概括
基因 158326
象征 Frem1
同义词 bnar | c9orf143 | c9orf145 | c9orf154 | mota | tilrr | trigno2
描述 FRAS1相关的细胞外基质1
参考 MIM:608944|HGNC:HGNC:23399|ENSEMBL:ENSG00000164946|HPRD:09865|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 9p22.3
Pascal P值 0.378
胎儿β -0.637
主持人 皮质
额叶皮质BA9
下丘脑
迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
CV:GWASDB 全基因组关联研究 精神分裂症的GWASDB记录
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS12129892 CHR1 24749376 Frem1 158326 0.18 反式
RS16829545 CHR2 151977407 Frem1 158326 0 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
NUP98 HOXA9 Fusion 3D的Takeda目标 182 110 该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先 430 288 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zheng IL22发出信号 56 36 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoelzel NF1靶向DN 115 73 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA ECM有关联 171 89 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA女性相关 753 411 该途径中的所有SZGR 2.0基因
NABA矩阵 1028 559 该途径中的所有SZGR 2.0基因