基因页:CYP27A1
概括?
基因 | 1593年 |
象征 | CYP27A1 |
同义词 | CP27 | CTX | CYP27 |
描述 | 细胞色素P450家族27亚家族成员1 |
参考 | MIM:606530|HGNC:HGNC:2605|Ensembl:ENSG00000135929|HPRD:05939|Vega:Otthumg0000000048238 |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q35 |
Pascal P值 | 0.991 |
Sherlock P值 | 0.183 |
胎儿β | -1.264 |
主持人 | 迈尔斯的顺式和跨性别 |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.00916 | |
gsma_iie | 基因组扫描荟萃分析(欧洲官方样品) | PSR:0.01016 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
EQTL注释
SNP ID | 染色体 | 位置 | 主持人 | Gene Entrez ID | PVALUE | QVALUE | TSS距离 | EQTL类型 |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
RS11656351 | CHR17 | 9489574 | CYP27A1 | 1593年 | 0.03 | 反式 | ||
RS4501739 | Chrx | 35960848 | CYP27A1 | 1593年 | 0.15 | 反式 |
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/CYP27A1_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
pofut1 | 0.90 | 0.90 |
ncan | 0.89 | 0.90 |
ankfy1 | 0.88 | 0.89 |
sepn1 | 0.87 | 0.89 |
sec61a1 | 0.86 | 0.86 |
MAPK1IP1L | 0.86 | 0.85 |
sall2 | 0.86 | 0.86 |
NLGN3 | 0.85 | 0.89 |
PCDHGB8P | 0.85 | 0.89 |
CYFIP1 | 0.85 | 0.85 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
AF347015.21 | -0.62 | -0.75 |
MT-CO2 | -0.60 | -0.68 |
C5orf53 | -0.60 | -0.63 |
AF347015.31 | -0.60 | -0.67 |
AF347015.27 | -0.58 | -0.65 |
myl3 | -0.57 | -0.60 |
C1orf54 | -0.56 | -0.66 |
AF347015.33 | -0.55 | -0.61 |
AF347015.8 | -0.55 | -0.64 |
FXYD1 | -0.55 | -0.58 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0005506 | 铁离子结合 | IEA | - | |
GO:0020037 | 血红素结合 | IEA | - | |
去:0008395 | 类固醇羟化酶活性 | 经验 | 1708392 | |
去:0008395 | 类固醇羟化酶活性 | 塔斯 | 9790667 | |
去:0009055 | 电子载体活动 | IEA | - | |
GO:0047749 | 胆固醇26-共氧酶活性 | IEA | - | |
GO:0046872 | 金属离子结合 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
GO:0055114 | 还原氧化 | IEA | - | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005739 | 线粒体 | IEA | - | |
去:0005743 | 线粒体内膜 | IEA | - | |
去:0005759 | 线粒体基质 | 经验 | 1708392 | |
去:0016020 | 膜 | IEA | - |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
KEGG初级胆汁酸生物合成 | 16 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
kegg ppar信号通路 | 69 | 47 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome胆汁酸和胆汁盐代谢 | 27 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过7Alpha羟化胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 15 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
通过24羟基胆固醇的胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 10 | 6 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
胆汁酸和胆汁盐的反应组合成 | 19 | 9 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组生物氧化 | 139 | 91 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
底物类型排列的Reactome细胞色素P450 | 51 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome Phase1化合物的功能化 | 70 | 50 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组内源性固醇 | 15 | 10 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
脂质和脂蛋白的反应组代谢 | 478 | 302 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Piccaluga血管免疫细胞淋巴瘤 | 205 | 140 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Smirnov在癌症中循环内皮细胞 | 158 | 103 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
chebotaev gr目标 | 77 | 62 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser血清反应DN | 712 | 443 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hatada甲基化在肺癌中 | 390 | 236 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HSIAO肝特异性基因 | 244 | 154 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lein Pons标记 | 89 | 59 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
黄线粒体基因模块 | 217 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha Human Mitodb 6 2002 | 429 | 260 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Mootha线粒体 | 447 | 277 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对CSF2RB和IL4 DN的响应 | 315 | 201 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF的反应 | 418 | 282 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Rutella对HGF与CSF2RB和IL4的反应 | 408 | 276 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Chang Core血清反应DN | 209 | 137 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Boyault肝癌子类G3 DN | 51 | 32 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
清肝癌亚类增殖DN | 179 | 97 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Woo肝癌复发DN | 80 | 54 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gyorffy阿霉素耐药性 | 56 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Hoshida肝癌亚类S3 | 266 | 180 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝脏发展DN | 222 | 141 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BAE BRCA1靶向DN | 32 | 27 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
棕熊UVC响应迟到 | 1137 | 655 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Lee BMP2目标 | 745 | 475 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
FEVR CTNNB1靶向 | 682 | 433 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |