基因页:CYP3A5
概括?
基因 | 1577年 |
象征 | CYP3A5 |
同义词 | cp35 | cypiiia5 | p450pcn3 | pcn3 |
描述 | 细胞色素P450家族3亚家族成员5 |
参考 | MIM:605325|HGNC:HGNC:2638|ENSEMBL:ENSG00000106258|HPRD:05617|Vega:Otthumg00000156724 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 7q21.1 |
Pascal P值 | 0.532 |
胎儿β | -0.043 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
ADT:SUN_2012 | 系统研究抗精神病药及其靶标 | 共有382个药物目标关联涉及43种抗精神病药和49个靶基因。 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP3A5_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CCDC57 | 0.80 | 0.74 |
MAMDC4 | 0.80 | 0.69 |
CNKSR1 | 0.79 | 0.73 |
vars2 | 0.79 | 0.72 |
PCDH24 | 0.78 | 0.70 |
Adamts10 | 0.76 | 0.71 |
JMJD7-PLA2G4B | 0.76 | 0.73 |
AC013416.1 | 0.76 | 0.70 |
CEACAM19 | 0.76 | 0.70 |
PTCH2 | 0.76 | 0.72 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
HLA-C | -0.50 | -0.53 |
FAM162A | -0.49 | -0.50 |
ABCG2 | -0.49 | -0.52 |
AF347015.31 | -0.47 | -0.50 |
ACOT13 | -0.47 | -0.47 |
PLA2G4A | -0.46 | -0.49 |
HLA-F | -0.46 | -0.44 |
AF347015.27 | -0.46 | -0.49 |
lactb2 | -0.46 | -0.48 |
SLC39A8 | -0.46 | -0.48 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
去:0004497 | 单加氧酶活性 | IEA | - | |
GO:0019825 | 氧结合 | 塔斯 | 2732228 | |
GO:0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
GO:0050381 | 非特异性单加氧酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0008202 | 类固醇代谢过程 | 塔斯 | 2732228 | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005792 | 微型体 | 塔斯 | 2732228 | |
去:0005789 | 内质网膜 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | IEA | - | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG类固醇激素生物合成 | 55 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG亚油酸代谢 | 29 | 16 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kegg视黄醇代谢 | 64 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
细胞色素P450的异种生物的KEGG代谢 | 70 | 44 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢细胞色素P450 | 72 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KEGG药物代谢其他酶 | 51 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组异生物学 | 16 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
刘前列腺癌DN | 481 | 290 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
KIM对TSA和Decitabine的反应 | 129 | 73 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Borczuk恶性间皮瘤DN | 104 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Nikolsky乳腺癌7Q21 Q22 AMPLICON | 76 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LEI MYB目标 | 318 | 215 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kaab失败的心房 | 38 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1 | 419 | 273 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Creighton内分泌疗法抗性3 | 720 | 440 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hillion HMGA1B目标 | 92 | 68 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
海勒被甲基化沉默 | 282 | 183 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多的正常组织与肝肿瘤相邻 | 174 | 96 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝癌 | 973 | 570 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿塞维多肝肿瘤与正常的邻近组织DN | 274 | 165 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Aguirre胰腺癌复制号 | 298 | 174 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤DN | 267 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chicas RB1靶向衰老 | 572 | 352 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向DN | 553 | 343 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第一egf脉冲瞬时向上 | 1839年 | 928 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |