概括
基因 158038
象征 Lingo2
同义词 leern3 | lrrn6c
描述 含亮氨酸丰富的重复和IG结构域包含2
参考 MIM:609793|HGNC:HGNC:21207|ENSEMBL:ENSG00000174482|HPRD:08715|Vega:Otthumg0000000019721
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p21.2
胎儿β -1.074
主持人 小脑半球
小脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@DNM表

基因 染色体 位置 参考 alt 成绩单 AA更改 突变类型 CG46 特征 学习
Lingo2 Chr9 27949137 C t NM_001258282
NM_152570

沉默的
沉默的
精神分裂症 DNM:Fromer_2014

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS10968120 Chr9 27804539 Lingo2 158038 0.09 顺式
RS6446945 CHR4 71791501 Lingo2 158038 0.03 反式
RS7760808 CHR6 48481947 Lingo2 158038 0.12 反式
RS9343156 CHR6 75130735 Lingo2 158038 0.19 反式
RS6118558 CHR20 9263913 Lingo2 158038 0.18 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 940 425 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boylan多发性骨髓瘤C DN 59 39 该途径中的所有SZGR 2.0基因
APC和MBD2的Phesse目标 20 14 该途径中的所有SZGR 2.0基因