基因页:Lingo2
概括?
基因 | 158038 |
象征 | Lingo2 |
同义词 | leern3 | lrrn6c |
描述 | 含亮氨酸丰富的重复和IG结构域包含2 |
参考 | MIM:609793|HGNC:HGNC:21207|ENSEMBL:ENSG00000174482|HPRD:08715|Vega:Otthumg0000000019721 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 9p21.2 |
胎儿β | -1.074 |
主持人 | 小脑半球 小脑 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
CV:GWASDB | 全基因组关联研究 | 精神分裂症的GWASDB记录 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS |
第一节遗传学和表观遗传学注释
DNM表
基因 | 染色体 | 位置 | 参考 | alt | 成绩单 | AA更改 | 突变类型 | 筛 | CG46 | 特征 | 学习 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Lingo2 | Chr9 | 27949137 | C | t | NM_001258282 NM_152570 |
。 。 |
沉默的 沉默的 |
精神分裂症 | DNM:Fromer_2014 |
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS10968120 | Chr9 | 27804539 | Lingo2 | 158038 | 0.09 | 顺式 | ||
RS6446945 | CHR4 | 71791501 | Lingo2 | 158038 | 0.03 | 反式 | ||
RS7760808 | CHR6 | 48481947 | Lingo2 | 158038 | 0.12 | 反式 | ||
RS9343156 | CHR6 | 75130735 | Lingo2 | 158038 | 0.19 | 反式 | ||
RS6118558 | CHR20 | 9263913 | Lingo2 | 158038 | 0.18 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/LINGO2_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
肝癌DN中的阿塞维多甲基化 | 940 | 425 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boylan多发性骨髓瘤C DN | 59 | 39 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
APC和MBD2的Phesse目标 | 20 | 14 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |