基因页:CYP17A1
概括?
基因 | 1586年 |
象征 | CYP17A1 |
同义词 | CPT7 | CYP17 | P450C17 | S17AH |
描述 | 细胞色素P450家族17亚家族成员1 |
参考 | MIM:609300|HGNC:HGNC:2593|Ensembl:ENSG00000148795|HPRD:01944|Vega:Otthumg0000000018969 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 10q24.3 |
Pascal P值 | 1E-12 |
胎儿β | -0.208 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
简历:Gwascat | 全基因组关联研究 | 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。 | |
简历:PGC128 | 全基因组协会研究 | 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会 | |
简历:PGCNP | 全基因组协会研究 | GWAS | |
LK:是的 | 全基因组协会研究 | 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP | |
go_annotation | 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 | 与神经相关关键字的命中:2 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
简历:PGC128
SNP ID | 染色体 | 位置 | 等位基因 | p | 功能 | 基因 | 向上/向下距离 |
---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11191419 | Chr10 | 104612335 | 在 | 9.235e-18 | 基因间 | CYP17A1,BORCS7 | dist = 15045; dist = 1632 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP17A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域没有共表达基因
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
去:0004497 | 单加氧酶活性 | IEA | - | |
去:0004508 | 类固醇17-α-单氧酶活性 | 经验 | 10406467 | |
去:0004508 | 类固醇17-α-单氧酶活性 | 塔斯 | 1347802 | |
GO:0019825 | 氧结合 | 塔斯 | 2808364 | |
GO:0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0007548 | 性别差异 | 塔斯 | 9326943 | |
去:0006704 | 糖皮质激素生物合成过程 | IEA | - | |
去:0006700 | C21-甾体激素生物合成过程 | IEA | - | |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0043025 | 细胞体 | IEA | Axon,Dendrite(GO期限:4) | - |
GO:0030424 | 轴突 | IEA | 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) | - |
去:0005789 | 内质网膜 | 经验 | 10406467 | |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005783 | 内质网 | nas | 9326943 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG类固醇激素生物合成 | 55 | 30 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 | 35 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组雄激素生物合成 | 10 | 8 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组内源性固醇 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组类固醇激素 | 29 | 21 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
ENK UV响应角质形成细胞 | 530 | 342 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Perez TP53目标 | 1174 | 695 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 | 70 | 37 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shen Smarca2靶向DN | 357 | 212 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn | 546 | 351 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
durchdewald皮肤致癌 | 88 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
马丁内斯RB1靶向 | 673 | 430 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez TP53目标DN | 593 | 372 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Martinez RB1和TP53靶向DN | 591 | 366 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bochkis foxa2目标 | 425 | 261 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Matzuk男性繁殖Sertoli | 28 | 23 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yoshimura mapk8靶向 | 1305 | 895 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K27ME3 | 29 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
双龙血清敏感基因 | 90 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Bilanges血清反应翻译 | 37 | 20 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 | 1725年 | 838 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |