概括
基因 1593年
象征 CYP27A1
同义词 CP27 | CTX | CYP27
描述 细胞色素P450家族27亚家族成员1
参考 MIM:606530|HGNC:HGNC:2605|Ensembl:ENSG00000135929|HPRD:05939|Vega:Otthumg0000000048238
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q35
Pascal P值 0.991
Sherlock P值 0.183
胎儿β -1.264
主持人 迈尔斯的顺式和跨性别

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.00916
gsma_iie 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) PSR:0.01016
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释

@EQTL注释

SNP ID 染色体 位置 主持人 Gene Entrez ID PVALUE QVALUE TSS距离 EQTL类型
RS11656351 CHR17 9489574 CYP27A1 1593年 0.03 反式
RS4501739 Chrx 35960848 CYP27A1 1593年 0.15 反式

第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
pofut1 0.90 0.90
ncan 0.89 0.90
ankfy1 0.88 0.89
sepn1 0.87 0.89
sec61a1 0.86 0.86
MAPK1IP1L 0.86 0.85
sall2 0.86 0.86
NLGN3 0.85 0.89
PCDHGB8P 0.85 0.89
CYFIP1 0.85 0.85
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
AF347015.21 -0.62 -0.75
MT-CO2 -0.60 -0.68
C5orf53 -0.60 -0.63
AF347015.31 -0.60 -0.67
AF347015.27 -0.58 -0.65
myl3 -0.57 -0.60
C1orf54 -0.56 -0.66
AF347015.33 -0.55 -0.61
AF347015.8 -0.55 -0.64
FXYD1 -0.55 -0.58

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005506 铁离子结合 IEA -
GO:0020037 血红素结合 IEA -
去:0008395 类固醇羟化酶活性 经验 1708392
去:0008395 类固醇羟化酶活性 塔斯 9790667
去:0009055 电子载体活动 IEA -
GO:0047749 胆固醇26-共氧酶活性 IEA -
GO:0046872 金属离子结合 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
GO:0055114 还原氧化 IEA -
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005739 线粒体 IEA -
去:0005743 线粒体内膜 IEA -
去:0005759 线粒体基质 经验 1708392
去:0016020 IEA -

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
KEGG初级胆汁酸生物合成 16 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
kegg ppar信号通路 69 47 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 27 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过7Alpha羟化胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 15 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 10 6 该途径中的所有SZGR 2.0基因
胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 19 9 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组生物氧化 139 91 该途径中的所有SZGR 2.0基因
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 51 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome Phase1化合物的功能化 70 50 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组内源性固醇 15 10 该途径中的所有SZGR 2.0基因
脂质和脂蛋白的反应组代谢 478 302 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 205 140 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 158 103 该途径中的所有SZGR 2.0基因
chebotaev gr目标 77 62 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser血清反应DN 712 443 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hatada甲基化在肺癌中 390 236 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HSIAO肝特异性基因 244 154 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lein Pons标记 89 59 该途径中的所有SZGR 2.0基因
黄线粒体基因模块 217 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha Human Mitodb 6 2002 429 260 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Mootha线粒体 447 277 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 315 201 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF的反应 418 282 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 408 276 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Chang Core血清反应DN 209 137 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Boyault肝癌子类G3 DN 51 32 该途径中的所有SZGR 2.0基因
清肝癌亚类增殖DN 179 97 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Woo肝癌复发DN 80 54 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gyorffy阿霉素耐药性 56 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hoshida肝癌亚类S3 266 180 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝脏发展DN 222 141 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BAE BRCA1靶向DN 32 27 该途径中的所有SZGR 2.0基因
棕熊UVC响应迟到 1137 655 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Lee BMP2目标 745 475 该途径中的所有SZGR 2.0基因
FEVR CTNNB1靶向 682 433 该途径中的所有SZGR 2.0基因