概括
基因 1586年
象征 CYP17A1
同义词 CPT7 | CYP17 | P450C17 | S17AH
描述 细胞色素P450家族17亚家族成员1
参考 MIM:609300|HGNC:HGNC:2593|Ensembl:ENSG00000148795|HPRD:01944|Vega:Otthumg0000000018969
基因类型 蛋白质编码
地图位置 10q24.3
Pascal P值 1E-12
胎儿β -0.208

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
简历:Gwascat 全基因组关联研究 该数据集包括与精神分裂症相关的560个SNP。总共将486个基因映射到50kb内的这些SNP。
简历:PGC128 全基因组协会研究 多达36,989例和113,075个对照的多阶段精神分裂症GWA。由PGC的精神分裂症工作组报告。128个跨越108个基因座的独立协会
简历:PGCNP 全基因组协会研究 GWAS
LK:是的 全基因组协会研究 该数据集包括映射到22个区域的99个基因。CV:RIPKE_2013中还包括24个领先的SNP
go_annotation 将与神经相关的关键字映射到基因本体论注释 与神经相关关键字的命中:2

第一节遗传学和表观遗传学注释

@简历:PGC128

SNP ID 染色体 位置 等位基因 p 功能 基因 向上/向下距离
RS11191419 Chr10 104612335 9.235e-18 基因间 CYP17A1,BORCS7 dist = 15045; dist = 1632


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域没有共表达基因


第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005506 铁离子结合 IEA -
去:0004497 单加氧酶活性 IEA -
去:0004508 类固醇17-α-单氧酶活性 经验 10406467
去:0004508 类固醇17-α-单氧酶活性 塔斯 1347802
GO:0019825 氧结合 塔斯 2808364
GO:0020037 血红素结合 IEA -
去:0009055 电子载体活动 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0007548 性别差异 塔斯 9326943
去:0006704 糖皮质激素生物合成过程 IEA -
去:0006700 C21-甾体激素生物合成过程 IEA -
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0043025 细胞体 IEA Axon,Dendrite(GO期限:4) -
GO:0030424 轴突 IEA 神经元,轴突,神经递质(GO期限:6) -
去:0005789 内质网膜 经验 10406467
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005783 内质网 nas 9326943
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG类固醇激素生物合成 55 30 该途径中的所有SZGR 2.0基因
类固醇激素和维生素A和D的反应组代谢 35 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组雄激素生物合成 10 8 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Phase1化合物的功能化 70 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组内源性固醇 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组类固醇激素 29 21 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV响应角质形成细胞 530 342 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Perez TP53目标 1174 695 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sheth肝癌与TXNIP损失PAM3 70 37 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shen Smarca2靶向DN 357 212 该途径中的所有SZGR 2.0基因
弗莱赫纳活检肾脏移植被拒绝vs ok dn 546 351 该途径中的所有SZGR 2.0基因
durchdewald皮肤致癌 88 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
马丁内斯RB1靶向 673 430 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez TP53目标DN 593 372 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martinez RB1和TP53靶向DN 591 366 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bochkis foxa2目标 425 261 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Matzuk男性繁殖Sertoli 28 23 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yoshimura mapk8靶向 1305 895 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mikkelsen MCV6 LCP带有H3K27ME3 29 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
双龙血清敏感基因 90 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Bilanges血清反应翻译 37 20 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Zwang仅通过第二EGF脉冲瞬时向上 1725年 838 该途径中的所有SZGR 2.0基因