基因页:CYP2E1
概括?
基因 | 1571年 |
象征 | CYP2E1 |
同义词 | CPE1 | CYP2E | P450-J | P450C2E |
描述 | 细胞色素P450家族2亚家族E成员1 |
参考 | MIM:124040|HGNC:HGNC:2631|Ensembl:ENSG00000130649|HPRD:11813|Vega:Otthumg0000000019322 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q26.3 |
Pascal P值 | 0.079 |
Sherlock P值 | 0.717 |
胎儿β | -0.661 |
主持人 | 皮质 梭子基底神经节 迈尔斯的顺式和跨性别 元 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10857731 | Chr10 | 135328359 | CYP2E1 | 1571年 | 0.14 | 顺式 | ||
RS633915 | CHR1 | 182682157 | CYP2E1 | 1571年 | 0.15 | 反式 | ||
RS621071 | CHR1 | 182682810 | CYP2E1 | 1571年 | 0 | 反式 | ||
RS9419072 | 10 | 135310445 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.02E-6 | 0 | -23465 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1854458 | 10 | 135313815 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.02E-6 | 0 | -20095 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9418982 | 10 | 135320622 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.02E-6 | 0 | -13288 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9418984 | 10 | 135322356 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.506E-6 | 0 | -11554 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7083073 | 10 | 135322956 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -10954 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7092634 | 10 | 135322977 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -10933 | gtex_brain_putamen_basal |
RS6537609 | 10 | 135323084 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -10826 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7911139 | 10 | 135323525 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 4.576E-9 | 0 | -10385 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7077457 | 10 | 135324370 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -9540 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9418987 | 10 | 135324409 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.483E-6 | 0 | -9501 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7096203 | 10 | 135324505 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -9405 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7096321 | 10 | 135324536 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -9374 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10857730 | 10 | 135326822 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 4.311E-9 | 0 | -7088 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9419079 | 10 | 135326985 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.016E-7 | 0 | -6925 | gtex_brain_putamen_basal |
RS10776685 | 10 | 135327317 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -6593 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1581934 | 10 | 135327410 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -6500 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7095379 | 10 | 135328532 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -5378 | gtex_brain_putamen_basal |
RS7095996 | 10 | 135328948 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.052e-9 | 0 | -4962 | gtex_brain_putamen_basal |
RS11815623 | 10 | 135329133 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.027E-9 | 0 | -4777 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2026047 | 10 | 135329616 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.149E-6 | 0 | -4294 | gtex_brain_putamen_basal |
RS751945 | 10 | 135329939 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.974E-9 | 0 | -3971 | gtex_brain_putamen_basal |
RS751946 | 10 | 135330104 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.701E-12 | 0 | -3806 | gtex_brain_putamen_basal |
RS9418990 | 10 | 135337966 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 6.895E-7 | 0 | 4056 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2070673 | 10 | 135340567 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 5.563e-7 | 0 | 6657 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1536828 | 10 | 135342315 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.315E-6 | 0 | 8405 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8192770 | 10 | 135342644 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 3.089E-6 | 0 | 8734 | gtex_brain_putamen_basal |
RS8192776 | 10 | 135348187 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 3.366E-6 | 0 | 14277 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2480257 | 10 | 135352509 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 2.871E-6 | 0 | 18599 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4363513 | 10 | 135355534 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.779E-7 | 0 | 21624 | gtex_brain_putamen_basal |
RS4240522 | 10 | 135355557 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.7E-7 | 0 | 21647 | gtex_brain_putamen_basal |
RS1536826 | 10 | 135357239 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 3.352E-7 | 0 | 23329 | gtex_brain_putamen_basal |
RS3020513 | 10 | 135364915 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 1.076E-6 | 0 | 31005 | gtex_brain_putamen_basal |
RS2987785 | 10 | 135365003 | CYP2E1 | ENSG00000130649.5 | 6.522e-7 | 0 | 31093 | gtex_brain_putamen_basal |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP2E1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
TNFSF13 | 0.87 | 0.81 |
GPR143 | 0.86 | 0.82 |
PRDX6 | 0.84 | 0.76 |
GJB6 | 0.84 | 0.81 |
TAPBPL | 0.83 | 0.78 |
SNTA1 | 0.82 | 0.81 |
TMBIM1 | 0.81 | 0.81 |
NDRG2 | 0.81 | 0.84 |
agxt2l1 | 0.81 | 0.82 |
ephx1 | 0.80 | 0.80 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
BLMH | -0.57 | -0.69 |
RTF1 | -0.57 | -0.68 |
Nova2 | -0.56 | -0.70 |
RNF40 | -0.56 | -0.69 |
heatr5b | -0.56 | -0.67 |
nkiras2 | -0.56 | -0.71 |
PJA1 | -0.56 | -0.69 |
NOL4 | -0.55 | -0.70 |
BASP1 | -0.55 | -0.68 |
TOPBP1 | -0.55 | -0.66 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
Kegg蛛网膜酸代谢 | 58 | 36 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG亚油酸代谢 | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Biocarta核途径 | 15 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组异生物学 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
GAZDA钻石黑芬贫血红斑dn | 493 | 298 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名1 DN | 242 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mullighan MLL签名2 DN | 281 | 186 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌 | 1821年 | 933 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
lastowska神经母细胞瘤副本编号dn | 800 | 473 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
里克曼头颈癌E | 89 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌电纤维酸DN | 66 | 43 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Myc E2F1 DN | 64 | 38 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee Liver Cancer Dena DN | 74 | 45 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee肝癌E2F1 DN | 64 | 42 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yao Hoxa10通过孕酮靶向 | 79 | 58 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
纳德勒肥胖DN | 48 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nguyen Notch1靶向DN | 86 | 67 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
NPM1突变DN的Verhaak AML | 246 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
伊万诺娃造血干细胞 | 254 | 164 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Browne HCMV感染18小时 | 178 | 111 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
杰克逊DNMT1靶向 | 77 | 57 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Col13a1 DN抑制Tuomisto肿瘤 | 17 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李肝癌 | 49 | 29 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
iwanaga癌变由KRAS DN | 120 | 81 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌DN | 540 | 340 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌,H3K27me3 UP | 295 | 149 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Acevedo肝癌与H3K9me3 UP | 141 | 75 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smid乳腺癌基础DN | 701 | 446 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
CADWELL ATG16L1靶向 | 93 | 56 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
炎症反应和胆固醇DN | 12 | 7 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
甜肺癌Kras DN | 435 | 289 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌良好生存A12 | 317 | 177 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
陈代谢综合征网络 | 1210 | 725 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌子类CTNNB1 UP | 176 | 110 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带有Inv 16易位 | 422 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML与T 9 11易位 | 130 | 87 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤课程DN | 210 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤的生存率差 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
YAO对孕酮簇5的时间反应5 | 30 | 22 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |