基因页:达斯
概括?
基因 | 1615年 |
象征 | 达斯 |
同义词 | HBSL | ASPRS |
描述 | 天冬氨酸-TRNA合成酶 |
参考 | MIM:603084|HGNC:HGNC:2678|HPRD:04361| |
基因类型 | 蛋白质编码 |
地图位置 | 2q21.3 |
Pascal P值 | 0.794 |
Sherlock P值 | 0.243 |
胎儿β | 0.002 |
主持人 | 小脑 海马 元 |
支持 | COMPOSITESET |
数据源中的基因
基因集名称 | 基因组方法 | 描述 | 信息 |
---|---|---|---|
PMID:cooccur | 高通量文献搜索 | PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。 | |
GSMA_I | 基因组扫描荟萃分析 | PSR:0.023 | |
GSMA_IIA | 基因组扫描荟萃分析(所有样品) | PSR:0.02395 | |
文学 | 高通量文献搜索 | 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 | 点击显示详细信息 |
第一节遗传学和表观遗传学注释
第二节。转录组注释
一般基因表达(GTEX)
![无法使用](http://www.tjghsg.com/bioinfo/SZGR/GeneImg/DARS_DE_GTEx.png)
Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)
脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。
时间变化的基因表达(brainspan)
脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。
大脑区域的顶级共表达基因
前10个积极共表达的基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
CSNK1E | 0.97 | 0.96 |
marcksl1 | 0.97 | 0.88 |
RBM15B | 0.97 | 0.97 |
Smarcb1 | 0.96 | 0.95 |
ZNF282 | 0.96 | 0.97 |
Trim28 | 0.96 | 0.97 |
MTA2 | 0.96 | 0.92 |
AKT1 | 0.96 | 0.95 |
NUP62 | 0.96 | 0.95 |
ZNF821 | 0.96 | 0.95 |
前10个负共表达基因 | ||
基因 | 皮尔逊的相关性 | 斯皮尔曼的相关性 |
C5orf53 | -0.77 | -0.81 |
HLA-F | -0.77 | -0.80 |
AIFM3 | -0.75 | -0.79 |
S100B | -0.74 | -0.87 |
AF347015.31 | -0.74 | -0.91 |
AF347015.27 | -0.74 | -0.91 |
aldoc | -0.74 | -0.72 |
MT-CO2 | -0.73 | -0.92 |
AF347015.33 | -0.73 | -0.90 |
TSC22D4 | -0.73 | -0.79 |
第三节。基因本体论注释
分子功能 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
---|---|---|---|---|
去:0000166 | 核苷酸结合 | IEA | - | |
去:0004046 | 氨基酶活性 | 塔斯 | 8449960 | |
去:0003676 | 核酸结合 | IEA | - | |
去:0005515 | 蛋白质结合 | IPI | 17220478 | |
去:0005524 | ATP结合 | IEA | - | |
去:0004815 | 天冬氨酸-TRNA连接酶活性 | 塔斯 | 8449960 | |
GO:0016874 | 连接酶活性 | IEA | - | |
生物过程 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0006422 | 天冬氨酸-TRNA氨基酰化 | 塔斯 | 8449960 | |
去:0006461 | 蛋白质复合物组件 | 塔斯 | 8449960 | |
细胞分量 | 去学期 | 证据 | 神经关键字 | PubMed ID |
去:0005625 | 可溶性部分 | 塔斯 | 8449960 | |
去:0005737 | 细胞质 | 塔斯 | 8449960 |
V.途径注释
路径名 | 路径大小 | #szgr 2.0基因 | 信息 |
---|---|---|---|
kegg氨基酰基tRNA生物合成 | 41 | 33 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
反应组胞质tRNA氨基酰化 | 24 | 19 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Reactome tRNA氨基酰化 | 42 | 34 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Gary CD5目标 | 473 | 314 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
迪亚兹慢性巨态性白血病 | 1382 | 904 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
莱茵所有糖皮质激素治疗DN | 362 | 238 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
UDayakumar Med1靶向 | 135 | 82 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 | 1278 | 748 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Kim WT1靶向8小时 | 164 | 122 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
多德鼻咽癌DN | 1375 | 806 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿霉素DN的Graessmann凋亡 | 1781年 | 1082 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 | 770 | 415 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
tomida转移DN | 18 | 11 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
HU血管生成DN | 37 | 25 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Schlosser MYC靶向血清抑制 | 159 | 93 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 | 479 | 299 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA BRCA1 PCC网络 | 1652 | 1023 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pujana ATM PCC网络 | 1442 | 892 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
PUJANA CHEK2 PCC网络 | 779 | 480 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Magrangeas多发性骨髓瘤IgG与IgA | 22 | 12 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 | 172 | 107 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病初期 | 390 | 242 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏病dn | 1237 | 837 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
阿尔茨海默氏症疾病 | 1691年 | 1088 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
由Foxp3绑定的Marson未刺激 | 1229 | 713 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Massarweh他莫昔芬抵抗DN | 258 | 160 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
LIN NPAS4靶向 | 163 | 100 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
王肿瘤的侵入性DN | 210 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
李最近的胸腺移民 | 227 | 128 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Shedden肺癌的生存率差A6 | 456 | 285 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Yagi AML带8 21易位 | 368 | 247 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
开罗肝母细胞瘤上课 | 605 | 377 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Pilon KLF1靶向DN | 1972年 | 1213 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
Fortschegger PHF8靶向DN | 784 | 464 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 | 151 | 86 | 该途径中的所有SZGR 2.0基因 |
第六节。microRNA注释
mirna家族 | 目标位置 | mirna id | mirna seq | ||
---|---|---|---|---|---|
UTR开始 | UTR结束 | 匹配方法 | |||
mir-384 | 246 | 252 | 1a | HSA-MIR-384 | auuccuagaaauuguucaua |