概括
基因 1615年
象征 达斯
同义词 HBSL | ASPRS
描述 天冬氨酸-TRNA合成酶
参考 MIM:603084|HGNC:HGNC:2678|HPRD:04361|
基因类型 蛋白质编码
地图位置 2q21.3
Pascal P值 0.794
Sherlock P值 0.243
胎儿β 0.002
主持人 小脑
海马
支持 COMPOSITESET

数据源中的基因
基因集名称 基因组方法 描述 信息
PMID:cooccur 高通量文献搜索 PubMed中的系统搜索与SCZ关键字共发生的基因。总共包括3027个基因。
GSMA_I 基因组扫描荟萃分析 PSR:0.023
GSMA_IIA 基因组扫描荟萃分析(所有样品) PSR:0.02395
文学 高通量文献搜索 与精神分裂症关键词共同存在:精神分裂症,精神分裂症,精神分裂症 点击显示详细信息

第一节遗传学和表观遗传学注释


第二节。转录组注释

一般基因表达(GTEX)

无法使用

Devlopment期间的基因表达(BrainCloud)

脚注:
总共绘制了269个时间点,n = 38个胎儿样品(x = 1:38)。每个三角形代表一个时间点。

时间变化的基因表达(brainspan)

脚注:
SC:亚皮质区域;SM:感觉运动区域;FC:额叶皮层;和TP:颞顶皮层
ST1:胎儿(13-26个概念后周),ST2:婴儿早期至童年(4个月至11年)和ST3:青春期至成年期(13-23年)
所示的栏表示表达分布的较低25%和上层25%。

大脑区域的顶级共表达基因

前10个积极共表达的基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
CSNK1E 0.97 0.96
marcksl1 0.97 0.88
RBM15B 0.97 0.97
Smarcb1 0.96 0.95
ZNF282 0.96 0.97
Trim28 0.96 0.97
MTA2 0.96 0.92
AKT1 0.96 0.95
NUP62 0.96 0.95
ZNF821 0.96 0.95
前10个负共表达基因
基因 皮尔逊的相关性 斯皮尔曼的相关性
C5orf53 -0.77 -0.81
HLA-F -0.77 -0.80
AIFM3 -0.75 -0.79
S100B -0.74 -0.87
AF347015.31 -0.74 -0.91
AF347015.27 -0.74 -0.91
aldoc -0.74 -0.72
MT-CO2 -0.73 -0.92
AF347015.33 -0.73 -0.90
TSC22D4 -0.73 -0.79

第三节。基因本体论注释

分子功能 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0000166 核苷酸结合 IEA -
去:0004046 氨基酶活性 塔斯 8449960
去:0003676 核酸结合 IEA -
去:0005515 蛋白质结合 IPI 17220478
去:0005524 ATP结合 IEA -
去:0004815 天冬氨酸-TRNA连接酶活性 塔斯 8449960
GO:0016874 连接酶活性 IEA -
生物过程 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0006422 天冬氨酸-TRNA氨基酰化 塔斯 8449960
去:0006461 蛋白质复合物组件 塔斯 8449960
细胞分量 去学期 证据 神经关键字 PubMed ID
去:0005625 可溶性部分 塔斯 8449960
去:0005737 细胞质 塔斯 8449960

V.途径注释

路径名 路径大小 #szgr 2.0基因 信息
kegg氨基酰基tRNA生物合成 41 33 该途径中的所有SZGR 2.0基因
反应组胞质tRNA氨基酰化 24 19 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Reactome tRNA氨基酰化 42 34 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Gary CD5目标 473 314 该途径中的所有SZGR 2.0基因
迪亚兹慢性巨态性白血病 1382 904 该途径中的所有SZGR 2.0基因
莱茵所有糖皮质激素治疗DN 362 238 该途径中的所有SZGR 2.0基因
UDayakumar Med1靶向 135 82 该途径中的所有SZGR 2.0基因
EWSR1 FLII融合的Kinsey目标 1278 748 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Kim WT1靶向8小时 164 122 该途径中的所有SZGR 2.0基因
多德鼻咽癌DN 1375 806 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿霉素DN的Graessmann凋亡 1781年 1082 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Graessmann对MC和阿霉素DN的反应 770 415 该途径中的所有SZGR 2.0基因
tomida转移DN 18 11 该途径中的所有SZGR 2.0基因
HU血管生成DN 37 25 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Schlosser MYC靶向血清抑制 159 93 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Spielman淋巴细胞欧洲vs亚洲 479 299 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA BRCA1 PCC网络 1652 1023 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pujana ATM PCC网络 1442 892 该途径中的所有SZGR 2.0基因
PUJANA CHEK2 PCC网络 779 480 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Magrangeas多发性骨髓瘤IgG与IgA 22 12 该途径中的所有SZGR 2.0基因
TACI DN的Moreaux多发性骨髓瘤 172 107 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病初期 390 242 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏病dn 1237 837 该途径中的所有SZGR 2.0基因
阿尔茨海默氏症疾病 1691年 1088 该途径中的所有SZGR 2.0基因
由Foxp3绑定的Marson未刺激 1229 713 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Massarweh他莫昔芬抵抗DN 258 160 该途径中的所有SZGR 2.0基因
LIN NPAS4靶向 163 100 该途径中的所有SZGR 2.0基因
王肿瘤的侵入性DN 210 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
李最近的胸腺移民 227 128 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Shedden肺癌的生存率差A6 456 285 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Yagi AML带8 21易位 368 247 该途径中的所有SZGR 2.0基因
开罗肝母细胞瘤上课 605 377 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Pilon KLF1靶向DN 1972年 1213 该途径中的所有SZGR 2.0基因
Fortschegger PHF8靶向DN 784 464 该途径中的所有SZGR 2.0基因
BOSCO过敏原诱导TH2相关模块 151 86 该途径中的所有SZGR 2.0基因

第六节。microRNA注释

mirna家族 目标位置 mirna id mirna seq
UTR开始 UTR结束 匹配方法
mir-384 246 252 1a HSA-MIR-384 auuccuagaaauuguucaua