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概括?

基因ID	1612
Symbol	DAPK1
同义词	DAPK
描述	death-associated protein kinase 1
参考	MIM：600831\|HGNC:HGNC:2674\|Ensembl：ENSG00000196730\|HPRD：02902\|Vega:OTTHUMG00000020150
基因type	protein-coding
地图位置	9Q21.33
Pascal P值	0.4
Sherlock P值	0.015
Fetal beta	0.506
DMG	2 (# studies)
支持	INTRACELLULAR SIGNAL TRANSDUCTION COMPOSITESET Darnell FMRP targets Ascano FMRP targets

数据源中的基因

基因set name	基因组方法	描述	Info
简历：PGCNP	Genome-wide Association Study	GWAS
DMG:Jaffe_2016	Genome-wide DNA methylation analysis	This dataset includes 2,104 probes/CpGs associated with SZ patients (n=108) compared to 136 controls at Bonferroni-adjusted P < 0.05.	3
DMG:Nishioka_2013	Genome-wide DNA methylation analysis	The authors investigated the methylation profiles of DNA in peripheral blood cells from 18 patients with first-episode schizophrenia (FESZ) and from 15 normal controls.	3
DNM:McCarthy_2014	Whole Exome Sequencing analysis	57个三重奏的整个外显子组测序，具有零星或家族性精神分裂症。

第一节遗传学和表观遗传学注释

DNM table

基因	Chromosome	Position	Ref	Alt	Transcript	AA change	突变类型	Sift	CG46	Trait	Study
DAPK1	chr9	90301641	C	T	NM_004938	P.N800N	synonymous SNV			精神分裂症	DNM:McCarthy_2014

Differentially methylated gene

探测	Chromosome	Position	Nearest gene	P (dis)	beta（dis）	FDR (dis)	Study
cg08797471	9	90113120	DAPK1		-0.024	0.36	DMG:Nishioka_2013
cg19734228	9	90113593	DAPK1	1.37E-9	-0.018	1.37E-6	DMG:Jaffe_2016
cg08797471	9	90113120	DAPK1	8.78e-9	-0.022	4.04E-6	DMG:Jaffe_2016

Section II. Transcriptome annotation

基因ral gene expression (GTEx)

基因expression during devlopment (BrainCloud)

脚注：
总共绘制了269个时间点，n = 38个胎儿样品（x = 1：38）。每个三角形代表一个时间点。

基因expression of temporal and spatial changes (BrainSpan)

脚注：
SC: sub-cortical regions; SM: sensory-motor regions; FC: frontal cortex; and TP: temporal-parietal cortex
ST1: fetal (13 - 26 postconception weeks), ST2: early infancy to late childhood (4 months to 11 years), and ST3: adolescence to adulthood (13 - 23 years)
The bar shown representes the lower 25% and upper 25% of the expression distribution.

大脑区域没有共表达基因

第四节。蛋白质蛋白相互作用注释

Interactors	Aliases B	Official full name B	Experimental	资源	PubMed ID
FADD	Gig3 \|MGC8528 \|Mort1	FAS（TNFRSF6）通过死亡域关联	-	HPRD，Biogrid	12911633
KRIT1	CAM \| CCM1	KRIT1, ankyrin repeat containing	Affinity Capture-Western	BioGRID	12911633
MAPK1	ERK \| ERK2 \| ERT1 \| MAPK2 \| P42MAPK \| PRKM1 \| PRKM2 \| p38 \| p40 \| p41 \| p41mapk	mitogen-activated protein kinase 1	DAPKinteracts with Erk2.	BIND	15616583
MAPK3	ERK1 \| HS44KDAP \| HUMKER1A \| MGC20180 \| P44ERK1 \|P44MAPK \| PRKM3	mitogen-activated protein kinase 3	DAPKinteracts with Erk1.	BIND	15616583
MIB1	DIP-1 \|DKFZP686I0769 \|DKFZP761M1710 \|FLJ90676 \|MGC129659 \|MGC129660 \|MIB \|zzank2 \|zzz6	mindbomb homolog 1 (Drosophila)	-	HPRD	12351649
TNFRSF1A	CD120a \| FPF \| MGC19588 \| TBP1 \| TNF-R \| TNF-R-I \| TNF-R55 \| TNFAR \| TNFR1 \| TNFR55 \| TNFR60 \| p55 \| p55-R \| p60	肿瘤坏死因子受体超家族，成员1a	-	HPRD，Biogrid	12911633
TRADD	Hs.89862 \| MGC11078	通过死亡域与TNFRSF1A相关	-	HPRD	12911633
UNC5A	FLJ16449 \|KIAA1976 \|UNC5H1	unc-5 homolog A (C. elegans)	UNC5A (UNC5H1) interacts with DAPK1 (DAPK). This interaction was modelled on a demonstrated interaction between rat UNC5H1 and human DAPK.	BIND	15729359
UNC5B	UNC5H2 \| p53RDL1	unc-5 homolog B (C. elegans)	UNC5B（UNC5H2）与DAPK1（DAPK）相互作用。这种相互作用是建立在大鼠UNC5H2和人类DAPK之间的相互作用上的模型。	BIND	15729359
UNC5C	UNC5H3	unc-5 homolog C (C. elegans)	UNC5C (UNC5H3) interacts with DAPK1 (DAPK). This interaction was modelled on a demonstrated interaction between rat UNC5H3 and human DAPK.	BIND	15729359
ywhab	GW128 \| HS1 \| KCIP-1	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, beta polypeptide	-	HPRD	12911633
ywhaq	14-3-3 \| 1C5 \| HS1	tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein, theta polypeptide	Affinity Capture-Western	BioGRID	12911633

V.途径注释

Pathway name	Pathway size	＃szgr 2.0基因	Info
KEGG PATHWAYS IN CANCER	328	259	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KEGG BLADDER CANCER	42	33	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID NETRIN PATHWAY	32	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
PID IFNG途径	40	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
凋亡的反应组调节	58	34	该途径中的所有SZGR 2.0基因
REACTOME ROLE OF DCC IN REGULATING APOPTOSIS	10	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组凋亡	148	94	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ONKEN UVEAL MELANOMA UP	783	507	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DAVICIONI MOLECULAR ARMS VS ERMS UP	332	228	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DIAZ CHRONIC MEYLOGENOUS LEUKEMIA UP	1382	904	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 1 DN	242	165	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MULLIGHAN MLL SIGNATURE 2 DN	281	186	该途径中的所有SZGR 2.0基因
JAATINEN HEMATOPOIETIC STEM CELL UP	316	190	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KOKKINAKIS METHIONINE DEPRIVATION 48HR UP	128	95	该途径中的所有SZGR 2.0基因
kokkinakis甲硫氨酸剥夺96小时	117	84	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ENK UV RESPONSE EPIDERMIS UP	293	179	该途径中的所有SZGR 2.0基因
林格伦膀胱癌群集3	329	196	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Vanharanta子宫肌瘤DN	67	45	该途径中的所有SZGR 2.0基因
GRAESSMANN APOPTOSIS BY DOXORUBICIN UP	1142	669	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素的反应	612	367	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WANG ESOPHAGUS CANCER VS NORMAL UP	121	72	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MCBRYAN PUBERTAL BREAST 5 6WK DN	137	97	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal乳房6 7WK UP	197	135	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McBryan Pubertal TGFB1靶向DN	62	44	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TGFB1通过SMAD4 DN的Ramjaun凋亡	8	6	该途径中的所有SZGR 2.0基因
HERNANDEZ MITOTIC ARREST BY DOCETAXEL 1 UP	36	18	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 DN	855	609	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DACOSTA UV RESPONSE VIA ERCC3 COMMON DN	483	336	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARTORIATI MDM4 TARGETS NEUROEPITHELIUM UP	176	111	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Martoriati MDM4靶向胎儿肝	227	137	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TOMLINS PROSTATE CANCER UP	40	27	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHM METHYLATED IN ADULT CANCERS	27	23	该途径中的所有SZGR 2.0基因
OHM EMBRYONIC CARCINOMA UP	6	5	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WU CELL MIGRATION	184	114	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN SILENCED BY TUMOR MICROENVIRONMENT	108	73	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZHANG RESPONSE TO IKK INHIBITOR AND TNF DN	103	64	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 CORRELATED	11	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ROZANOV MMP14 TARGETS UP	266	171	该途径中的所有SZGR 2.0基因
TARTE PLASMA CELL VS PLASMABLAST UP	398	262	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BROCKE APOPTOSIS REVERSED BY IL6	144	98	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLI1融合的Zhang目标	88	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
RADMACHER AML PROGNOSIS	78	52	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Weigel氧化应激反应	35	28	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MURAKAMI UV RESPONSE 6HR UP	37	31	该途径中的所有SZGR 2.0基因
IVANOVA HEMATOPOIESIS STEM CELL AND PROGENITOR	681	420	该途径中的所有SZGR 2.0基因
在胰腺癌中被甲基化沉默的Sato 1	419	273	该途径中的所有SZGR 2.0基因
SARRIO EPITHELIAL MESENCHYMAL TRANSITION DN	154	101	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MARZEC IL2 SIGNALING DN	36	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
riggi ewing肉瘤祖先	430	288	该途径中的所有SZGR 2.0基因
巴索毛毛细胞白血病DN	80	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
mirlet7a3的Brueckner目标	111	69	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VANTVEER BREAST CANCER ESR1 DN	240	153	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Hinata NFKB靶向角质形成细胞DN	23	15	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE RECENT THYMIC EMIGRANT	227	128	该途径中的所有SZGR 2.0基因
McMurray TP53 HRAS合作响应DN	67	46	该途径中的所有SZGR 2.0基因
VALK AML CLUSTER 11	36	24	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KUROKAWA LIVER CANCER EARLY RECURRENCE UP	12	9	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LI PROSTATE CANCER EPIGENETIC	30	22	该途径中的所有SZGR 2.0基因
CAIRO HEPATOBLASTOMA CLASSES DN	210	141	该途径中的所有SZGR 2.0基因
MURAKAMI UV RESPONSE 1HR UP	17	10	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对促性腺营养蛋白DN的反应	87	66	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Sasson对Forskolin DN的反应	88	68	该途径中的所有SZGR 2.0基因
STAMBOLSKY RESPONSE TO VITAMIN D3 DN	26	14	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS UP	217	131	该途径中的所有SZGR 2.0基因
WIERENGA STAT5A TARGETS GROUP1	136	76	该途径中的所有SZGR 2.0基因
BRUINS UVC RESPONSE LATE	1137	655	该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 ETS融合的Miyagawa目标	259	159	该途径中的所有SZGR 2.0基因
DELPUECH FOXO3 TARGETS UP	68	49	该途径中的所有SZGR 2.0基因
LEE BMP2 TARGETS UP	745	475	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KATSANOU ELAVL1 TARGETS UP	169	105	该途径中的所有SZGR 2.0基因
KRIEG HYPOXIA NOT VIA KDM3A	770	480	该途径中的所有SZGR 2.0基因
Holleman泼尼松龙抗性所有DN	11	8	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG TRANSIENTLY UP BY 1ST EGF PULSE ONLY	1839年	928	该途径中的所有SZGR 2.0基因
ZWANG EGF INTERVAL DN	214	124	该途径中的所有SZGR 2.0基因

基因页：DAPK1