | 146 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
vecchi胃癌早期DN | 367 | 220 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
周的炎症反应fima | 544 | 308 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
XU HGF靶向Akt1 DN抑制 | 95 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tarte浆细胞与Plasmablast向上 | 398 | 262 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kayo衰老的肌肉 | 244 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |